| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | = 3756977 | 242 (0.920) | 156 (0.780) +GCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTT |
92/230 | 2.6 | 47.6% | coding (1128/1347 nt) | RPPX_16780 | phospho‑2‑dehydro‑3‑deoxyheptonate aldolase |
| ? | CP009974 | 4030905 = | 206 (0.780) | intergenic (+47/‑737) | RPPX_17905/RPPX_17915 | 23S rRNA methyltransferase/sulfurtransferase | |||||
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
GCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009974/3756864‑3756977‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGACGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGTGCAGGGCTTGCGAAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCC > CP009974/4030905‑4031023 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| gcgaatTCGGTGACCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGC < 1:238771/145‑1 cgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCT > 2:3856539/6‑151 cgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCT < 2:3912183/146‑1 cgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCT > 2:1975721/6‑151 gaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTT > 2:2467704/5‑151 gaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTT < 1:2653369/147‑1 gaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTT < 2:537954/147‑1 gaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTT > 2:811435/5‑151 gaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTT > 1:4129672/5‑151 aatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTT < 2:301302/148‑1 aatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTT < 2:2339549/148‑1 aatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTT > 2:2419338/4‑151 atTCGGTGGTCGGGC‑GGCACCGGCGATGCGTTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTT < 2:797233/149‑1 tTCGGTGGTCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTG < 2:1767474/150‑1 tTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTG < 1:1172325/150‑1 tTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTG < 1:252093/150‑1 tTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTG < 1:2837335/150‑1 TCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGC < 1:2616641/151‑1 gGGTGAGCGGCA‑GGCACCGCCGATGAATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCGTCTGGATAAGGATGTCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCT < 2:2116366/150‑1 CGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCT > 2:3434337/1‑151 GGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTT > 2:1036699/1‑151 GGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTT > 1:3610635/1‑151 TGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCT > 2:2090183/1‑151 TGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCT > 2:598912/1‑151 GATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTA < 2:1166900/151‑1 ATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAA < 2:877107/151‑1 ATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAA < 1:797021/151‑1 TCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAG < 1:1919380/151‑1 ggccGGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCG < 1:3271352/147‑1 ggccGGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCG < 1:4398705/147‑1 gccGGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGC < 1:3665225/148‑1 cGGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGC > 2:2566614/2‑151 cGGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTGGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGC > 2:3662879/2‑151 GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCG < 1:125839/151‑1 GCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGG > 1:3295081/1‑151 ACCGCCTATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTA > 1:456812/1‑151 CCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAG < 2:2932868/151‑1 CCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAG < 2:2213424/151‑1 CGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGT > 1:1585502/1‑151 GCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTT < 1:3856539/151‑1 GCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTT > 2:664697/1‑151 CCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTC > 2:4079584/1‑151 TGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGC < 2:918441/151‑1 TGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGC < 1:1786923/151‑1 CATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGA < 1:4224809/151‑1 ATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGAt > 1:2202898/1‑150 ATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGAt < 2:4217921/151‑2 TTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGAtg > 2:1307427/1‑149 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> 2:4494206/1‑151 GATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGC > 2:2072646/1‑151 GATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCATGGTGTGCCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGC < 2:1634142/151‑1 TATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTCTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGCTT < 1:2807343/151‑1 TCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGCTTGC > 1:938285/1‑151 TCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGCTTGC > 1:938189/1‑151 CGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGCTTGCG > 2:1761203/1‑151 CGCCGGCATAGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTCCAGGACGCCGAGCGCAGGGCTCGCG > 2:2543011/1‑151 GCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGCTTGCGg > 2:503630/1‑150 CATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCACGGCTTGCGGAGGGA > 1:2090581/1‑151 GCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGCTTGCGGAGGGAGGTG < 2:168641/151‑1 TGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGCTTGCGGAGGGAGGTGAC > 1:3932823/1‑151 CCCTCGGCCGGGGGTACCGGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCGCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGCTTGCGGAGGGAGGTGACGG < 1:2356314/151‑1 CTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGC > 2:2106319/1‑151 GGCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATG > 1:3375608/1‑151 GCCTGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGG > 2:2775786/1‑151 TGGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATG > 1:1031949/1‑151 GGTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGC > 1:1875986/1‑151 GTGTACCTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCC > 2:1751364/1‑151 accTGGAAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTC < 1:1008347/148‑1 AAGAACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGC < 2:3807940/149‑1 AACGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGg < 2:3782713/151‑2 CTTGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCTGGCGATGCAGATTGCGAGTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGGTTGCGGAGGGAGGGGACGGGCATGGATGCCCGGCAAGCGCTGGGGCtcg > 1:3419376/1‑148 CTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATc > 2:4724413/1‑115 CTCTTGCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATc < 1:4724413/116‑2 GCTCTTGCTTTGGATTTTGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGATGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGCGCAGGGCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATccatg > 1:991440/1‑110 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| GCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009974/3756864‑3756977‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCTTTTGCTTCTAAGCGCGCGGTAGTTCAGGCGACGCAGATTGCGACTTCAGGAGGCCGAGTGCAGGGCTTGCGAAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCC > CP009974/4030905‑4031023 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |