| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 1277582 = | 311 (0.950) | 224 (0.690) +C |
122/298 | 5.6 | 42.9% | intergenic (+51/+187) | RPPX_05635/RPPX_05640 | aldehyde dehydrogenase/mechanosensitive ion channel protein MscS |
| ? | CP009974 | 4286484 = | 290 (0.880) | intergenic (+340/+304) | RPPX_19070/RPPX_19075 | LacI family transcriptional regulator/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1277720‑1277582‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCA > CP009974/4286484‑4286633 | CCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGcg > 2:858758/1‑149 GGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGCTCACCCGCGAAAGGGCC > 1:6435050/1‑151 CCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGG > 1:4277774/1‑151 gcgGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCGCCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCT < 1:6497673/148‑1 GCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCc > 1:4357506/1‑150 CTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGCGCGGGCTCCCCCGCGAAAGGGCCGGCCCTG > 1:3246092/1‑151 GGCAAATTGCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCT < 1:3713851/151‑1 CAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGGTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGC > 1:2959391/1‑151 ATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCCGCCCTGCAGGCCA > 1:2377568/1‑151 ATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGCTCACCCGCGAAAGGGCCCGCCCGGCcgcccg > 2:2747908/1‑145 TTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAA < 1:3062807/151‑1 CACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTC < 1:4746564/151‑1 CCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCAC < 2:6093659/151‑1 CCGCCCTTCCCCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGGGACGCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCAC < 2:4974503/151‑1 CGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGCTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACC > 2:6362738/1‑151 TCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGT < 2:2371400/151‑1 TCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGT < 1:2106961/151‑1 GTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCCGGCCAACCCCCACCCGCCGCTCACC > 2:6448611/1‑151 TTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCG > 1:84600/1‑151 TGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAAACGCCACCCGCCGGTCACCGT > 2:1510230/1‑151 GCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTT > 2:3928782/1‑151 CCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAACCCCGCTCCGGGGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTG < 1:4470436/151‑1 CCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTG > 2:3134208/1‑151 CCGCCGCGAACGTATTCGCGGGTGAACCCGCCCATGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTG < 2:4183381/151‑1 GCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCC > 1:5848446/1‑151 GCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCC < 1:1483373/151‑1 gctACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCC > 1:2573971/4‑151 gctACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCC > 1:5689087/4‑151 ctACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCG < 1:3530210/149‑1 tACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGC > 1:1211721/2‑151 ACCATATTCGCGGGTAAACCCGCCCCGGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCC < 1:360165/151‑1 CGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCgc > 1:5272298/1‑149 TATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCACTCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCG > 2:1542198/1‑151 TATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCgccc > 2:1303894/1‑147 TATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCG > 1:3052224/1‑151 aaaCGCGGGTACCCGAGCTCATGCGCGGATGGGTTGTGGACACACACCGGGGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGT < 1:406250/148‑1 ATTCGCGGGTAAACCCGCTGCTGCGCAGAGGGGTTGTGGACACACACCGGGGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGT < 2:1455132/151‑1 ATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGT > 2:2952526/1‑151 CGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATT > 1:499491/1‑151 CGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATT > 1:1922226/1‑151 cCGGGTAAACACGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTC < 1:5775356/150‑1 CGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCG > 2:4711048/1‑151 GGGTAAGCCCGCTCCTGCGCGGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGC < 2:4079014/151‑1 GGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCc > 2:2235461/1‑150 AAACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGT > 1:2597896/1‑151 AACCCGCTCCTGCGCAGCTGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTA < 1:2926592/151‑1 AACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTA > 1:1718332/1‑151 AACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTA > 1:6304724/1‑151 AACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTA > 1:312968/1‑151 ACCCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAA > 1:4893810/1‑151 CCGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAAC > 1:1531753/1‑151 CGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACC > 1:3566496/1‑151 CGCTCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACC > 1:1389009/1‑151 TCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGC > 2:1171358/1‑151 TCCTGCGCAGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGC > 1:3432060/1‑151 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< 2:4488977/145‑1 AGATGGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAC > 1:1802271/1‑151 gaggGGTTGTGGATACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCCCCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACA < 2:1807029/147‑1 tgGGTTGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGA < 1:4285025/149‑1 gggttGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAT < 1:4118881/146‑1 ggttGTGGACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATt < 1:5300729/147‑2 GACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTG < 1:2439942/151‑1 GACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTG > 1:6360342/1‑151 GACACACACCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAAACTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCAGCCGCCGTATTCGCGCGTAAACCCGCTCCTACACCGATTGGTCGTG > 2:5716195/1‑151 ccccccCGGAGGTTGGCCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCCCCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGAC < 1:1271085/145‑1 acacacCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGGTCACCGTTGCTGCCCCAGCCGTATTCGCGAGTAGACCCGCTCCTACACAGCTTGGTGGTGGAC > 2:6141419/7‑151 cacacCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACA < 1:6027003/146‑1 cacCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACA < 1:2492510/148‑1 acCGGAGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACAc > 1:1747537/3‑150 gCGGTGGTTGGACAAGGGCCGTC‑‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTC < 2:1476849/150‑1 CGGTGGTTGGACACGGGCCGTC‑‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCG < 2:4596252/151‑1 ggaGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACAcctc > 2:2082283/4‑147 ggaGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACAcctc > 2:3807521/4‑147 aGGTTGGACGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGCTTGGTGGTGGACACAACTCGG > 2:3400440/2‑151 GTTGGACACAGGCCGTC‑‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGT < 1:4146458/151‑1 ccCAGGCCGTCG‑G‑AGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACA < 2:5921671/149‑1 gccgtgGTAGGAGCGGGGTCCCCCGCGAAAGGGCCGGCCCGGGTGGCCGAGCTCCGCCTGCCGTTCACCGTTGGCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGC < 2:3176636/145‑1 ggcGTAGGAGCGGGTTCACCCGGGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTGCACCGTTGGCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGT < 2:2643814/148‑1 tcGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGTC < 2:6532830/149‑1 tcGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGTC < 1:1569652/149‑1 cGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTG > 1:5348592/2‑137 cGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTG < 2:5348592/136‑1 GTAGGAGCGGGTTGACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTTCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGTCGT < 2:169911/151‑1 GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGAACCGTGGGGGGCAAAAGGCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGT > 1:2660523/1‑151 GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATC < 2:1014661/111‑1 GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATC > 1:1014661/1‑111 AGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACAGAGGGCGGTGGGTGGACACGGGCCGTCGTAG > 1:2750496/1‑151 AGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGTCGTAG > 1:3768088/1‑151 GGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGGAGG > 2:3314536/1‑151 GAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTAGGA > 1:6260402/1‑151 AGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGA < 1:355405/115‑1 AGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGA > 2:355405/1‑115 GCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGTCGTAGGAGC > 1:77700/1‑151 CGGGTTGACCCGCGAGAGGGCCGCCCCTGCTGGCCAAGCCCCACCTGCCGTTCACCGTTGTCGCCGCGACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGTCGTAGGAGCG < 2:5998347/151‑1 GGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTGCACCGTTGTCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGTCGTAGGAGCGG < 2:4660237/151‑1 | GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1277720‑1277582‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCA > CP009974/4286484‑4286633 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |