| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | U00096 | = 2560972 | 135 (0.470) | 6 (0.020) | 6/252 | 37.8 | 4.9% | intergenic (+74/‑396) | yffL/yffM | uncharacterized protein YffL/uncharacterized protein YffM |
| ? | U00096 | 2561043 = | 119 (0.480) | intergenic (+145/‑325) | yffL/yffM | uncharacterized protein YffL/uncharacterized protein YffM | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
GAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGATTAGCG > U00096/2560901‑2561190 | gAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAATTTTGCCGTTAAGGTGGGTCACATGTTGACTAGTa > 1:2476131/1‑146 (MQ=38)gAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTGAGTGTTGGGTAAAATGTTGCGTTAAAGGAGGGTCAATTGTTGAAGTATAGGTGTGTCAAATGTTGGCGCGGAAgg > 2:2476210/1‑148 (MQ=255) aaTCCGGCGGGCAAACTTCCCGCCCTATCTATCCCATAAATCAATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTAGGCTTTACGGGTGGGTCAAAAGCTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGaa < 1:2476053/149‑1 (MQ=21) gggCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGCTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTctacaa > 2:2476045/1‑147 (MQ=255) ggCAATCGTACCGCCTTTTCTATGCGTTAATTCCCCGTATTCAGTTGGGCCAATTCTCGCCCTTCTGGGTGGCTAAATAGATGCCTTTAAGTTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTAt < 2:3602051/149‑1 (MQ=16) ccGCCTTTTGTAGTCCTTATTTCCATGAATTCAGGGGTGTAAAAAGACGCCGTTAGTGGTGGGGCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCt < 1:2476050/149‑1 (MQ=25) ccGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGAGGGTCAAAAGTTGCAGTTAAGGTGGCTCAAATTTTGACGAGTAAGAATTCTACAATTAAGAATTCt > 1:2476094/1‑149 (MQ=38) cTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGAGGGTCAAAAGTTTCAGTTTAGGTGGCGGAAATTTTTAAGAGTAAGAATTCTACAATTATAATTACTAGGc > 2:2476223/1‑149 (MQ=21) ttCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGAGGGTCAAAAGTTGCAGTTAAGGTGTGGCAAAATTTGACTAGAAAGGATTCGACAATTAAGATTTCTAGGAGGAGGGACTTTTTTAg > 2:2476073/1‑149 (MQ=21) ccATGAATTCAGGTGGGTAAAAAGATGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGcc < 2:2476052/149‑1 (MQ=255) cATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAATGGTGGGTCAAAATTTGCCGTTAAGGAGGGTCAAAATTTGACGTTAAGGTGTCTCAAAATTAGACGAGAAAGAATTCTAAAATTATGATTTATAGGCGACGTGATttttattgact > 2:2476291/1‑142 (MQ=16) ggcggctCAAAAGCAGCCCGTATTGGTGGGTAAAAAGGAGCCGTTACGGTGGGGCAAACGTTGCCGTTAAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCcggtcggt < 2:2476062/143‑1 (MQ=255) tgtataaaGTAGGCTTTACTGGTGGGTAAATAGTTGCCGTTTAGTTGGGTAAAATGTTTCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATa < 2:2476066/144‑1 (MQ=255) cAAAAGCTGCCCTTACGGGTGGGTCTAATGTTGCCGTTAAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATagag < 2:2476057/149‑1 (MQ=38) aaaaGTTGCCGTTCGTTTGGTGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATagaga < 1:2476058/149‑1 (MQ=38) aaaGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTTAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGGCAAAATTTGCCGAGTAAGAATTCTAATATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGACTATCGGGCGGTCATagagag > 2:2476262/1‑149 (MQ=37) aaGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAATTTTCCGTTAAGGTGGTGGAAAAGTTGCCGAGTAAGAAGTCTACTATTAAGAAATCTAGGCGACGGTATTTTTTTATCCTACCGGTCGGTCATAGAGAGt > 1:2476242/1‑149 (MQ=37) aGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTc < 2:2476059/149‑1 (MQ=255) ttGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCAGAGTAAGAAGTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTAAGACTCCCGGGCGGTCATAGAGAGTCGc > 2:2476230/1‑149 (MQ=37) ggctttACTGGTGGGTAATTTGTTGCCTTTTAGGTGGGTCAAATCTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCt < 2:2476096/145‑1 (MQ=255) gCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTGCAATTAAGAATACTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCt > 2:2476268/1‑149 (MQ=255) ccGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCg > 1:2476295/1‑145 (MQ=255) ccGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAACGTGGTTCAAAAGTTTAAGAGTAAGAATTCTAGAATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCATAACGGGCGGTCATAGAGAGTctgcta > 2:2476152/1‑144 (MQ=25) tttttgttggGTCACTAGTTGCCTTTAATGTGGGTCAAATGTTGCGGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTagag < 1:2476074/142‑1 (MQ=38) ttAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCcggtcgg > 1:3104496/1‑129 (MQ=255) tAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTCGGACAAAATTTGCAGAGTAAGAATTCTAGAATTAAGAATACTAGGCGACGGGACTTTTTTAGAATCACGGAGGGTCATAGAGAGTCGCCTAGCGt > 2:2476241/1‑149 (MQ=25) ttgtggGTAAAAATTTGCCTTTATTGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTaa < 2:2476108/147‑1 (MQ=38) tggtggGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAATTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTATTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTaa > 2:2476275/1‑149 (MQ=255) tggGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACa > 1:2476232/1‑149 (MQ=255) gggTAATAAGCTGCCTTTACGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACag < 2:2476099/149‑1 (MQ=39) ttGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAattatt < 2:2476078/149‑1 (MQ=255) ttGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACTGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAattatt > 1:2476286/1‑149 (MQ=255) tGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTAttt > 1:2476323/1‑149 (MQ=255) gCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTAttt > 1:2476276/1‑148 (MQ=255) ccGTTTAGTTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcg < 2:2476080/149‑1 (MQ=255) ccGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCg < 1:2476081/81‑1 (MQ=255) cGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcgc > 2:2476246/1‑149 (MQ=255) gTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcgcc > 2:2476264/1‑149 (MQ=255) ttAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGttt < 2:2476083/88‑1 (MQ=255) ttAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcgccg > 2:2476254/1‑149 (MQ=255) tAAGGTGGGTAAAAAGCTGCCGTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcgccgc < 2:2476092/149‑1 (MQ=255) ttGGGTCAAAAGTTTCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGa < 2:2476110/148‑1 (MQ=255) gTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGa > 1:2476293/1‑149 (MQ=255) tGGGTCAAAAGTTTCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGa < 1:2476115/47‑1 (MQ=255) gggTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATa > 2:2520724/1‑149 (MQ=255) gacAATAGTAGCCGTTAAGGTGGCTCAAAAGTAGCCGAGTAAGAATACTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCAACAGAAAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAgg > 2:2476308/3‑149 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTc < 1:2476124/149‑1 (MQ=255) aaaGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCgg > 1:2476301/1‑149 (MQ=255) aaGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGc < 2:2476126/149‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCgg > 1:2476283/1‑148 (MQ=255) aGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCt < 2:2476128/149‑1 (MQ=255) gTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGCATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTg > 2:2476366/1‑149 (MQ=255) gCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGtt < 2:2476131/149‑1 (MQ=255) ctttAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTa < 1:2476135/42‑1 (MQ=255) gTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTa < 1:2476138/52‑1 (MQ=255) gTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACagaa < 1:2476137/113‑1 (MQ=255) ttAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCa < 1:2476151/85‑1 (MQ=255) ttAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATaga < 1:2476148/89‑1 (MQ=255) ttAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGa > 1:2476351/1‑149 (MQ=255) ttAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGa > 1:2476341/1‑149 (MQ=255) ttAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGa > 2:2476379/1‑149 (MQ=255) ttAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGa < 1:2476153/149‑1 (MQ=255) tAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAg > 1:2476250/1‑149 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTAtt < 1:2476165/38‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACg < 1:2476156/55‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGtttttt < 1:2476188/65‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGtttttt < 1:2476181/65‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGtttttt < 1:2476167/65‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGtt < 1:2476184/61‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCcggtcgg < 1:2476176/79‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTaga < 1:2476186/98‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAgaagaa < 1:2476172/112‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAattatt < 1:2476177/117‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGtt < 1:2476162/142‑1 (MQ=255) ggTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGcc < 1:2476192/93‑1 (MQ=255) ggTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTGTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCAt < 1:2476190/149‑1 (MQ=255) gTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCAtt < 2:2476193/149‑1 (MQ=255) gTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCAtt > 1:2476316/1‑149 (MQ=255) gggTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTa < 1:2476197/35‑1 (MQ=255) gggTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATagaga < 1:2476195/84‑1 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCgccgcc < 1:2476200/119‑1 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCg < 1:2476201/139‑1 (MQ=255) tCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCa < 1:2476204/149‑1 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTaa < 1:2476206/95‑1 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACagaa < 1:2476208/101‑1 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCAt < 1:2476210/149‑1 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCAt > 1:2476310/1‑149 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCAt > 1:2476299/1‑149 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGATCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTACCCAt > 2:2476329/1‑149 (MQ=255) aaaaGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATg > 2:2476340/1‑149 (MQ=255) aaGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCt > 1:2476390/1‑149 (MQ=255) aGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCt < 1:2476213/148‑1 (MQ=255) ttGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGAt < 1:2476216/149‑1 (MQ=255) ttGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGAt < 2:2476215/149‑1 (MQ=255) tGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGAtt > 2:2476292/1‑149 (MQ=255) gCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAatta < 1:2476219/99‑1 (MQ=255) cGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGATTAgc < 2:2476221/149‑1 (MQ=255) cGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGATTAgc < 1:2476222/149‑1 (MQ=255) cGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGATTAgc > 2:2476355/1‑149 (MQ=255) cGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGATTAgc > 1:2476326/1‑149 (MQ=255) | GAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGATTAGCG > U00096/2560901‑2561190 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |