New junction evidence | |||||||||||
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? | CP009974 | = 1156366 | 0 (0.000) | coding (453/564 nt) | RPPX_05120 | hypothetical protein |
Only 100 of 373 total aligned reads displayed.
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gccggccgCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctggttggc > 2:254151‑M2/1‑127 (MQ=255) cggccgCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctggttggcga < 2:448802‑M2/151‑27 (MQ=255) ggccgCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctggttggcgat < 1:5995397‑M2/151‑28 (MQ=255) ggccgCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctggttggcgat < 2:5896323‑M2/151‑28 (MQ=255) ccgCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctggttggcgatgt < 1:2437312‑M2/151‑30 (MQ=255) 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gTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctggttggcgatgtgttg > 2:3460156‑M2/1‑118 (MQ=255) cGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTCTCGCCGCCATCGATCTCCggggcggtgacccagctgtgtggcgatgtgttcccag < 2:6168934‑M2/151‑38 (MQ=255) cACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctggttggcgatgtgttgccagcg < 2:1597701‑M2/151‑40 (MQ=255) ccctGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctggttggcgatgtgttgccagcgg > 1:1909669‑M2/2‑111 (MQ=255) gCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctggttggcgatgtgttgccagcggcatc > 1:447516‑M2/1‑107 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |