| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 1277582 = | 269 (1.020) | 169 (0.650) +C |
106/298 | 4.5 | 39.9% | intergenic (+51/+187) | RPPX_05635/RPPX_05640 | aldehyde dehydrogenase/mechanosensitive ion channel protein MscS |
| ? | CP009974 | 4286484 = | 243 (0.920) | intergenic (+340/+304) | RPPX_19070/RPPX_19075 | LacI family transcriptional regulator/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
GGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1277721‑1277582‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTC > CP009974/4286484‑4286632 | GGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAA < 1:1079721/151‑1 GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG < 1:13982/151‑1 GCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACCCCGGAGGTTGGACGCAGGCCGCCGTGGAAGCGCGGGTTCACCCGCGGAAGG > 2:2638498/1‑151 CGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGC < 2:1032722/151‑1 GGCCCTGCGGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCC < 2:684737/151‑1 GCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCgg > 1:4025949/1‑149 GCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCG < 1:2803968/151‑1 CCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGC < 1:11456/151‑1 CCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGC > 1:558932/1‑151 CCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGC < 2:2614482/151‑1 CTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCC > 1:4172323/1‑151 TGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGGTCACCCGCGACAGGGCCGGCCC > 1:2281210/1‑151 CTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTG < 2:4241364/151‑1 TGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGC < 2:3337207/151‑1 TGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGCTCACCCGCGAAGGCGCCGGCCCTGC > 2:2723961/1‑151 GGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCT < 2:5075135/151‑1 CAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGC > 1:3680470/1‑151 ATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGGCCGGCCCGGCCGGCCA > 2:542404/1‑151 CCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCT < 1:1084466/151‑1 CACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTC < 1:3580307/151‑1 ACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGGAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGGAAGGGCCGCCCCCGCTGGCCAAaccac > 2:4981928/1‑146 ACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCC < 1:1275205/151‑1 CGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACC < 1:1354992/151‑1 CCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGTGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCG < 1:3943802/151‑1 GTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCC < 2:3492916/151‑1 GTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCC > 1:2744396/1‑151 TTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCc > 2:832523/1‑150 TTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGCTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCgg > 2:1541573/1‑149 TCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGAGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGT > 1:2672879/1‑151 ACCTTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTC < 2:3588231/151‑1 ACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTC > 2:5217005/1‑151 CGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCtc > 1:2071501/1‑149 gcTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGCACTCCCGCGCTTGCGCGGACGGGTTGTGGACACACCCCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACC < 1:2651336/149‑1 GTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACC < 1:4803780/151‑1 TGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGT > 1:521441/1‑151 TGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGT > 1:1408319/1‑151 TGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCCGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCCCCGT > 2:510643/1‑151 GCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAACCCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTT < 1:2230846/151‑1 GCCGCCGCGACCTTATGCGCGGGTAACCCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTT < 1:4677336/151‑1 CGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAACCCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGC < 1:3787937/151‑1 GCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCC > 2:4474520/1‑151 ccgttACCGTATTCGGGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGCTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCG < 1:715123/146‑1 CCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCG > 1:73993/1‑151 gctACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCC < 1:1856567/148‑1 gctACCGTATGCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCC < 1:597214/148‑1 gcgcgCGTATTCGCGGGTAAACGCGCTCCGGCGCAGATGGTTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCCGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCC < 2:1657701/146‑1 ctACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCG > 1:2918392/3‑151 ctACCGTACGCGCGGGTAACCCCGCTCCTGCGCGGAGGGGTTGTGGACACCCACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCG < 2:780971/149‑1 tACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGC > 2:346727/2‑151 CCGTATTCGCGGGTACGGCCGCTCCGGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGGGGTTGGCCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCg < 2:1170309/151‑2 GTATTCGCGGGGACACCCGCTCCGGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCC < 2:2399046/151‑1 TATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCG > 1:1756588/1‑151 ATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGT < 1:3372910/151‑1 TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGGGCGGGGTCACGCGCGAGAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTc > 2:3920836/1‑150 GCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTAGACACACACCGGAGGCTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTCGCCGCCGCCGCCGTGTTC > 1:3407961/1‑151 CGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCG > 1:144503/1‑151 GGGTAACCCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGC < 1:924350/151‑1 GGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGC < 1:1892909/151‑1 TAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGG < 1:3141177/151‑1 TAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGG < 1:3069998/151‑1 acCCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTA < 1:1253171/149‑1 AACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGTGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTA > 1:3247237/1‑151 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> 1:4480063/1‑151 GATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACA > 1:1831938/1‑151 atgGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAG < 1:5081094/148‑1 atgGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTACACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGAATTCGCGGCAAAACCAGCTCCTACACAc > 2:790484/4‑150 tgggttGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGA > 2:5196482/7‑151 tgGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGA < 1:3542078/149‑1 gggttGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAT < 1:4272879/146‑1 GGTTGTGGACGCACACCGGGGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATt < 2:1443817/151‑2 ttGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGG < 1:231967/149‑1 tGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGT > 1:4355514/2‑151 GACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTG > 2:2196536/1‑151 TCGGTGGTTGGACACAGGCCGTC‑‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTC < 1:4892779/151‑1 ggaGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACAcctc > 1:5091962/4‑147 tGGTTGGACACAGGCCGTC‑‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACCCAGGTCGGTG > 1:4911990/2‑151 tGGTTGGACACAGGCCGTC‑‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCCGTGGTGAACACAGGTCGGTG > 1:5043852/2‑151 GGGTTGGACAAGGGCCGTC‑‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTG < 2:1798764/151‑1 TTGGACACAGGCCGTC‑‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTT < 1:4267642/151‑1 ACAGGCCGTC‑‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGGTGGACAC > 1:2929390/1‑151 CAGGCCGTC‑‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACA < 1:4559554/151‑1 gtcGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGACCGGTGGTGGACCAAGGTCGGTGGTAGGACACAGCCCGc > 2:1006945/4‑150 gtcGTAGGAGCGGGTCCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGT < 1:3329274/148‑1 GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGATCCGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGTCGT > 2:2373582/1‑151 GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCCCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAAGTCGGCGGTTGGACACAGGCCGTCGg > 2:2373567/1‑150 GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGA < 1:3086200/120‑1 AGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGTCGTAG > 1:802130/1‑151 gggGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGTCGTAGG < 1:3251304/148‑1 AGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGTCGTAGGAG < 1:1507311/151‑1 AGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCCGTGGTGGGCACAGGGCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTCGGAG > 2:5074411/1‑151 GCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCTCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCCGTGGTTGACACAGGTCCGTGGTTGGACCCAGTCCGCCGTAGGAGC > 2:2024802/1‑151 GCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGTCGTAGGAGC < 2:2831697/151‑1 GGGTTCACCCGCGAAAAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTG < 1:213841/59‑1 TTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTT < 1:1968296/151‑1 TCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTC < 2:2919210/151‑1 | GGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1277721‑1277582‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTC > CP009974/4286484‑4286632 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |