| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP009974 | 1155488 = | 372 (1.130) | 372 (1.280) +AGGGTCCAGGGTGATGG |
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| ? | CP009974 | = 1156052 | 1 (0.000) | coding (139/564 nt) | RPPX_05120 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 382 total aligned reads displayed.
GACGCCATCGGCCAGGGCCAAGTCAGTCGGTTGCGCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCATCGGTGATGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1155622‑1155488‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCC < CP009974/1156052‑1155916 ||||||||||||||||| CGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGT < 1:610293/151‑1 GCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTG < 1:2233103/151‑1 GCCAGCGGCCAAGGCCAGGTGCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTG < 2:4664730/151‑1 CATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAA > 2:1166605/1‑151 ATCGGCCAGGGCCAAGTCAGTCGGTTGCGTTGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAG < 1:2640193/151‑1 CGGCCAGGGCCAAGTCAGTCGGTTGCGTTGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGg > 2:5090476/1‑150 CGGCCAGGGCCAAGTCAGTCGGTTGCGTTGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGT < 2:4081051/151‑1 CGGCCAGGGCCAAGTCAGTCGGTTGCGTTGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGT > 1:5208471/1‑151 GGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTG > 2:6432164/1‑151 GGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTG < 1:6545553/151‑1 GCCAGGGCCAAGTCAGTCGGTGGCGTTGGCGGCGGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGC < 2:4906862/151‑1 CCAGGGCCAAGTCAGTCGGTTGCGTTGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCC > 2:5553221/1‑151 CAGGGCCAAGTCAGTCGGTTGCGTTGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGGAGGTGCCA < 1:5270259/151‑1 CAGGGCCAAGTCAGTCGGTTGCGTTGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCA > 2:4431464/1‑151 AGGGCCAAGTCAGTCGGTTGCGTTGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCAT > 2:6524000/1‑151 AGGGCCAAGTCAGTCGGTTGCGTTGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCAT > 1:839635/1‑151 aGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATC < 1:5146579/150‑1 GGGCGAAGTCAGTCGGTTGCGTGGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATC 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AGTCGGTTGCGTTGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACG < 1:4217414/151‑1 AGTCGGTTGCGTTGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACG < 1:3144790/151‑1 GTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGG > 2:3030039/1‑151 GTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGG > 1:4978900/1‑151 GTCGGTGGCGTTGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGG < 1:4269789/151‑1 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GGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGG > 2:1882521/1‑151 GGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGG < 1:78606/151‑1 GGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGG < 1:2049450/151‑1 GTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGT < 1:1170902/151‑1 GTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGT > 1:2759156/1‑151 TTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTa > 1:1560818/1‑150 GCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTaga > 1:1797400/1‑148 CGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTagag < 1:1882521/151‑5 CGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTagag > 2:357490/1‑147 CGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTagag < 1:5806508/151‑5 GATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTagagc > 1:4147337/1‑146 ATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTagagcc < 2:2444483/151‑7 TGCCGGCGGCATCGGCGAGGGTGACCTGCAAGGTGCGGCCGTCAGTCACGGCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTC < 2:3097539/151‑1 gGGTGCTGCCGTCGTGGACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAgc < 2:2330321/150‑3 cattcacGGCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAG > 2:5420928/8‑151 tcacGGCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCTACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATT > 1:4425455/5‑151 tcacGGCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATT < 1:2308674/147‑1 acGGCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGG > 1:3881300/3‑151 acGGCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGG > 1:5349010/3‑151 cGGCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGT > 2:1974317/2‑151 GGCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTC < 1:480556/151‑1 AGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGT > 1:743231/1‑151 GGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGC > 1:3640126/1‑151 GTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCt > 1:399280/1‑150 GTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCt > 1:392714/1‑150 ||||||||||||||||| GACGCCATCGGCCAGGGCCAAGTCAGTCGGTTGCGCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCATCGGTGATGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1155622‑1155488‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCC < CP009974/1156052‑1155916 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |