New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | U00096 | = 3118881 | 64 (0.730) | 3 (0.040) | 3/272 | 12.4 | 4.8% | coding (232/4563 nt) | yghJ | putative lipoprotein YghJ |
? | U00096 | 3118960 = | 59 (0.710) | coding (153/4563 nt) | yghJ | putative lipoprotein YghJ | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CGCAAGTAACGTCCTCGCCAGGTTTAAATGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGG > U00096/3118737‑3119027 | cGCAAGTAACGTCCTCGCCAGGTTTAAATGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGt > 1:939289/1‑146 (MQ=255) cAAGTAACGTCCTCGCCAGGTTTAAATGTAAAGCAATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCAGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTgg > 1:939282/1‑143 (MQ=255) aaGTAACGTCCTCGCCAGGTTTAAATGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAgg < 1:939241/148‑1 (MQ=255) aGTAACGTCCTCGCCAGGTTTAAATGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGa < 2:939242/148‑1 (MQ=255) aGTAACGTCCTCGCCAGGTTTAAATGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTATTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGa > 1:939266/1‑148 (MQ=255) gTAACGTCCTCGCCAGGTTTAAATGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGAt > 1:939279/1‑148 (MQ=255) tAACGTCCTCGCCAGGTTTAAATGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATc < 1:939243/148‑1 (MQ=255) gTCCTCGCCAGGTTTAAATGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGATCAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGt < 2:939244/148‑1 (MQ=255) gTCCTCGCCAGGTTTAAATGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGt < 1:939245/148‑1 (MQ=255) ccTCGCCAGGTTTAAATGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTAt < 1:939246/148‑1 (MQ=255) tCGCCAGGTTTAAATGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCg < 2:939247/148‑1 (MQ=255) cGCCAGGTTTAAATGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCgg > 2:939303/1‑148 (MQ=255) ccAGGTTTAAATGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAgg > 1:939277/1‑134 (MQ=255) ccAGGTTTAAATGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATAAGCTTGCGGtt > 1:939285/1‑148 (MQ=255) aGGTTTAAATGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAgg > 1:939288/1‑132 (MQ=255) tttAAATGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCCGGTAACGGTTCAGGc > 2:939269/1‑148 (MQ=255) tAAATGTAAAGCCATCGCTGGATTCTCCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGAAAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGt < 2:939248/148‑1 (MQ=255) tAAATGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGt < 1:939249/148‑1 (MQ=255) aaaTGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTa < 2:939250/148‑1 (MQ=255) aaaTGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATAAGGTTTCGGTTAAGGCgaa > 2:939274/1‑146 (MQ=255) aTGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCg > 1:939276/1‑144 (MQ=255) tGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAGCAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGtt > 1:939296/1‑119 (MQ=255) aaaGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGctct < 1:939251/148‑1 (MQ=255) aTCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCATGTATCGGTTCTGTCGTAGTCTCTGGGTcc < 2:939252/148‑1 (MQ=255) cTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATAAGGTTTCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCg > 2:939310/1‑148 (MQ=255) tGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGt > 1:939268/1‑148 (MQ=255) ggATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTgg > 1:939295/1‑138 (MQ=255) gATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTg > 2:939309/1‑148 (MQ=255) gATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACACGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCCGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGTTCCGGCGTTg > 1:939272/1‑148 (MQ=255) aTTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATAAGCTTACGCAACTGGCATAGGCACTGGGTCAGCCGTAgg > 2:939307/1‑148 (MQ=255) cACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGGTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTc > 2:939299/1‑148 (MQ=255) cATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTGCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAgg < 2:939253/148‑1 (MQ=255) aTTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCCTAGGCTCTGGGTCCGCCGTAGGCTCAGGc > 1:939283/1‑148 (MQ=255) tACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGTCACTGGGTCAGGCGTTGGCTAAGGCGt > 1:939270/1‑148 (MQ=255) tACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGt < 1:939256/148‑1 (MQ=255) tACAGCTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGGCCGGCGTTGGCTCAGGCGt < 2:939255/148‑1 (MQ=255) ggTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCgg > 1:939298/1‑147 (MQ=255) tACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGATCTGCCGGAGTCACTGGGTCAGGCGTAGGCTAAGCCGACGTCTCAGGGTTTgct > 2:939302/1‑146 (MQ=255) gCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATAAGCTAACGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCTCCGTTGGCTAAGGCGTCGACTCAGGGTTTGGTGTTgc > 2:939297/1‑147 (MQ=255) gCTGGCTTCCGACCAGGGTCAGATAACCAGTTTTCGTAGGAACCGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCACGATCCGGTATCGGTCCTGGCGTCGGCTCTGGGTCCGTCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTgg < 1:939257/148‑1 (MQ=255) ggCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTATGGTGTGGGATc > 1:939281/1‑148 (MQ=255) ccAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGTCTCTGGGTCAGGCGTTGGCTAAGGCGTCGGCTCAGGGTATGGTGTTGGATCAGGTTTCAc > 2:939275/1‑148 (MQ=255) ccAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCAc < 1:939259/148‑1 (MQ=255) ccAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCAc < 2:939260/148‑1 (MQ=255) aGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGGTTCACtt > 1:939326/1‑148 (MQ=255) gggTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTc > 1:939286/1‑148 (MQ=255) ggTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTcc > 2:939306/1‑148 (MQ=255) tCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCgg > 1:939294/1‑148 (MQ=255) aGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTcc < 1:939261/144‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCgg > 1:939315/1‑102 (MQ=255) ttCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTc < 1:939263/148‑1 (MQ=255) aGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCa > 1:939314/1‑43 (MQ=255) cAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCGCTGGGTCAGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGGTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTa > 1:939304/1‑147 (MQ=255) cAGGTGCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGCTCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTGTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCGGTTCCAGAATCTAc < 2:939264/148‑1 (MQ=255) gTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTCTCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAgg < 2:939265/148‑1 (MQ=255) ggTTCTGGTGGTGGTTCAGGCTCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGGCCGGCGTTGGCTCAGGCGGCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCgg < 2:939266/148‑1 (MQ=255) ttCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCggag > 1:939329/1‑148 (MQ=255) tCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCggagg > 2:939341/1‑148 (MQ=255) tgtTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCggagga > 2:939305/1‑144 (MQ=255) tgtTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGAt < 2:939268/148‑1 (MQ=255) tgtTGGATCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGAt < 2:939267/148‑1 (MQ=255) gtTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCggagga > 2:939324/1‑143 (MQ=255) ggtGGTTGAGGAGCAGGTATCGGGTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATc < 1:939269/146‑1 (MQ=255) tGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCg > 2:939347/1‑148 (MQ=255) ggTTCAGGATCAGGGATCGGTTCTTGCGTATGATCTGGGGCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCgg < 2:939270/148‑1 (MQ=255) | CGCAAGTAACGTCCTCGCCAGGTTTAAATGTAAAGCCATCGCTGGATTCACCATTACAGGTAGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGG > U00096/3118737‑3119027 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |