| Predicted mutation | ||||||
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| JC | CP009974 | 3,898,294 | (TGGCCGTCGGGTTGCCGAGGACGGTGCAGACCGACTCAA)1→2 | coding (197/246 nt) | RPPX_17380 → | hypothetical protein |
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| ? | CP009974 | = 3898270 | 25 (0.110) | coding (173/246 nt) | RPPX_17380 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 480 total aligned reads displayed.
TGATTGGAGTCGCCTTAACTGTTCTGAGCGCAAGTTCGATGGCGCTTCCAGCCAAGGAGCAAGGCAACTGGACCCATAAGCCTTGCAAATACCTGTGTGCACCAATCCTGGTCGAGGACGGTGCAGACCGACTCAATGGCCGTCGGGTTGCCGAGGACGGTGCAGACCGACTCAACGACCGGCGTGTAGCCGAGGACGGTTCGGACCGAGTCATCAATGCTTGATGTGCCTGGGCTGCGCCAAAAGCCCGGAAAAACCGGGCTTTTTGGCAGATCAAATGATCCATTCGGCATCTACCCAA > CP009974/3898120‑3898420 | tGGAGTCGCCTTAACTGTTCTGAGCGCAAGTTCGATGGCGCTTCCAGCCAAGGAGCAAGGCAACTGGACCCATAAGCCTTGCAAATACCTGTGTGCACCAATCCTGGTCGAGGACGGTGCAGACCGACTCAATGGCCGTCGGGTTGCcgag < 2:435491‑M2/151‑5 (MQ=255) ggAGTCGCCTTAACTGTTCTGAGCGCAAGTTCGATGGCGCTTCCAGCCAAGGAGCAAGGCAACTGGACCCATAAGCCTTGCAAATACCTGTGTGCACCAATCCTGGTCGAGGACGGTGCAGACCGACTCAATGGCCGTCGGGTTGCcgagg > 2:38868‑M2/1‑146 (MQ=255) cttccagccaaggagcaaggcaactggacccataagccttgcaaatacctgtgtgcaccaatcctggtcgaggacggtgcagaccgactcaatggccgtcgggttgcCGAGGACGGTGCAGACCGACTCACTGGCCGTCGGGTTGCCGAgg < 2:1298678‑M1/44‑1 (MQ=255) 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aGGACGGTGCAGACCGACTCGATGGCCGTCGGGTTGCcgaggacggtgcagaccgactcaatggccgtcgggttgccgaggacggtgcagaccgactcaacgaccggcgtgtagccgaggacggttcggaccgagtcatcaatgcttgatg > 2:4844590‑M2/1‑37 (MQ=255) AGGACGGTGCAGACCGACTCAATGGCCGTCGGGTTGCCGAGGACGGTGCAGACCGACTCAACGACCGGCGTGTAGCCGAGGACGGTTCGGACCGAGTCATCAATGCTTGATGTGCCTGGGCTGCGCCAAAAGCCCGGAAAAACCGGGCttt > 1:3306469‑M1/1‑151 (MQ=255) aCGGTGCAGACCGACTCAATGGCCGTCGGGTTGCcgaggacggtgcagaccgactcaatggccgtcgggttgccgaggacggtgcagaccgactcaacgaccggcgtgtagccgaggacggttcggaccgagtcatcaatgcttgatgtgc > 1:1840974‑M2/1‑34 (MQ=255) ggTGCAGACCGACTCAATGGCCGTCGGGTTGCcgaggacggtgcagaccgactcaatggccgtcgggttgccgaggacggtgcagaccgactcaacgaccggcgtgtagccgaggacggttcggaccgagtcatcaatgcttgatgtgcct < 2:905042‑M2/151‑120 (MQ=255) gTGCAGACCGACTCAATGGCCGTCGGGTTGCcgaggacggtgcagaccgactcaatggccgtcgggttgccgaggacggtgcagaccgactcaacgaccggcgtgtagccgaggacggttcggaccgagtcatcaatgcttgatgtgcctg > 1:2722831‑M2/1‑31 (MQ=255) 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ggCCGTCGGGTTGCCGAGGACGGTGCAGACCGCCTCAACGACCGGCGTGTAGCCGAGGACGGTTCGGACCGAGTCATCAATGCTTGATGTGCCTGGGCTGCGCCAAAAGCCCGGAAAAACCGGGCTTTTTGGCAGATCAAATGATCCATTc < 2:4670771/151‑1 (MQ=255) cGTCGGGTTGCcgaggacggtgcagaccgactcaatggccgtcgggttgccgaggacggtgcagaccgactcaacgaccggcgtgtagccgaggacggttcggaccgagtcatcaatgcttgatgtgcctgggctgcgccaaaagcccgga < 1:5044771‑M2/151‑141 (MQ=255) gTCGGGTTGCCGAGGACGGTGCAGACCGACTCAACGACCGGCGTGTAGCCGAGGACGGTTCGGACCGAGTCATCAATGCTTGATGTGCCTGGGCTGCGCCAAAAGCCCGGAAAAACCGGGCTTTTTGGCAGATCAAATGATCCATTCGGCa > 1:5198424/1‑151 (MQ=255) cGGGTTGCcgaggacggtgcagaccgactcaatggccgtcgggttgccgaggacggtgcagaccgactcaacgaccggcgtgtagccgaggacggttcggaccgagtcatcaatgcttgatgtgcctgggctgcgccaaaagcccggaaaa < 1:4800938‑M2/151‑144 (MQ=255) gTTGCcgaggacggtgcagaccgactcaatggccgtcgggttgccgaggacggtgcagaccgactcaacgaccggcgtgtagccgaggacggttcggaccgagtcatcaatgcttgatgtgcctgggctgcgccaaaagcccggaaaaacc > 1:2416054‑M2/1‑5 (MQ=255) ttGCcgaggacggtgcagaccgactcaatggccgtcgggttgccgaggacggtgcagaccgactcaacgaccggcgtgtagccgaggacggttcggaccgagtcatcaatgcttgatgtgcctgggctgcgccaaaagcccggaaaaaccg < 1:2708989‑M2/151‑148 (MQ=255) tGCcgaggacggtgcagaccgactcaatggccgtcgggttgccgaggacggtgcagaccgactcaacgaccggcgtgtagccgaggacggttcggaccgagtcatcaatgcttgatgtgcctgggctgcgccaaaagcccggaaaaaccgg > 1:1388161‑M2/1‑3 (MQ=255) | TGATTGGAGTCGCCTTAACTGTTCTGAGCGCAAGTTCGATGGCGCTTCCAGCCAAGGAGCAAGGCAACTGGACCCATAAGCCTTGCAAATACCTGTGTGCACCAATCCTGGTCGAGGACGGTGCAGACCGACTCAATGGCCGTCGGGTTGCCGAGGACGGTGCAGACCGACTCAACGACCGGCGTGTAGCCGAGGACGGTTCGGACCGAGTCATCAATGCTTGATGTGCCTGGGCTGCGCCAAAAGCCCGGAAAAACCGGGCTTTTTGGCAGATCAAATGATCCATTCGGCATCTACCCAA > CP009974/3898120‑3898420 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |