| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | U00096 | = 2560972 | 91 (0.400) | 5 (0.030) | 5/252 | 25.7 | 5.6% | intergenic (+74/‑396) | yffL/yffM | uncharacterized protein YffL/uncharacterized protein YffM |
| ? | U00096 | 2561043 = | 89 (0.460) | intergenic (+145/‑325) | yffL/yffM | uncharacterized protein YffL/uncharacterized protein YffM | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
GCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGATTAGCG > U00096/2560912‑2561190 | gCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAATGTTGCCGTTTAGGAGGGTCAAAATTTGACGTTTAGGTGGCGGAAAAGTTGACGAGTAAGGATTATACTAtt > 2:1957582/1‑149 (MQ=37) tCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAAt > 1:1957678/1‑148 (MQ=255) cccGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAGTGGTGGGTCAATAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTc < 2:1957528/149‑1 (MQ=255) cGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTGAAAAGTTGCCGTGAAGGTGGGTCAAAATTTGCCGAGAAAGAAGTCTACTATTAAGAATTCTa > 2:1957670/1‑149 (MQ=38) ccTTTTCTTTTCCTTAATTACATGAATTCAGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAgg < 2:1957531/149‑1 (MQ=255) cTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGAGGGACAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGGGAAAAGTTGACGAGAAAGAATTCTACAATTAAGAATAATAGGc > 1:1957642/1‑149 (MQ=37) tttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGAGGGTCAAAAGTTGCAGTGTAGGTGTGGGAAAATTTGCCGAGAAAGAATTGTACTATTAAGATTTATAGGCGa > 2:1957716/1‑149 (MQ=25) tCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGAGGGTCAAATGTTGAAGTTAAGGTGGGGGAAAATTTGCCGAGTAAGAATTCTACAATTAAGAATTATAGgcggcg > 2:1957591/1‑149 (MQ=37) ttGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAATGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAATGTTGCCGTGAAGGGGGCGCAAAAGTAGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGCATTCTAGCCGACggg > 1:1957697/1‑148 (MQ=37) ttGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGATAGTGGTGGATCATAATTTGCCGTTAAGGAGGGTCAAAATTTGAAGATAACGTGGGTCAAAATTAGCGGAGAAAGGAGTAAAATATAATGAATTCTACGCGACCGGa > 2:1957630/1‑149 (MQ=255) tGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAATTTGACGTTAAGGAGGGTCAAAATTTGAAGTAAAGGTGGCTCAAATTTTGACTAGAAAGAATTATAAAATTAAAAATAATAAGCCACggaat > 2:1957647/1‑146 (MQ=16) ttAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGGCGTTTAGGTGGGTCAAAATTTGACGAGTAAGAATTCTACAATTATGAATACTAGGCGACGGGAGtttt > 1:1957659/1‑149 (MQ=37) cATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGAGTCAAAAGTTGACGATAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCTAGTAAGAATTCTACAATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGACt > 2:1957681/1‑149 (MQ=37) ggTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGTCGTTAAGGTTGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCGACTATTAAGAATTCAAGGCGACGGGAGTTTTATAGCCTCCcggtcggt > 1:1957752/1‑149 (MQ=38) tGGGTCAAAAGTTGCCGTTTGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGGGGGGCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCa > 1:1957624/1‑149 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCAGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATag > 1:1957663/1‑149 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCGAAAGTTGCAGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGAAGAGAAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGTAGTTTTTTATCCTCACGCTCGCTCAt > 2:1957654/1‑145 (MQ=37) cAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGCGGGGCAAATGTTGCAGTTAAGGTGGCTCAAAAGTTGACGCGAAAGACTTATAAAATTAAGAATACTACGCGCCGGGAGATTTTTAGACTCACGGACCCTCATagag > 2:1957699/1‑149 (MQ=19) atttGCCTTTTGTGTTGGGTCATAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTc < 2:1957542/147‑1 (MQ=38) aGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCGCGGTCGGTCATAGAGAGTc > 2:1957706/1‑149 (MQ=255) cccctttACTGTTGGGTAATTAGTTGCCTTTAAGTTGGGTAAAAAGTTGCCGTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGcc < 2:1957547/144‑1 (MQ=255) tttctgggtggGTAATAACCTGCCGTTTAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTaga < 2:1957554/143‑1 (MQ=38) gTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATagagag > 1:1957686/1‑140 (MQ=255) ttAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGACTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTagag > 1:1957718/1‑149 (MQ=255) ttACTGGGGGGTAATTAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTCTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTagag < 2:1957546/149‑1 (MQ=38) tggtggGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTaa > 1:1957637/1‑149 (MQ=255) ggtggGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTa > 1:1957536/1‑147 (MQ=255) ggtggGTAAAAAGCTGCCTTTTAGTTGGGTAAAATGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTaaa < 2:1957538/149‑1 (MQ=39) ttggGTAAAACGTTGCCGTTAAGTTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAAc < 2:1957541/148‑1 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGTGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACagaa > 1:1957766/1‑149 (MQ=255) aaaaaGCTGCCGTTTAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACagaaga < 2:1957545/148‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAatt > 1:1957730/1‑149 (MQ=255) gTTGCCGTTTAGGTGGGTCAAATGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAattat < 2:1957549/149‑1 (MQ=255) ttGCCTTTTAGTTGGGTAAAATGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAattatt < 2:1957550/149‑1 (MQ=255) tGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTaa < 2:1957552/134‑1 (MQ=255) tGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTaa > 1:1957552/1‑134 (MQ=255) gCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGa < 1:1957557/51‑1 (MQ=255) cGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAattatt > 1:1957685/1‑145 (MQ=255) cGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcgc > 2:1957746/1‑149 (MQ=255) ttttatgTGGGTAAATTGCTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcgcc < 2:1957594/143‑1 (MQ=255) tttAAGGTGGGTCAAAAGTTTCCGTTAAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTATAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcgcc < 2:2201378/148‑1 (MQ=255) tAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcgccgc > 2:1957687/1‑149 (MQ=255) gttGGGTCAAAAGGAGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTg < 2:1957565/147‑1 (MQ=255) ggTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTg > 1:1957710/1‑149 (MQ=255) ggTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTg > 2:1957671/1‑149 (MQ=255) gggTCAAAAGTTTCACTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTAATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATa < 1:1957576/149‑1 (MQ=255) cAAAAGTTGCCTTTTAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTc < 2:1957578/149‑1 (MQ=255) cAAAAGTAGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTc < 2:1957577/149‑1 (MQ=255) aaaaGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCg > 2:1957668/1‑149 (MQ=255) aaaGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGt > 1:1957695/1‑146 (MQ=255) gTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCt > 1:1957742/1‑148 (MQ=255) ttGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTgg > 2:1957703/1‑149 (MQ=255) tGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGt > 1:1957675/1‑149 (MQ=255) gCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGtt < 1:1957582/149‑1 (MQ=255) gCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGt > 1:1957780/1‑148 (MQ=255) ctttcaGGTGGGTCAACAGGTGCCGAGTAAGTAGTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGGCGGGCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGc < 2:1957602/144‑1 (MQ=255) cGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGc > 2:1957688/1‑149 (MQ=255) gTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTaga < 1:1957583/102‑1 (MQ=255) ttcaGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACAATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGa < 1:1957590/146‑1 (MQ=255) ttAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTc < 1:1957592/49‑1 (MQ=255) ttAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATa < 1:1957586/87‑1 (MQ=255) ttAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAattatt < 1:1957593/120‑1 (MQ=255) ttAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTc < 1:1957595/122‑1 (MQ=255) ttAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGa > 2:1957711/1‑149 (MQ=255) tAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCa < 1:1957597/84‑1 (MQ=255) aaGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAAc < 1:1957599/106‑1 (MQ=255) aaGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGc > 2:1957713/1‑149 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACg < 1:1957603/55‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGt < 1:1957610/60‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGc < 1:1957605/68‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGcc < 1:1957606/94‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTag < 1:1957611/97‑1 (MQ=255) ggTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACa < 1:1957612/105‑1 (MQ=255) tGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTa > 1:1957704/1‑149 (MQ=255) tGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTa > 1:1957691/1‑149 (MQ=255) gggTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTg < 1:1957615/123‑1 (MQ=255) ggTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAAc < 1:1957616/149‑1 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGCGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAAcc > 1:1957819/1‑149 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAgg < 1:1957617/126‑1 (MQ=255) tCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGTCGACTGGAGTTTTTTAGCCTACCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCa > 1:1957657/1‑149 (MQ=255) tCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCa > 2:1957692/1‑149 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGCTAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCa < 1:1957620/148‑1 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCAt < 2:1957619/149‑1 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCAt > 2:1957774/1‑149 (MQ=255) aaaaGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATg < 1:1957621/149‑1 (MQ=255) aaaaGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATGAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTCACCATg > 2:1957762/1‑149 (MQ=255) aaaaGATGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATg > 2:1957776/1‑149 (MQ=255) aaaGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGc > 2:1957693/1‑149 (MQ=255) aaaGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGc < 1:1957623/149‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCt > 1:1957729/1‑149 (MQ=255) aaGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCt < 2:1957624/149‑1 (MQ=255) gTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTa < 1:1957629/89‑1 (MQ=255) gTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGa < 1:1957626/149‑1 (MQ=255) gTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGa < 2:1957628/149‑1 (MQ=255) ttGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGAt < 1:1957630/149‑1 (MQ=255) gCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGATTa < 2:1957631/149‑1 (MQ=255) cGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGATTAgc < 1:1957633/149‑1 (MQ=255) agAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGATAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGAATTAACCATGCTGATTatc > 2:1957836/2‑147 (MQ=255) gAGTAAGAAATCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTATAGCCTCCCGGTCGGTAATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTACTCAGCCTGATAGGTCGGCTGCATGCGAGCATTAACCATGCTGATTAgcg > 2:1957747/1‑149 (MQ=255) aGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTAGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGATTAg > 1:1957798/1‑146 (MQ=255) | GCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGATTAGCG > U00096/2560912‑2561190 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |