| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | U00096 | = 2560972 | 135 (0.470) | 6 (0.020) | 6/252 | 37.8 | 4.9% | intergenic (+74/‑396) | yffL/yffM | uncharacterized protein YffL/uncharacterized protein YffM |
| ? | U00096 | 2561043 = | 119 (0.480) | intergenic (+145/‑325) | yffL/yffM | uncharacterized protein YffL/uncharacterized protein YffM | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
GGCTATATACCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAG > U00096/2560824‑2561119 | ggCTATATACCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 2:2476115/1‑149 (MQ=255)ggCTATATACCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:2476145/1‑149 (MQ=255)ggCTATATACCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:2476144/1‑149 (MQ=255) gCTATATACCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGt > 1:2476065/1‑149 (MQ=255) cTATATACCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGtt < 2:2475992/149‑1 (MQ=255) tataCCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAgt < 2:2475993/149‑1 (MQ=255) ataCCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAgtg < 2:2475995/149‑1 (MQ=255) taCCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAgtgg < 1:2475997/149‑1 (MQ=255) taCCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAgtgg < 1:2475996/149‑1 (MQ=255) ccAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAatggtg > 2:2476138/1‑149 (MQ=255) cAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGtggtgg < 2:2475999/149‑1 (MQ=255) gATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:2476169/1‑136 (MQ=255) gATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTc < 2:2476000/149‑1 (MQ=255) cGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATACCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCaaa < 2:2476002/149‑1 (MQ=255) gCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGATATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTGAGTGTTTGGTAaaaat > 2:2476143/1‑148 (MQ=255) cAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGt < 2:2476005/149‑1 (MQ=255) aGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGtt < 2:2476006/149‑1 (MQ=255) gAAAGGGAGTGCAACGAATACCGGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTg < 1:2476009/149‑1 (MQ=255) gAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTCCAACATGAAATAACGGAAGCCGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTg < 1:2476008/149‑1 (MQ=255) aaaGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGc > 1:2476103/1‑149 (MQ=255) aaGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGcc < 1:2476011/149‑1 (MQ=255) gggAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGt < 2:2476012/149‑1 (MQ=255) gAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTa < 2:2476015/149‑1 (MQ=255) gTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAATGGATTGTAAAATGTTGCCGTTTAg > 2:2476189/1‑149 (MQ=255) tGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAgg < 2:2476016/149‑1 (MQ=255) gCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGTAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:2476127/1‑118 (MQ=255) gCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:2476114/1‑118 (MQ=255) cAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTg < 1:2476019/149‑1 (MQ=255) cAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGGTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGt < 1:2476018/148‑1 (MQ=255) aaCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAg < 1:2476021/145‑1 (MQ=255) aaCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAATGGTGGGTCAAAATTGGCCGGTAAggagt > 2:2476149/1‑146 (MQ=255) aCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:2476089/1‑115 (MQ=255) aCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGtt > 1:2476092/1‑117 (MQ=255) aCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGTGTAAAAATTTGACTTTAaggaggc > 2:2476204/1‑148 (MQ=255) aaTACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCa < 2:2476023/149‑1 (MQ=255) aaTACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCa < 1:2476024/149‑1 (MQ=255) tACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACGTGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAATGTTGGGAAAAAAGTTGCCATAAAGGAGGGTCaaa > 2:2476192/1‑149 (MQ=255) tACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaa < 2:2476025/149‑1 (MQ=255) aCCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:2476095/1‑109 (MQ=255) aCCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTa > 1:2476080/1‑112 (MQ=255) ccAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATAGGTGGCTCAAAAGTTGCCTTGTAGGAGGGTCaaaat > 2:2476212/1‑148 (MQ=255) cAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGt < 2:2476027/149‑1 (MQ=255) ttattaTTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGtt > 1:2476064/1‑106 (MQ=255) ttattaTTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAATGGTGGGTAAAATTTTGCCTTGAAGGAGTGTGaaatttttc > 2:2476162/1‑143 (MQ=255) tattatTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGCGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAACTAGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTg < 1:2476029/147‑1 (MQ=255) attattCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg < 2:2476030/149‑1 (MQ=255) tttCAAGCCGTACAACCTGAAATTAAGGAATCTGGCGGGCAATTTTCACGCATTTTCTTTTCCTTAATTTCATGTATTCAGGTGGGTCAAATGTTGCCGTTTTTGGTGGGTCAAATGTATCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTa < 2:2476031/148‑1 (MQ=25) attCACGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGtt > 1:2476202/1‑101 (MQ=255) ttCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTaa > 1:2476257/1‑149 (MQ=255) tCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGt > 1:2476088/1‑98 (MQ=255) aGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGGTGCCGTTAGTGGTGGGGCAAAAGTAGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGtt < 1:2476034/143‑1 (MQ=255) cGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGt > 1:2476221/1‑92 (MQ=255) cGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGt < 2:2476037/149‑1 (MQ=255) agTACAACATGAATTAACGGAATCCTTCTTGCAATTTTACCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGTTGGGTCATATGTTGCCTTTATTTGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGt < 2:2476047/148‑1 (MQ=25) acaacaTGAAATTACGGAATCAGCAGGGCATTTTTCCCGCCTTTTGTTTGCCTTAAATACATGAATTCAGGTGGGTAAAAATAAGCCCTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaa < 2:2476041/149‑1 (MQ=25) caacaTGAAATTACGTAATCCGTCGGGCACTGTTCCAGCCTTATGTATGCCTTTATTCAATGAATTCTGGAGGGTCAAAAGTAGGCTTTACGGGTGGGTCAAATCGCGCCTTTAATGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaa < 2:2476042/149‑1 (MQ=255) caacaTGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:2476096/1‑87 (MQ=255) aacaTGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg < 1:2476043/119‑1 (MQ=255) caTGAAATATCGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:2476163/1‑84 (MQ=255) aTGAAATTACGGAATCCGCATGGCATTTTTCACGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTATTGGTGGGTAAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGtt < 2:2476048/149‑1 (MQ=25) tGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:2476132/1‑82 (MQ=255) aaaTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:2476112/1‑80 (MQ=255) aTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:2476119/1‑78 (MQ=255) tAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:2476109/1‑77 (MQ=255) gAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTGAGTGTTGGGTAAAATGTTGCGTTAAAGGAGGGTCAATTGTTGAAGTATAGGTGTGTCAAATGTTGGCGCGGAAgg > 2:2476210/1‑148 (MQ=255) aaTCCGGCGGGCAAACTTCCCGCCCTATCTATCCCATAAATCAATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTAGGCTTTACGGGTGGGTCAAAAGCTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGaa < 1:2476053/149‑1 (MQ=21) gggCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGCTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTctacaa > 2:2476045/1‑147 (MQ=255) gTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:2476117/1‑56 (MQ=255) cccGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:2476224/1‑53 (MQ=255) cccGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:2476267/1‑53 (MQ=255) cccGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:2476126/1‑53 (MQ=255) cTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGAGGGTCAAAAGTTTCAGTTTAGGTGGCGGAAATTTTTAAGAGTAAGAATTCTACAATTATAATTACTAGGc > 2:2476223/1‑149 (MQ=21) cTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGGGGGTCAAAAGGTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGcc < 1:2476049/94‑1 (MQ=255) ttttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGt > 1:2476258/1‑48 (MQ=255) tCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGt > 1:2476193/1‑45 (MQ=255) ttAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGtttt > 1:2476325/1‑149 (MQ=255) ttCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTa > 1:2476150/1‑35 (MQ=255) ttCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg > 1:2476328/1‑66 (MQ=255) ttCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGAGGGTCAAAAGTTGCAGTTAAGGTGTGGCAAAATTTGACTAGAAAGGATTCGACAATTAAGATTTCTAGGAGGAGGGACTTTTTTAg > 2:2476073/1‑149 (MQ=21) cATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAATGGTGGGTCAAAATTTGCCGTTAAGGAGGGTCAAAATTTGACGTTAAGGTGTCTCAAAATTAGACGAGAAAGAATTCTAAAATTATGATTTATAGGCGACGTGATttttattgact > 2:2476291/1‑142 (MQ=16) aTGAATTCAGGGGGCACAAAAGTAGCCGTTAGGGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTc < 2:2476054/149‑1 (MQ=37) aaTTCTGCTGGGAAAATAGTAGCCTTTTCTGGTGGGTAATTAGATGCCTTTAAGGTGGGTCAAATGTTGCCTTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCcg < 2:2476091/149‑1 (MQ=255) aaTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGt > 1:2476215/1‑44 (MQ=255) ggTGGGTCAAAAGGCGCCCTTAGCGGTGGGTCAAAAGCAGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCcggtcggt < 1:2476055/149‑1 (MQ=38) ttgtcttaaaaTTTGGCTTTATTGGTGGGTAATTTGTTGCCTTTTAGTTGGGTTAAATGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCggtcggtc < 2:2476130/142‑1 (MQ=255) tgtataaaGTAGGCTTTACTGGTGGGTAAATAGTTGCCGTTTAGTTGGGTAAAATGTTTCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATa < 2:2476066/144‑1 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGTTAGTGTTGGGTCAAAAGTTGCCGtt > 1:2476272/1‑40 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTaa > 1:2476059/1‑42 (MQ=255) caaaaaGTAGGCCTTATTGGTGGGTAAAAACTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATaga < 2:2476064/147‑1 (MQ=37) aaaGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGGGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCGACTATTAAGAATTCTAGGAGACGGGAGTTTTTTAGCCTCACTGTCGGTCATagagag > 2:3716298/1‑149 (MQ=38) aaGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTaa > 1:2476298/1‑37 (MQ=255) aaGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAATTTTCCGTTAAGGTGGTGGAAAAGTTGCCGAGTAAGAAGTCTACTATTAAGAAATCTAGGCGACGGTATTTTTTTATCCTACCGGTCGGTCATAGAGAGt > 1:2476242/1‑149 (MQ=37) aGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTc < 2:2476059/149‑1 (MQ=255) gTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGCATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTAGTACATAGCGAGTCg > 2:3091399/1‑149 (MQ=37) ttGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAGAGGTTGCCGCGGAAGCGGTCGGCTATTGAGAATTCTCGGCGACGGGAGTGTTGTAGCCTCCCGCGCGGTCATAGGGAGTCGc > 2:2476231/1‑149 (MQ=21) ttGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCAGAGTAAGAAGTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTAAGACTCCCGGGCGGTCATAGAGAGTCGc > 2:2476230/1‑149 (MQ=37) gCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaa > 1:2476289/1‑42 (MQ=255) gCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTGCAATTAAGAATACTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCt > 2:2476268/1‑149 (MQ=255) ccGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAACGTGGTTCAAAAGTTTAAGAGTAAGAATTCTAGAATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCATAACGGGCGGTCATAGAGAGTctgcta > 2:2476152/1‑144 (MQ=25) cGTTACTGGTGGGTCAAAAGATGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTag < 2:2476060/149‑1 (MQ=255) | GGCTATATACCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAG > U00096/2560824‑2561119 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |