Predicted mutation | ||||||
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MC JC | U00096 | 3,153,487 | Δ15 bp | intergenic (+64/‑62) | metC → / → yghB | cystathionine beta‑lyase/L‑cysteine desulfhydrase/alanine racemase/DedA family protein YghB |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | U00096 | 3153487 | 3153501 | 15 | 251 [0] | [0] 252 | metC/yghB | cystathionine beta‑lyase/L‑cysteine desulfhydrase/alanine racemase/DedA family protein YghB |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | U00096 | = 3153486 | 0 (0.000) | 240 (1.120) | 157/280 | 0.0 | 100% | intergenic (+63/‑77) | metC/yghB | cystathionine beta‑lyase/L‑cysteine desulfhydrase/alanine racemase/DedA family protein YghB |
? | U00096 | 3153502 = | 0 (0.000) | intergenic (+79/‑61) | metC/yghB | cystathionine beta‑lyase/L‑cysteine desulfhydrase/alanine racemase/DedA family protein YghB |
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
GCATATTGGTCTGGAAGATGTCGACGATCTGATTGCCGATCTGGACGCCGGTTTTGCGCGAATTGTATAACATTGCCACTTTTGGACAATTTTGCAGACATTTTATTGTGAAAAGTCTTAAATTGTTGCGTCCGGGATCAAGGCGTCCCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCGCGCTGGCGGATCCTCATATTGTTAGCGTTGTTTACT > U00096/3153354‑3153650 | gaccttgattcgcctgcatattggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccc < 2:2399910‑M2/1‑1 (MQ=255) gaccttgattcgcctgcatattggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccc < 2:2399907‑M2/1‑1 (MQ=255) cttgattcgcctgcattttggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaaatttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGa > 2:2400031‑M2/146‑149 (MQ=255) attcgcctgcatattggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattatataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGAt > 1:2400084‑M2/142‑149 (MQ=255) ttcgcctgcatattggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGAtt > 1:2400098‑M2/141‑149 (MQ=255) ttcgcctgcatattggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGAtt > 1:2400001‑M2/141‑149 (MQ=255) ttcgcctgcatattggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggatttgcgcgaatactataacattgccacttttggacaattttgaagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGAtt > 1:2400073‑M2/141‑149 (MQ=255) cgcctgcatattggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCa < 1:2399915‑M2/11‑1 (MQ=255) cgcctgcatattggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCa < 2:2399916‑M2/11‑1 (MQ=255) cctgcatattggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataaccttgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAgg > 2:2400070‑M2/137‑149 (MQ=255) tgcatattggtctggaagatgtcgacgttctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAg > 1:2400062‑M2/135‑149 (MQ=255) tgcatattggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAg < 2:2399920‑M2/15‑1 (MQ=255) atattggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTAc > 2:2400024‑M2/132‑149 (MQ=255) atattggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTAc < 2:2399923‑M2/18‑1 (MQ=255) tattggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACa < 1:2399925‑M2/19‑1 (MQ=255) attggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACaa > 1:2400095‑M2/130‑149 (MQ=255) ttggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAAt > 1:2400035‑M2/129‑149 (MQ=255) tggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATa < 2:2399927‑M2/22‑1 (MQ=255) 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agatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATaa > 1:2400077‑M2/119‑149 (MQ=255) atgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATaaa < 1:2399936‑M2/32‑1 (MQ=255) atgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAg < 1:2399938‑M2/33‑1 (MQ=255) cgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccTGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCt < 1:2399943‑M2/36‑1 (MQ=255) cgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCtt < 2:2399942‑M2/37‑1 (MQ=255) gacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTa > 1:2400109‑M2/112‑149 (MQ=255) acgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTaa < 2:2399947‑M2/39‑1 (MQ=255) acgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTaa < 2:2399949‑M2/39‑1 (MQ=255) acgatcggattgccgatctggacgccggttatgcgagaattgtataacattgtcacttttggagaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaaatgttgcgtcaCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTaa > 2:2400059‑M2/111‑149 (MQ=255) tctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCa > 1:2399950‑M2/107‑117 (MQ=255) 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tttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCgcgc > 1:2400089‑M2/33‑148 (MQ=255) tttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCGCGCt < 1:2400017‑M2/117‑1 (MQ=255) tattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCGCGCTgg < 2:2400019‑M2/119‑1 (MQ=255) ttgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCGCGCTGGCg < 1:2400020‑M2/121‑1 (MQ=255) gaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCCTGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACCCGACTTTGCCGCGCTGGCGGATc > 2:2400133‑M2/25‑149 (MQ=255) 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taaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCGCGCTGGCGGATCCTCATAtt > 1:2400028‑M2/16‑148 (MQ=255) taaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCGCGCTGGCGGATCCTCATATTg < 1:2400031‑M2/134‑1 (MQ=255) aattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCGCGCTGGCGGATCCTCATATTGtt > 2:2400205‑M2/14‑149 (MQ=255) attgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAACGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCGCGCTGGCGGATCCTCATATTGTTa > 2:2400026‑M2/13‑149 (MQ=255) attgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCGCGCTGGCGGATCCTCATATTGTTa < 2:2400035‑M2/137‑1 (MQ=255) 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cGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCGCGCTGGCGGATCCTCATATTGTTAGCGTTGTTTACt > 2:2400085/1‑149 (MQ=255) | GCATATTGGTCTGGAAGATGTCGACGATCTGATTGCCGATCTGGACGCCGGTTTTGCGCGAATTGTATAACATTGCCACTTTTGGACAATTTTGCAGACATTTTATTGTGAAAAGTCTTAAATTGTTGCGTCCGGGATCAAGGCGTCCCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCGCGCTGGCGGATCCTCATATTGTTAGCGTTGTTTACT > U00096/3153354‑3153650 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |