New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | CP009974 | 1157207 = | 0 (0.000) | 355 (1.980) | 77/164 | 2.6 | 100% | intergenic (+730/‑14553) | RPPX_05120/RPPX_05130 | hypothetical protein/channel protein TolC |
? | CP009974 | = 1158025 | NA (NA) | intergenic (+1548/‑13735) | RPPX_05120/RPPX_05130 | hypothetical protein/channel protein TolC |
Only 100 of 802 total aligned reads displayed.
CTCGACGCCCTGCTGCGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGCCGGCGGTACTGTCATCGGTACTGGTGTCGTAGGGGCCGACGGCCTGTTCAGCCTCACCGTCACCCTCGCCGATCCCGCCGGCAGCTTCACCGTCCCCCTCGCCCCGGCCGCTCAGCCAGGCGAGCAGTTGAGCCTGGTGCAGACCGACCCAAGCGGCAACGCTTCGGTGGCTACCGAGTACGACGTACCATTGACCACCGCGCC > CP009974/1157060‑1157313 | gaggcagtaaccaatattacagttggcgctgacggcctggccctgagcggtcgcggcgaaccgggtgccactgtcgaagtgcgcgatgccagtggcaccgtgatcggcacaggtgtggtcggtgccaacggcaccttcctgatcgacCTCg < 2:1414590‑M1/4‑1 (MQ=255) ccgtaaccaatattacagttggcgctgacggcctggccctgagcggtcgcggcgaaccgggtgccactgtcgaagtgcgcgatgccagtggcaccgtgatcggcacgggcgtcgtgggagccaacggcaccttcctgatcgacCTCGcccc > 2:4290850‑M1/144‑151 (MQ=255) agtaaccaatattacagttggcgctgacggcctggccctgagcggtcgcggcgaaccgggtgccactgtcgaagtgcgcgatgccagtggcaccgtgatcggcacaggtgtggtcggtgccaacggcaccttcctgatcgacCTCgcccca > 2:5735192‑M1/143‑150 (MQ=255) taaccaatattacagttggcgctgacggcctggccctgagcggtcgcggcgaaccgggtgccactgtcgaagtgcgcgatgccagtggcaccgtgatcggcacgggcgccgtgggagccaacggcaccttcctgatcgacCtcgccccagc < 1:5458751‑M1/11‑4 (MQ=255) accaatattacagttggcgctgacggcctggccctgagcggtcgcggcgaaccgggtgccactgtcgaagtgcgcgatgccagtggcaccgtgatcggcacgggcgtcgtgggagccaacggcaccttcctcatcgacCGCGCCCccgccg < 2:3566642‑M1/13‑1 (MQ=255) ccaatattacagttggcgctgacggcctggccctgagcggtcgcggcgaaccgggtgccactgtcgaagtgcgcgatgccagtggcaccgtgatcggcacgggcgtcgtgggagccaacggcaccttcctgatcgacCTCGCCCCAGCCGc > 1:2571828‑M1/138‑151 (MQ=255) caatattacagttggcgctgacggcctggccctgagcggtcgcggcgaaccgggtgccactgtcgaagtgcgcgatgccagtggcaccgtgatcggcacgggcgtcgtgggcgccaacggcaccgtcctgatccacctcgccccccccgcc < 2:4081666‑M1/15‑8 (MQ=255) cagttggcgctgacggcctggccctgagcggtcgcggcgaaccgggtgccactgtcgaagtgcgcgatgccagtggcaccgtgatcggcacgggcgtcgtgggagccaacggcaccttcctgatcgacCTCGCCCCAGCCGCACAGCCAgg > 1:3643821‑M1/129‑151 (MQ=255) cagttggcgctgacggcctggccctgagcggtcgcggcgaaccgggtgccactgtcgaagtgcgcgatgccagtggcaccgtgatcggcacgggcgtcgtgggagccaacggcaccttcctgatcgacCTCGCCCCAGCCGCACAGCCAgg < 2:5057700‑M1/23‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |