| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 1898984 = | 132 (0.500) | 889 (3.570) +CGACTCGG |
261/284 | -0.0 | 83.8% | intergenic (‑6762/‑1835) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein |
| ? | CP009974 | = 1899275 | 232 (0.880) | intergenic (‑7053/‑1544) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 1192 total aligned reads displayed.
GTTTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCCCACCACCTCCGGTACTACCTGTCACGGTGGCCGAAATCTGGCCCCCGTCGATGTAGGGTGTGTCGTTTGCCGGAACTGCGACGTTGACGCTACCAC > CP009974/1899125‑1899425 | gTTTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGa > 1:1771166/1‑151 (MQ=255) ttttACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGAGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAc > 2:856371‑M2/1‑150 (MQ=255) tttACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAcc > 1:4913699‑M2/1‑149 (MQ=255) tttACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAcc > 1:3497144‑M2/1‑149 (MQ=255) ttACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccg > 1:1178780‑M2/1‑148 (MQ=255) gccggCTTCAACGGTAATGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTa > 2:3308634/5‑151 (MQ=255) gCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgt < 2:911517‑M2/151‑10 (MQ=255) cAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTGAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgat > 1:962691‑M2/1‑138 (MQ=255) cAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGAGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgat < 1:1615529‑M2/151‑14 (MQ=255) aCGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcg < 1:1342809‑M2/151‑16 (MQ=255) ggTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtg < 2:1107908‑M2/151‑18 (MQ=255) taaTGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGt < 2:580696/149‑1 (MQ=255) tGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGCGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggt < 1:2373635‑M2/151‑20 (MQ=255) gATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtc < 1:2844518‑M2/151‑21 (MQ=255) aTGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTaa < 1:48534/151‑1 (MQ=255) aTGGTCTGGCCGTTGGACAGAGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtct > 2:2009247‑M2/1‑130 (MQ=255) ggTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctga < 1:2007330‑M2/151‑24 (MQ=255) gTCTGGCCGTTGGACAGAGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgag > 1:1680003‑M2/1‑127 (MQ=255) ttGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCt < 2:5191682/150‑1 (MQ=255) tGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccg < 2:5078258‑M2/151‑28 (MQ=255) tGGCCGTTGGACAGAGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccg < 2:3420515‑M2/151‑28 (MQ=255) gTTGGACAGAGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtc > 1:1002693‑M2/1‑119 (MQ=255) tGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgg < 2:4291693‑M2/151‑35 (MQ=255) cAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttc < 2:3244048‑M2/151‑39 (MQ=255) cAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttc > 1:2704341‑M2/1‑113 (MQ=255) gagtaACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcgg > 1:1884853‑M2/3‑111 (MQ=255) gTTACCGTTAACGGCGGGTGAGGAGCGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGGTCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgggccggcgtcgggttcgggg > 2:1776775‑M2/1‑109 (MQ=255) aaCCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTGACGGTCGGCGTGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtc > 1:2946736‑M2/1‑107 (MQ=255) ggTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGGCAGGGTCGCAGTGGGGGTGTCGAGTGTATCGGTCACCTGGGGAACCGCTGGCGTTTGCGGCAGTGGCAcc > 2:1359604/2‑151 (MQ=255) tACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgc < 1:2118339‑M2/151‑51 (MQ=255) cGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCcca < 1:3099188/151‑1 (MQ=255) cGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCcca < 2:4477441/151‑1 (MQ=255) cTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaatta < 1:2498630‑M2/151‑60 (MQ=255) tGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattac > 1:1922564‑M2/1‑91 (MQ=255) tGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCCcaccac > 2:2375433/1‑151 (MQ=255) cAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCCCACCACCTcc < 2:4660292/151‑1 (MQ=255) aGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCACGCCGTCAGGGGCGCGGTGGTGGCGTCGACTGTATCGTTCACCGTGGTCGCCGCCGGCGTCGGCTGCAATGTCACCTCCACCCCACCCCCTCCg > 2:1563446/1‑151 (MQ=255) gggTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccag < 1:3353456‑M2/151‑67 (MQ=255) gTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtg > 1:3666717‑M2/1‑83 (MQ=255) gTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtg < 1:4971384‑M2/151‑69 (MQ=255) gTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtca < 1:4455593‑M2/128‑46 (MQ=255) cTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgt < 1:3422660‑M2/151‑73 (MQ=255) cAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttc > 2:4765188‑M2/1‑77 (MQ=255) aGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttct < 2:658119‑M2/151‑76 (MQ=255) aGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttct > 2:2498630‑M2/1‑76 (MQ=255) tCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagcggcgttctcgat > 1:5078258‑M2/1‑72 (MQ=255) cACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgata > 2:1467060‑M2/1‑71 (MQ=255) cACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgatg > 2:1225254‑M2/1‑71 (MQ=255) aCGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccag < 2:2232936‑M2/136‑67 (MQ=255) ggTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgat > 2:5120634‑M2/1‑68 (MQ=255) gtgtAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgatagtga < 2:4044920‑M2/151‑85 (MQ=255) aaGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagtt < 1:3841082‑M2/111‑49 (MQ=255) gTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgatagtgacgctga > 2:1670281‑M2/1‑61 (MQ=255) 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1:4201544‑M2/2‑26 (MQ=255) gTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagcggcgttctcgatgg > 1:278165‑M2/1‑25 (MQ=255) tCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagcggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgaaccgttgttgtagacgtcattggccggggt > 1:3576267‑M2/1‑24 (MQ=255) cAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagcggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgaaccgttgttgtagacgtcattggccggggtc > 2:3070947‑M2/1‑23 (MQ=255) gggTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagctgctcgaagttgccgcccgtggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgagccgttgttatagacgtcattggccggggtctg < 1:1277198‑M2/151‑131 (MQ=255) ggTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggt < 2:4377218‑M2/56‑37 (MQ=255) gTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgatagtgacgctgacggtcgagccgtt < 1:3182713‑M2/122‑104 (MQ=255) tCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCCCACCACCTCCGGTACTACCTGTCACGGTGGCCGAAATCTGGCCCCCGTCGATGTAGGGTGTGTCGTTTGCCGGAACTGc > 1:5221782/1‑151 (MQ=255) cgcgGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagctgctcgaagttgccgcccgtggcgttctcgatg > 1:4508629‑M2/1‑17 (MQ=255) gcgGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagcggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgaaccgttgttgtagacgtcattg > 2:268160‑M2/1‑16 (MQ=255) gggggtggtGTCGCccgagtcgttggtcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagcggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgaaccgttgttgtagacgtcattggccggggtctggaagtca > 2:4968754‑M2/1‑14 (MQ=255) ggtggtgTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaat > 1:4076375‑M2/1‑11 (MQ=255) tggtgTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagctgctcgaagttgccgcccgtggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgagccgttgttatagacgtcattggccggggtctggaaatcaacgct > 2:1885197‑M2/1‑9 (MQ=255) tggtgTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCCCACCACCTCCGGTACTACCTGTCACGGTGGCCGAAATCTGGCCCCCGTCGATGTAGGGTGTGTCGTTTGCCGGAACTGCGACGTTGAc < 1:4354464/151‑1 (MQ=255) ggtgTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagcggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgaaccgttgttgtagacgtcattggccggggtctggaagtcaacgctg > 2:3659407‑M2/1‑8 (MQ=255) ggtgTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCCCACCACCTCCGGTACTACCTGTCACGGTGGCCGAAATCTGGCCCCCGTCGATGTAGGGTGTGTCGTTTGCCGGAACTGCGACGTTGACg < 2:3788984/151‑1 (MQ=255) tgtCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagcggcgttctcgatggtgac < 1:877158‑M2/91‑86 (MQ=255) gtCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagcggcgttctcgatggtgac > 1:1535798‑M2/1‑5 (MQ=255) gtCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCCCACCACCTCCGGTACTACCTGTCACGGTGGCCGAAATCTGGCCCCCGTCGATGTAGGGTGTGTCGTTTGCCGGAACTGCGACGTTGACGCTa > 2:2889616/1‑151 (MQ=255) tCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagcggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgaaccgttgttgtagacgtcattggccggggtctggaagtcaacgctgccct < 1:610331‑M2/151‑148 (MQ=255) cGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgaaccgttgttgtagacgtcattgcccggggtctggaattcaacgctgccctg > 2:763455‑M2/1‑3 (MQ=255) cGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtgg > 2:3175540‑M2/1‑3 (MQ=255) gAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgaaccgttgttgtagacgtcattgcccggggtctggaattcaacgctgccctgg < 1:692566‑M2/151‑150 (MQ=255) | GTTTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCCCACCACCTCCGGTACTACCTGTCACGGTGGCCGAAATCTGGCCCCCGTCGATGTAGGGTGTGTCGTTTGCCGGAACTGCGACGTTGACGCTACCAC > CP009974/1899125‑1899425 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |