New junction evidence | |||||||||||
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Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
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Only 100 of 466 total aligned reads displayed.
CCTTAAACAAGGAATGCAGCCATTCAGATTAGCCCTTACATCTCCCCAAAACTGAACGTGCGAGTTATTGAGGGTGCATGCTGCACTCCACACCAGAGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGGTGTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGA > AP012306/2245833‑2246131 | ccTTAAACAAGGAATGCAGCCATTCAGATTAGCCCTTACATCTCCCCAAAACTGAACGTGCGAGTTATTGAGGGTGCATGCTGCACTCCACACCAGAGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGGTGTAAAg < 2:1811173/150‑1 (MQ=255) ccTTAAACAAGGAATGCAGCCATTCAGATTAGCCCTTACATCTCCCCAAAACTGAACGTGCGAGTTATTGAGGGTGCATGCTGCACTCCACACCAGAGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGGTGTAAAg > 1:1431515/1‑150 (MQ=255) tAAACAAGGAATGCAGCCATTCAGATTAGCCCTTACATCTCCCCAAAACTGAACGTGCGAGTTATTGAGGGTGCATGCTGCACTCCACACCAGAGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGGTGTAAAGcac > 1:1969325/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |