| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP009974 | = 1897294 | NA (NA) | 854 (3.360) | 211/290 | 0.0 | 98.2% | intergenic (‑5072/‑3525) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein |
| ? | CP009974 | 1897952 = | 16 (0.060) | intergenic (‑5730/‑2867) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 996 total aligned reads displayed.
ACCAGGACGCAGGCCAGATCAGTCTGGGCATCACGTCCGCTGTGGATATAGACGGTCACACCTTTGAGAACCTGGAACTGGGTGGTGCTGCTTCGGTTCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCGTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCTG > CP009974/1897803‑1898102 | gggcggttgcagtggccgaaccggtggtgctgttggctgccacgacgacagtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcaggccgtctttgttggtcagcgtgatggtgtaagtgatctcgccgcctTc > 1:531258‑M2/150‑151 (MQ=255)gggcggttgcagtcgccggaccggtggtgctgttggctgccacaacgacagtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcaagccgtctttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcaccgcctTc < 2:4228534‑M2/2‑1 (MQ=255) ggcggttgcagtcgccgaaccggtggtgctgttggctgccacgacgacagtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcagaccgtctttgttggtcagggtgatggtgtaagtgatctcgccgccgTCg > 2:3884385‑M2/149‑151 (MQ=255) 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ccggtggtgctgttggctgccacgacgacggtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcagaccgtctttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAg > 1:1110177‑M2/130‑151 (MQ=255) cggtggtgctgttggctgccacgacgacagtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcaggccgtctttgttggtcagcgtgatggtgtaagtgatctcgccgcctTAGGTCACCGAAGGGGTGGCGGt < 2:4384944‑M2/23‑1 (MQ=255) ggtggtgctgttggctgccacgacgacggtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcaggccgtctttattggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctTCGGTCACCGACGGGGTGGCAGTc > 1:4770565‑M2/128‑151 (MQ=255) ggtggtgctgttggctgccacgacgacggtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcagaccgtctttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTc > 1:3911765‑M2/128‑151 (MQ=255) tggtgctgttggctgccacgacgacagtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcaggccgtctttgttggtcagcgtgatggtgtaagtgatctcgccgcctTCGGTCACCGAAGGGGTGGCGGTCAg < 2:1457065‑M2/26‑1 (MQ=255) tggtgctgttggctgccacgacgacagtcgtgccgtcggtcagtttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcaggccgtctttggtggtcagcgtgatggtgttagtgatctcgcagcctTCGGTCACCGAAGGGGTGGCGGTCAg < 2:2307789‑M2/26‑1 (MQ=255) ggtgctgttggctgccacgacgacggtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcaggccgtctttgttggtcagcgtgatggtgtaagtgatctcaccgcctTCGGTCACCGAAGGGGTGGCGGTCagt < 1:3384609‑M2/27‑2 (MQ=255) gtgctgttggctgccacgacgacggtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcaggccgtctttattggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctTCGGTCACCGACGGGGTGGCAGTCAGCt > 1:2470733‑M2/124‑151 (MQ=255) gtgctgttggctgccacgacgacggtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttggtgatcggcaggccgtctttattggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctTCGGTCACCGACGGGGTGGCAGTCAGCt < 2:466448‑M2/28‑1 (MQ=255) gctgttggctgccacgacgacggtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcaggccgtctttgttggtcagcgtgatggtgtaagtgatctcaccgcctTCGGTCACCGAAGGGGTGGCGGTCAGTTTg > 2:1911002‑M2/122‑151 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |