| Predicted mutation | ||||||
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| JC | CP009974 | 3,898,294 | (TGGCCGTCGGGTTGCCGAGGACGGTGCAGACCGACTCAA)1→2 | coding (197/246 nt) | RPPX_17380 → | hypothetical protein |
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| ? | CP009974 | = 3898270 | 25 (0.110) | coding (173/246 nt) | RPPX_17380 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 481 total aligned reads displayed.
TTTCGGAGTCGCTGTCATGAAAAATGTTAACAAAATGATGATTGGAGTCGCCTTAACTGTTCTGAGCGCAAGTTCGATGGCGCTTCCAGCCAAGGAGCAAGGCAACTGGACCCATAAGCCTTGCAAATACCTGTGTGCACCAATCCTGGTCGAGGACGGTGCAGACCGACTCAATGGCCGTCGGGTTGCCGAGGACGGTGCAGACCGACTCAACGACCGGCGTGTAGCCGAGGACGGTTCGGACCGAGTCATCAATGCTTGATGTGCCTGGGCTGCGCCAAAAGCCCGGAAAAACCGGGCT > CP009974/3898082‑3898382 | tttCGGAGTCGCTGTCATGAAAAATGTTAACAAAATGATGATTGGAGTCGCCTTAACTGTTCTGAGCGCAAGTTCGATGGCGCTTCCAGCCAAGGAGCAAGGCAACTGGACCCATAAGCCTTGCAAATACCTGTGTGCACCAATCCTGGTc < 2:3025736/151‑1 (MQ=255)gattggagtcgccttaactgttctgagcgcaagttcgatggcgcttccagccaaggagcaaggcaactggacccataagccttgcaaatacctgtgtgcaccaatcctggtcgaggacggtgcagaccgactcaatggccgtcgggttgcc > 2:2204286‑M1/151‑151 (MQ=255) cGGAGTCGCTGTCATGAAAAATGTTAACAAAATGATGATTGGAGTCGCCTTAACTGTTCTGAGCGCAAGTTCGATGGCGCTTCCAGCCAAGGAGCAAGGCAACTGGACCCATAAGCCTTGCAAATACCTGTGTGCACCAATCCTGGTCGAg > 1:335607/1‑151 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |