New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 466 total aligned reads displayed.
TCATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGAATGCAGCCATTCAGATTAGCCCTTACATCTCCCCAAAACTGAACGTGCGAGTTATTGAGGGTGCATGCTGCACTCCACACCAGAGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGGTGTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAG > AP012306/2245821‑2246118 | tCATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGAATGCAGCCATTCAGATTAGCCCTTACATCTCCCCAAAACTGAACGTGCGAGTTATTGAGGGTGCATGCTGCACTCCACACCAGAGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTgg < 2:629184/150‑1 (MQ=255) cATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGAATGCAGCCATTCAGATTAGCCCTTACATCTCCCCAAAACTGAACGTGCGAGTTATTGAGGGTGCATGCTGCACTCCACACCAGAGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGc > 2:383501/1‑150 (MQ=255) aTTCGTTTTTCCTTAAACAAGGAATGCAGCCATTCAGATTAGCCCTTACATCTCCCCAAAACTGAACGTGCGAGTTATTGAGGGTGCATGCTGCACTCCACACCAGAGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCa > 1:2917102/1‑150 (MQ=255) 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tttttCCTTAAACAAGGAATGCAGCCATTCAGATTAGCCCTTACATCTCCCCAAAACTGAACGTGCGAGTTATTGAGGGTGCATGCTGCACTCCACACCAGAGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGgtg > 1:375299/1‑150 (MQ=255) tttttCCTTAAACAAGGAATGCAGCCATTCAGATTAGCCCTTACATCTCCCCAAAACTGAACGTGCGAGTTATTGAGGGTGCATGCTGCACTCCACACCAGAGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGgtg < 2:3535601/150‑1 (MQ=255) ttttCCTTAAACAAGGAATGCAGCCATTCAGATTAGCCCTTACATCTCCCCAAAACTGAACGTGCGAGTTATTGAGGGTGCATGCTGCACTCCACACCAGAGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGgtgt > 1:1072439/1‑150 (MQ=255) ttttCCTTAAACAAGGAATGCAGCCATTCAGATTAGCCCTTACATCTCCCCAAAACTGAACGTGCGAGTTATTGAGGGTGCATGCTGCACTCCACACCAGAGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGgtgt > 1:1840527/1‑150 (MQ=255) tttCCTTAAACAAGGAATGCAGCCATTCAGATTAGCCCTTACATCTCCCCAAAACTGAACGTGCGAGTTATTGAGGGTGCATGCTGCACTCCACACCAGAGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGGTGTa < 1:804826/150‑1 (MQ=255) 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ggCATGGTGTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAg > 1:3723789/1‑150 (MQ=255) ggCATGGTGTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAg < 1:2775070/150‑1 (MQ=255) | TCATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGAATGCAGCCATTCAGATTAGCCCTTACATCTCCCCAAAACTGAACGTGCGAGTTATTGAGGGTGCATGCTGCACTCCACACCAGAGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGGTGTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAG > AP012306/2245821‑2246118 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |