| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | AP012306 | 746,309 | (TAATGTAA)1→2 | intergenic (‑188/‑97) | ybjG ← / → cmr | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux system protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP012306 | = 746297 | 0 (0.000) | 345 (1.160) +GTAATAAT |
183/258 | 0.1 | 100% | intergenic (‑176/‑109) | ybjG/cmr | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux system protein |
| ? | AP012306 | 746298 = | 0 (0.000) | intergenic (‑177/‑108) | ybjG/cmr | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux system protein | |||||
Only 100 of 365 total aligned reads displayed.
GAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCTTCCGGTGCCAGGCTTGGACGTCAG > AP012306/746150‑746447 | acaggcaagtcgttgagaataaagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatgt < 1:3244393‑M2/2‑1 (MQ=255) aggcaagtcgttgagaataaagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatgtaa < 1:3732475‑M2/4‑1 (MQ=255) aggcaagtcgttgagaataaagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatgtaa > 1:1572162‑M2/147‑150 (MQ=255) ggcaagtcgttgagaataaagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatgtaat < 1:3137756‑M2/5‑1 (MQ=255) gcaagtcgttgagaataaagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatgtaata > 1:353424‑M2/145‑150 (MQ=255) gcaagtcgttgagaataaagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatgtaata < 1:1852170‑M2/6‑1 (MQ=255) aagtcgttgagaataaagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatgtaataat < 2:1619650‑M2/8‑1 (MQ=255) aagtcgttgagaataaagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatgtaataat > 1:776769‑M2/143‑150 (MQ=255) gtcgttgagaataaagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatgtaataatgt < 1:499058‑M2/10‑1 (MQ=255) tcgttgagaataaagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatgtaataatgta > 2:1550960‑M2/140‑150 (MQ=255) gttgagaataaagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAg > 1:2975947‑M2/138‑150 (MQ=255) agaataaagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAAtg > 2:2267606‑M2/134‑150 (MQ=255) gaataaagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAAtgt < 2:3492391‑M2/18‑1 (MQ=255) taaagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCt < 2:1340144‑M2/21‑1 (MQ=255) aaagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCtt < 2:3605912‑M2/22‑1 (MQ=255) aaagggcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgcgcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCtt > 2:4169107‑M2/129‑150 (MQ=255) aagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTa < 1:4269619‑M2/23‑1 (MQ=255) aagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTa < 2:2174888‑M2/23‑1 (MQ=255) aagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTa < 2:3851135‑M2/23‑1 (MQ=255) aagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTa < 2:3945688‑M2/23‑1 (MQ=255) agtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTaa < 1:181380‑M2/24‑1 (MQ=255) gtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAAc > 2:1808409‑M2/126‑150 (MQ=255) gtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAAc < 2:3968027‑M2/25‑1 (MQ=255) tgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAAcc < 2:1964537‑M2/26‑1 (MQ=255) aggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTg < 2:4237918‑M2/29‑1 (MQ=255) gttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGt < 1:1769114‑M2/31‑1 (MQ=255) ctgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGc > 1:1783925‑M2/114‑150 (MQ=255) gggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTa < 1:4145359‑M2/39‑1 (MQ=255) taaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACaa < 2:503678‑M2/42‑1 (MQ=255) taaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACaa > 2:2739144‑M2/109‑150 (MQ=255) agcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAAt < 1:3922625‑M2/45‑1 (MQ=255) agcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAAt > 1:1705737‑M2/106‑150 (MQ=255) cggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTc < 2:2019364‑M2/47‑1 (MQ=255) cggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTc > 2:1647695‑M2/104‑150 (MQ=255) catcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCt > 1:3345059‑M2/101‑150 (MQ=255) catcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCt < 1:1248229‑M2/50‑1 (MQ=255) tcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCttt < 2:2181454‑M2/52‑1 (MQ=255) tcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTtctc < 2:1245727‑M2/55‑1 (MQ=255) cttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCg < 1:1655107‑M2/56‑1 (MQ=255) cttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCg < 2:3126300‑M2/56‑1 (MQ=255) ttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGt < 1:331237‑M2/57‑1 (MQ=255) tatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGtt < 1:681192‑M2/58‑1 (MQ=255) atttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTa < 1:2864431‑M2/59‑1 (MQ=255) tttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAg < 2:1395497‑M2/60‑1 (MQ=255) tcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTgcgc < 2:4033070‑M2/66‑1 (MQ=255) tcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTgcgc < 2:3037238‑M2/66‑1 (MQ=255) tcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTgcgc > 2:2131491‑M2/85‑150 (MQ=255) cctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTttatta < 2:2656297‑M2/74‑1 (MQ=255) ctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTaa < 1:2104351‑M2/75‑1 (MQ=255) tgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTaaa < 1:3846788‑M2/76‑1 (MQ=255) gtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAAc > 1:2670826‑M2/74‑150 (MQ=255) gtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAAc < 1:447‑M2/77‑1 (MQ=255) tttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCCCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAAct < 2:915287‑M2/78‑1 (MQ=255) acggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTg < 2:3443502‑M2/81‑1 (MQ=255) tgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGcgcg < 1:1024872‑M2/85‑1 (MQ=255) gggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGa > 2:1369800‑M2/65‑150 (MQ=255) ggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGat > 1:1126116‑M2/64‑150 (MQ=255) attgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGattatt < 2:3680164‑M2/91‑1 (MQ=255) ttgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGattatta < 1:3269553‑M2/92‑1 (MQ=255) tgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCTTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGattattat > 1:1867131‑M2/58‑150 (MQ=255) gtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGattattatt < 1:231499‑M2/94‑1 (MQ=255) taacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTg > 2:146140‑M2/56‑150 (MQ=255) aacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTgg < 1:886085‑M2/96‑1 (MQ=255) acgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGc > 2:794202‑M2/54‑150 (MQ=255) acgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGc < 1:1974816‑M2/97‑1 (MQ=255) cgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCg < 2:3576226‑M2/98‑1 (MQ=255) cgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCg < 2:624465‑M2/98‑1 (MQ=255) ggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCgaa < 1:2394298‑M2/100‑1 (MQ=255) gcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCgaag > 2:2829137‑M2/50‑150 (MQ=255) gcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCgaag < 2:477090‑M2/101‑1 (MQ=255) gcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCgaag < 2:1011163‑M2/101‑1 (MQ=255) cataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCgaaga < 1:1505642‑M2/102‑1 (MQ=255) cataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCgaaga < 1:4043738‑M2/102‑1 (MQ=255) ataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCgaagaa > 2:545896‑M2/48‑150 (MQ=255) taggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGaaa > 1:320041‑M2/47‑150 (MQ=255) ggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAAtt < 1:2705724‑M2/106‑1 (MQ=255) gttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATtg < 1:2832146‑M2/107‑1 (MQ=255) aaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATtgcat > 1:343700‑M2/41‑150 (MQ=255) aaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATtgcat < 2:173309‑M2/110‑1 (MQ=255) ataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATtgcatgc < 1:3668033‑M2/112‑1 (MQ=255) acttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAaaat < 2:3327242‑M2/117‑1 (MQ=255) acttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAaaat < 1:2421783‑M2/117‑1 (MQ=255) acttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAaaat < 2:1277630‑M2/117‑1 (MQ=255) agaaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTa < 2:365464‑M2/123‑1 (MQ=255) aaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGc < 1:2630644‑M2/125‑1 (MQ=255) aaagcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTCTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGc < 1:489872‑M2/125‑1 (MQ=255) agcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCtt < 1:1318753‑M2/127‑1 (MQ=255) agcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCtt < 2:3788494‑M2/127‑1 (MQ=255) agcgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCtt < 2:2416467‑M2/127‑1 (MQ=255) cgtagctatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCTTcc < 2:2376496‑M2/129‑1 (MQ=255) tatactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCTTCCGGTGcc > 2:1508467‑M2/16‑150 (MQ=255) tactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCTTCCGGTGCCAg < 1:2800897‑M2/137‑1 (MQ=255) tactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCTTCCGGTGCCAg < 2:2960131‑M2/137‑1 (MQ=255) tactcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCTTCCGGTGCCAg > 2:1183929‑M2/14‑150 (MQ=255) tcgtaataatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTGAGCTACAAAATTCGCTTTCTGGTTAGCGGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGATTCCGGTGCCAGGCt > 2:3151540‑M2/11‑150 (MQ=255) taatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCTTCCGGTGCCAGGCTTGGACg < 1:219331‑M2/146‑1 (MQ=255) taatGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCTTCCGGTGCCAGGCTTGGACg < 2:2066714‑M2/146‑1 (MQ=255) atGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCTTCCGGTGCCAGGCTTGGACGTc > 2:290959‑M2/3‑150 (MQ=255) atGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCTTCCGGTGCCAGGCTTGGACGTc < 2:2515486‑M2/148‑1 (MQ=255) gTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCTTCCGGTGCCAGGCTTGGACGTCAg < 2:3531938/150‑1 (MQ=255) | GAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCTTCCGGTGCCAGGCTTGGACGTCAG > AP012306/746150‑746447 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |