New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009974 | = 5273058 | 0 (0.000) | 240 (0.960) | 144/286 | 0.6 | 100% | intergenic (‑275/+106) | RPPX_23445/RPPX_23450 | transporter/ATPase AAA |
? | CP009974 | 5275662 = | 0 (0.000) | coding (38/1266 nt) | RPPX_23460 | GntR family transcriptional regulator |
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
GCGATGAAACGGGACGGAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009974/5272902‑5273058 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcctatgAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCCAGTCTCTTGAC > CP009974/5275662‑5275810 GCGATGAAACGGGACGGAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGG < 1:2726650/151‑1 ATGAAACGGGACGGAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCT < 2:4920088/151‑1 TGAAACGGGACGGAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTA > 2:2442138/1‑151 GAAACGGGACGGAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTAT < 1:1409511/151‑1 GAAACGGGACGGAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTAT > 2:651502/1‑151 GGGACGGAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAG > 1:2219141/1‑151 GGAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGTGGCCTATGAAAGGTTGA > 1:1127326/1‑151 GGAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGA > 2:1532655/1‑151 GGAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGA > 2:4869357/1‑151 GAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGAT < 1:3380998/151‑1 GAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGAT > 1:2039454/1‑151 CGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGC > 2:157596/1‑151 ATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGG > 1:2477758/1‑151 TCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAGCCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGT < 2:427239/151‑1 TCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGT < 2:2249065/151‑1 ACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTAC > 1:2050504/1‑151 TGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTC < 2:1449723/151‑1 TGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTC < 2:2039454/151‑1 TCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAA > 1:829503/1‑151 GGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCT > 1:2629525/1‑151 GGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTC > 1:729083/1‑151 AAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCC > 1:2351728/1‑151 ATCCAGTGGCGGATCGCCTCTCGAACCTACCCACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGGGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTG < 1:4404746/151‑1 ATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTG > 1:1625848/1‑151 ATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTG < 1:1061519/151‑1 CCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGC < 2:5194746/151‑1 CAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCT > 2:3032255/1‑151 CAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCT < 2:4181109/151‑1 CAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCT > 1:1905152/1‑151 GTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCC > 2:5058558/1‑151 GTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGCCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTACGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGCCCTGGCCCC > 1:2965359/1‑151 CGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGG < 1:5017165/151‑1 GCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGC > 1:3333291/1‑151 GCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGC > 2:1047260/1‑151 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> 2:4429620/1‑151 AAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTATGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTA > 1:422513/1‑151 AAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTA < 1:525496/151‑1 AAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTA > 2:1144723/1‑151 AGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTAC < 2:3895513/151‑1 GAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACT > 1:2880865/1‑151 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CATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAA < 1:1862919/151‑1 TGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGT < 1:762333/151‑1 GCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTG < 1:311342/151‑1 CAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGG > 2:4035193/1‑151 CAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGG < 2:1840467/151‑1 AGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGA < 2:2174213/151‑1 GGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGAC > 1:5074768/1‑151 TGTTGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCC < 2:1207150/151‑1 CTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGAT > 2:4941228/1‑151 TACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATC < 2:3807429/151‑1 CGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTC < 2:41017/151‑1 CGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTC > 1:4026167/1‑151 CGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTC > 2:2920942/1‑151 GGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCG < 1:604116/151‑1 CTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCC < 2:4742970/151‑1 TTGAGGCCTATGAAAGGGTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCCA < 2:4849303/151‑1 TGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCCAG < 1:4150635/151‑1 TGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCCAG < 2:5074768/151‑1 TGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCCAG > 2:2125986/1‑151 TGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCCAG > 2:3296335/1‑151 TGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGGTGTAGATCTCGCtggtc > 2:4629499/1‑146 GAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTCTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCCCCGAACTCGGCCCCACGCCTGATCGGGCAGCGGACCCGATGTGGCTCTCGCCCCcgc > 2:1742187/1‑148 AGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCCAGTC > 1:2281810/1‑151 CCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCCAGTCTCT < 1:4679845/151‑1 CTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCCAGTCTCTT > 1:873368/1‑151 CTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCCAGTCTCTT > 2:5155816/1‑151 ATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCCAGTCTCTTGA < 2:2629525/151‑1 ATGAAAGGTTGATGGCTGAGGCTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCCAGTCTCTTGA < 2:3591193/151‑1 GCGATGAAACGGGACGGAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009974/5272902‑5273058 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcctatgAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCCAGTCTCTTGAC > CP009974/5275662‑5275810 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |