| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| MC JC | AP012306 | 87,679 | (GCG)4→3 | coding (1442‑1444/1767 nt) | ftsI → | transpeptidase |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | AP012306 | 87669 | 87671 | 3 | 255 [0] | [0] 259 | ftsI | transpeptidase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AP012306 | 87672 = | 0 (0.000) | 233 (0.810) | 153/278 | 0.6 | 100% | coding (1435/1767 nt) | ftsI | transpeptidase |
| ? | AP012306 | = 87668 | 0 (0.000) | coding (1431/1767 nt) | ftsI | transpeptidase | |||||
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
AACAACAACCAGCGCGAAGCGCGGCTGACTCGCAGGCGCAACGCCTGCGGTATAAGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP012306/87830‑87672‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccgccTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGTAGACTCGCGCTA < AP012306/87668‑87520 AACAACAACCAGCGCGAAGCGCGGCTGACTTGCAGGCGCAACGCCTGCGGTATAAGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCAC < 2:2052286/150‑1AACAACAACCAGCGCGAAGCGCGGCTGACTCGCAGGCGCAACGCCTGCGGTATAAGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCAC > 1:4162098/1‑150 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1:3823099/1‑150 AAGCGCGGCTGACTCGCAGGCGCAACGCCTGCGGTATAAGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGC < 2:3129149/150‑1 AAGCGCGGCTGACTCGCAGGCGCAACGCCTGCGGTATAAGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGC < 1:2033848/150‑1 AAGCGCGGCTGACTCGCAGGCGCAACGCCTGCGGTATAAGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGC > 1:2749363/1‑150 GCGCGGCTGACTCGCAGGCGCAACGCCTGCGGTATAAGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGC < 1:635336/150‑1 CGCGGCTGACTCGCAGGCGCAACGCCTGCGGTATAAGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCC < 1:2439165/150‑1 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2:296061/1‑150 GATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGC < 2:2734991/150‑1 GATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGC < 2:2405552/150‑1 ATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCC > 2:673947/1‑150 TAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCG > 1:1391243/1‑150 CCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAG < 2:183717/150‑1 TTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCT > 1:3987337/1‑150 TTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCT > 2:3735045/1‑150 GCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATA > 2:278795/1‑150 GCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATA > 2:4170452/1‑150 CCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAG > 2:2656398/1‑150 CGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGT < 2:2620274/150‑1 GCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTT < 1:1645619/150‑1 CCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTG < 1:1233070/150‑1 CCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGCCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTG > 1:707069/1‑150 TTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCG > 1:851814/1‑150 TCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGT < 1:3322889/150‑1 CACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGTA > 1:1318666/1‑150 CACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGTA > 2:672151/1‑150 ACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGTAG < 1:2303803/150‑1 GCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGTAGAC < 1:3913334/150‑1 CCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGTAGACT < 1:2901266/150‑1 CCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGTAGACT > 2:503012/1‑150 CCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGTAGACTCGC < 1:3115944/150‑1 CCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGTAGACTCGCGCT > 2:856981/1‑150 CTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGTAGACTCGCGCTA < 2:3986417/150‑1 CTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGTAGACTCGCGCTA > 2:1624753/1‑150 AACAACAACCAGCGCGAAGCGCGGCTGACTCGCAGGCGCAACGCCTGCGGTATAAGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP012306/87830‑87672‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccgccTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGTAGACTCGCGCTA < AP012306/87668‑87520 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |