| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP009974 | = 1897294 | NA (NA) | 854 (3.360) | 211/290 | 0.0 | 98.2% | intergenic (‑5072/‑3525) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein |
| ? | CP009974 | 1897952 = | 16 (0.060) | intergenic (‑5730/‑2867) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 763 total aligned reads displayed.
GGTTGCAGTCGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTGACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGACGGCCTGCCGATCAACAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGACGGCACCACCGTCGTCGTGGCAGCCAACAGCACCACCGGTTCG > CP009974/1897150‑1897438 | ggTTGCAGTCGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAAGTGATCTCGCCGCCTTCGGTg > 1:4392015/1‑151 (MQ=11)ggTTGCAGTCGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACAACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAAGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCACCGCCTTCGGTg > 1:90380/1‑151 (MQ=255)agTTGCAGTCGCCGAGCCCGTGGTGCTGTTCGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTg > 1:4108170/2‑151 (MQ=2) ttGCAGTGGCCGAACCGTTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTGAC > 1:1331324‑M1/1‑151 (MQ=255) ttGCAGTCGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAAGTGATCTCGCCGCCTTCGGTGAC > 2:4891940‑M1/1‑151 (MQ=255) tGCAGTCGCCGAACCCGTGGTGCTGTTGGCCGCCACGACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTAAAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCACCGCCTTCGGTGACC > 2:2672529‑M1/1‑151 (MQ=255) tGCAGTCGCCGAACCCGTGGTGCTGTTGGCCGCCACGACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTAAAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCACCGCCTTCGGTGACC < 2:3676727‑M1/151‑1 (MQ=255) gTCGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCTGGGTGATGGTGTAAGTGATCTCGCCGCCTTCGGTGGCCGacg > 2:2419454/1‑149 (MQ=11) tCGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACAACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAAGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCACCGCCTTCGGTGACCGAAGG > 2:4436465‑M1/1‑151 (MQ=255) 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ccACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTGACGGACGGggtggcagtcagcttggccaccacttc > 1:5087092‑M1/1‑124 (MQ=255) ccACGACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAAGTGATCTCGCCGCCTTCGGTGACCGACGGggtggcggtcagcttggccacgacttc > 2:1206041‑M1/1‑124 (MQ=255) ccACGACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAAGTGATCTCGCCGCCTTCGGTGACCGACGGggtggcggtcagcttggccacgacttc > 1:762143‑M1/1‑124 (MQ=255) ccACGACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAAGTGATCTCGCCGCCTTCGGTGACCGACGGggtggcggtcagcttggccacgacttc < 1:4899156‑M1/151‑28 (MQ=255) cACGACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAAGTGATCTCGCCGCCTTCGGTGACCGACGGggtggcggtcagcttggccacgacttcg < 2:3831836‑M1/151‑29 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |