| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 1898984 = | 132 (0.500) | 889 (3.570) +CGACTCGG |
261/284 | -0.0 | 83.8% | intergenic (‑6762/‑1835) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein |
| ? | CP009974 | = 1899275 | 232 (0.880) | intergenic (‑7053/‑1544) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 1884 total aligned reads displayed.
GCTTCGATCGTCACGGTGTCGCCGTTCGACAGGGTTACGGTCAACGGACGGTCCAGCGCCTGGCTCACTTTCACAGTAAAGGAAGGTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCG > CP009974/1898834‑1899134 | gcttcaacggtgatggtctggccgttggacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgt < 2:4358910‑M1/1‑1 (MQ=255) ttcaacggtgatgacttggccgttggacagggtcacggttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTg < 1:3189556‑M1/3‑1 (MQ=255) acggtgatggtctggccgttggacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCg < 1:1342809‑M1/7‑1 (MQ=255) acggtgatggtctggccgttggacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCg < 1:4891558‑M1/7‑1 (MQ=255) ggtgatggtctggccgttggacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTg < 1:4264004‑M1/9‑1 (MQ=255) atggtctggccgttggacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTc > 2:124877‑M1/139‑150 (MQ=255) tgacttggccgttggacagggtcacggttaccggcgtctgagcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTg < 1:3086386‑M1/14‑1 (MQ=255) ttggccgttggacagggtcacggttaccggcgtctgagcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑Gcc < 2:1668330‑M1/18‑1 (MQ=255) tggccgttggacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCg < 2:5078258‑M1/19‑1 (MQ=255) ggccgttggacagggtcacggttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCgg > 2:1936260‑M1/132‑151 (MQ=255) gccgttggacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGc > 2:1571512‑M1/131‑151 (MQ=255) gccgttggacagagtaaccgtgaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGc > 1:3020763‑M1/131‑151 (MQ=255) gttggacagagtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTc > 1:1002693‑M1/128‑151 (MQ=255) tggacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCgg < 2:4285861‑M1/26‑1 (MQ=255) acggttaccggcgtctgagcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCa > 1:4579605‑M1/115‑151 (MQ=255) accgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGttcgggggca < 1:2747910‑M1/37‑4 (MQ=255) accgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCa < 2:3188189‑M1/37‑1 (MQ=255) ccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtggaggtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTCGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAg > 2:3086252‑M1/114‑151 (MQ=255) taccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGc < 2:4952230‑M1/42‑1 (MQ=255) ccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTc > 1:4762693‑M1/108‑151 (MQ=255) cggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCg < 1:5021834‑M1/45‑1 (MQ=255) cggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCg < 1:3257111‑M1/45‑1 (MQ=255) ggcgtctgagcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGa < 1:1427069‑M1/46‑1 (MQ=255) cgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGaaa < 2:405780‑M1/48‑1 (MQ=255) gtctgagcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAAt < 1:4091318‑M1/49‑1 (MQ=255) agcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCg < 2:2675796‑M1/54‑1 (MQ=255) agcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCg < 2:1456204‑M1/19‑1 (MQ=255) agcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCg > 1:4941854‑M1/98‑151 (MQ=255) agcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCg > 2:1851637‑M1/98‑151 (MQ=255) gggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTc < 1:4682892‑M1/30‑1 (MQ=255) gttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTg < 1:4355793‑M1/60‑1 (MQ=255) tGGCTCACTTTCACAGTAAAGGAAGGTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGATGACCGTC‑GAGGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTgg > 1:1661697/1‑151 (MQ=11) tCACTTTCACAGTAAAGGAAGGTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGATGACCGTCGAG‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGtt > 2:3386958/1‑151 (MQ=11) cagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGG‑GCCGGCGTCGGGTTGGGGGTCAGTTGCTGGAAATGACCGCCAGTGGCGTtc < 1:3910563‑M1/66‑1 (MQ=255) agggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTtct < 2:365949‑M1/67‑1 (MQ=255) agggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTtct > 1:3419392‑M1/85‑151 (MQ=255) aCTTTCACAGTAAAGGAAGGTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGATGACCGTCGAG‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTtct > 1:2345530/1‑151 (MQ=11) ggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGt < 1:372876‑M1/11‑1 (MQ=255) ggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTc > 1:352254‑M1/83‑118 (MQ=255) ggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtaagggtcgcggaggcggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGG‑GCCGGCGTCGGGTGCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCg < 1:3976725‑M1/69‑1 (MQ=255) ggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCg > 2:1761256‑M1/83‑151 (MQ=255) cacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGata < 2:4614116‑M1/72‑2 (MQ=255) acggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTc < 2:1161696‑M1/30‑1 (MQ=255) acggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCgatag > 1:5189727‑M1/79‑149 (MQ=255) cggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTcgatagt > 2:4443867‑M1/78‑148 (MQ=255) ggtgtaggtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGAt < 1:5120634‑M1/71‑1 (MQ=255) ggtggaggtgatcacgccgccgtcggtgaccgacgggctcgcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTg > 2:3805821‑M1/77‑151 (MQ=255) gTAAAGGAAGGTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGATGACCGTC‑GAGGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGa < 1:912621/151‑1 (MQ=14) tgtaggtgatcgcgccgccttcggtgacggggggggtggccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGAc > 2:3906663‑M1/75‑151 (MQ=255) gtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTAc < 2:2888924‑M1/52‑1 (MQ=255) taggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGc < 2:3488087‑M1/79‑1 (MQ=255) taagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCa > 1:3840149‑M1/73‑109 (MQ=255) aaggaaggTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGATGACCGTC‑GAGGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGc > 1:3604773/1‑151 (MQ=14) aagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGc > 2:4526443‑M1/72‑126 (MQ=255) gtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGa < 1:655762‑M1/82‑1 (MQ=255) gtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGa < 1:3324667‑M1/82‑1 (MQ=255) gtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGa > 2:756067‑M1/70‑151 (MQ=255) aaggTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGATGACCGTC‑GAGGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGAc < 2:2008050/151‑1 (MQ=14) cacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTc > 1:186870‑M1/65‑151 (MQ=255) acgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCg < 2:1366829‑M1/88‑1 (MQ=255) 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1:1183898‑M1/34‑77 (MQ=255) cagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTc < 2:3558365‑M1/120‑1 (MQ=255) gggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTg > 1:2233766‑M1/30‑151 (MQ=255) ggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTgg > 1:1582061‑M1/29‑151 (MQ=255) tggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAAc < 1:1291411‑M1/131‑1 (MQ=255) cGGCATCGATGCTGTCATTGATGACCGTC‑GAGGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGCGTCTGGAAATCGACGCt < 2:90893/151‑1 (MQ=25) gcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGc > 1:2941234‑M1/16‑151 (MQ=255) gCATGGATGCTGTCATTGATGACCGTCGAG‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGCGTCTGGAAATCGACGCTGc < 2:2589032/151‑1 (MQ=25) cgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAg < 2:4875131‑M1/90‑1 (MQ=255) gtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGccc < 1:4417580‑M1/138‑1 (MQ=255) tCGATGCTGTCATTGATGACCGTC‑GAGGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGCGTCTGGAAATCGACGCTGCCCt < 2:2391261/151‑1 (MQ=37) gaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGc > 2:2136688‑M1/11‑123 (MQ=255) gaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGa > 1:4845197‑M1/11‑92 (MQ=255) gATGCTGTCATTGATGACCGTCGAG‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGCGTCTGGAAATCGACGCTGCCCTgg < 2:2252255/151‑1 (MQ=37) cgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCGAAGTTGCCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTc > 1:1107146‑M1/8‑94 (MQ=255) gagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTAcc > 1:246935‑M1/7‑59 (MQ=255) gagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGttt < 1:2835583‑M1/145‑1 (MQ=255) tcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTg < 2:5134805‑M1/60‑1 (MQ=255) tcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCg < 2:547465‑M1/88‑1 (MQ=255) tcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCg > 1:547465‑M1/4‑91 (MQ=255) gTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTGGGTTTTAc > 2:3245485‑M1/2‑149 (MQ=255) gTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTAccc > 1:2568934‑M1/2‑151 (MQ=255) | GCTTCGATCGTCACGGTGTCGCCGTTCGACAGGGTTACGGTCAACGGACGGTCCAGCGCCTGGCTCACTTTCACAGTAAAGGAAGGTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCG > CP009974/1898834‑1899134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |