| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 949 total aligned reads displayed.
ACGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGATGGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGCCACGGGCACGGTCAA > CP009974/1155153‑1155453 | aCGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCC < 1:5702813‑M1/151‑1 (MQ=255)aCGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCC > 1:5624129‑M1/1‑151 (MQ=255) ggCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAg > 1:970377/1‑151 (MQ=255) gCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCCCGGTCACCGCCCCAGa > 2:5419684/1‑151 (MQ=255) caccacTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGAc < 2:1094391/151‑1 (MQ=255) caccacTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGAc < 1:2544647/151‑1 (MQ=255) accacTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggaca < 1:377127‑M1/151‑6 (MQ=255) cacTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGGAGCTTCAGCATCACCATCGCCCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatc < 2:5767073‑M1/151‑8 (MQ=255) cacTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATc < 2:2368691/151‑1 (MQ=255) tgtgCTGGGTAGCGGGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCCCCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgat < 2:5954993‑M1/151‑11 (MQ=255) gtgCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGATg < 2:5371439/151‑1 (MQ=255) tgCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatgg > 1:2675953‑M1/1‑139 (MQ=255) tgCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGATgg < 1:5484972/151‑1 (MQ=255) gCTGGGTGGCGTGGTAGTTGGCGCGACCGGCAGCGTCAGCAGCACCCGCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGATGGc < 2:3679442/151‑1 (MQ=255) gaGCGTGGTGGCTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCCTCCCCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGATGGCGAcacc < 2:3298698/150‑1 (MQ=255) gCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgatac < 1:1184152‑M1/151‑22 (MQ=255) gTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACCTCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgctggcgccgctaccc > 2:6532495‑M1/1‑128 (MQ=255) gTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgatacca > 1:287731‑M1/1‑128 (MQ=255) 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ccGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGATGGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCa > 2:2492868/1‑151 (MQ=255) gATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGATGGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAgg > 1:681447/1‑151 (MQ=21) aTGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGATGGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGt < 1:3303637/151‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGATGGCGACACCACCCCGCCTGAATCACCGACCAACCTGGCGATCAGCGCTGCCTGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGGTCAGGTgcgc > 1:4634559/1‑151 (MQ=255) cTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGATGGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGa > 2:3068561/1‑151 (MQ=17) gggcAACGCATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgt < 2:3190721‑M1/150‑116 (MQ=255) gCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGATGGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTgcgtgacgc < 1:3437893/151‑7 (MQ=17) cAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggcgcgtgac > 2:3483649‑M1/1‑33 (MQ=255) cAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGATGGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTgcgtgacgcg < 1:6112244/151‑8 (MQ=17) aaCACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacg < 1:1841784‑M1/151‑120 (MQ=255) acacATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgc > 2:3989252‑M1/1‑31 (MQ=255) cacaTCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGATGGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCa < 1:4075305/151‑1 (MQ=255) acaTCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGATGGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAg > 1:3530955/1‑151 (MQ=255) aTCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggcc < 1:5995397‑M1/151‑125 (MQ=255) aTCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGATGGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGc > 2:886318/1‑151 (MQ=255) cGCCAACGAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGATGGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCAc < 2:4103096/151‑1 (MQ=255) cAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggcgttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggcaa < 2:3870119‑M1/151‑130 (MQ=255) aaCCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggcaac > 2:2272043‑M1/1‑21 (MQ=255) aaCCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggcaac > 1:2150740‑M1/1‑21 (MQ=255) aCCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggcaaca > 1:4771631‑M1/1‑20 (MQ=255) aCCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGATGGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTaa < 2:814296/151‑1 (MQ=255) cAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGATGGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTCATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCACCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCCCCGTAAtt > 2:340521/1‑151 (MQ=255) tCGGTCACCGCCCCAGACATCGATGGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGCCa > 1:4878597/1‑151 (MQ=255) cGGTCACCGCCCCAGACATCGATGGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGCCAc < 1:3626688/151‑1 (MQ=255) ggTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggcaacatcctcgcg > 1:2226244‑M1/1‑12 (MQ=255) gCCCCagacatcgatggcgacaccaccccgcctgaagcaccgaccaacctggtgatcagcgctgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggcaacatccttgcgactggcactg < 2:1680976‑M1/151‑147 (MQ=255) ccAGACATCGATGGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGCCACGGGCACGGTCa > 2:5243884/1‑151 (MQ=255) | ACGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGATGGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGCCACGGGCACGGTCAA > CP009974/1155153‑1155453 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |