| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | AP012306 | 3,395,364 | Δ14 bp | intergenic (+61/‑67) | trxA → / → rhoL | thioredoxin 1/rho operon leader peptide |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | AP012306 | 3395364 | 3395377 | 14 | 363 [0] | [0] 361 | trxA/rhoL | thioredoxin 1/rho operon leader peptide |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AP012306 | = 3395363 | 0 (0.000) | 360 (1.160) | 196/298 | 0.1 | 100% | intergenic (+60/‑81) | trxA/rhoL | thioredoxin 1/rho operon leader peptide |
| ? | AP012306 | 3395378 = | 0 (0.000) | intergenic (+75/‑66) | trxA/rhoL | thioredoxin 1/rho operon leader peptide | |||||
Only 100 of 361 total aligned reads displayed.
GAAGTGGCGGCAACCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTGCGTACTCTCCTGTGACCAGGCAGCGA > AP012306/3395229‑3395527 | tgttcaaaaacggtgaagtggcggcaaccaaagtgggtgcactgtctaaaggtcagttgaaagagttcctcgacgctaacctggcgtaagggaatttcatgttcgggtgccccgtcgctaaaaactggacgcccggcgtgagtcatgctt > 1:1890054‑M2/150‑150 (MQ=255) ttcaaaaacggtgaagtggcggcaaccaaagtgggtgcactgtctaaaggtcagttgaaagagttcctcgacgctaacctggcgtaagggaatttcatgttcgggtgccccgtcgctaaaaactggacgcccggcgtgagtcatgctTTc < 2:335589‑M2/3‑1 (MQ=255) tcaaaaacggtgaagtggcggcaaccaaagtgggtgcactgtctaaaggtcagttgaaagagttcctcgacgctaacctggcgtaagggaatttcatgttcgggtgccccgtcgctaaaaactggacgcccggcgtgagtcatgctTTCg > 1:2352432‑M2/147‑150 (MQ=255) tcaaaaacggtgaagtggcggcaaccaaagtgggtgcactgtctaaaggtcagttgaaagagttcctcgacgctaacctggcgtaagggaatttcatgttcgggtgccccgtcgctaaaaactggacgcccggcgtgagtcatgctTTCg > 1:3718837‑M2/147‑150 (MQ=255) aaaacggtgaagtggcggcaaccaaagtgggtgcactgtctaaaggtcagttgaaagagttcctcgacgctaacctggcgtaagggaatttcatgttcgggtgccccgtcgctaaaaactggacgcccggcgtgagtcatgctTTCGTAt < 1:4197552‑M2/7‑1 (MQ=255) aaaacggtgaagtggcggcaaccaaagtgggtgcactgtctaaaggtcagttgaaagagttcctcgacgctaacctggcgtaagggaatttcatgttcgggtgccccgtcgctaaaaactggacgcccggcgtgagtcatgctTTCGTAt > 1:523478‑M2/144‑150 (MQ=255) aacggtgaagtggcggcaaccaaagtgggtgcactgtctaaaggtcagttgaaagagttcctcgacgctaacctggcgtaagggaatttcatgttcgggtgccccgtcgctaaaaactggacgcccggcgtgagtcatgctTTCGTATTa < 1:1284570‑M2/9‑1 (MQ=255) aacggtgaagtggcggcaaccaaagtgggtgcactgtctaaaggtcagttgaaagagttcctcgacgctaacctggcgtaagggaatttcatgttcgggtgccccgtcgctaaaaactggacgcccggcgtgagtcatgctTTCGTATTa < 1:677443‑M2/9‑1 (MQ=255) acggtgaagtggcggcaaccaaagtgggtgcactgtctaaaggtcagttgaaagagttcctcgacgctaacctggcgtaagggaatttcatgttcgggtgccccgtcgctaaaaactggacgcccggcgtgagtcatgctTTCGTATTaa > 1:2877147‑M2/141‑150 (MQ=255) acggtgaagtggcggcaaccaaagtgggtgcactgtctaaaggtcagttgaaagagttcctcgacgctaacctggcgtaagggaatttcatgttcgggtgccccgtcgctaaaaactggacgcccggcgtgagtcatgctTTCGTATTaa > 1:3379476‑M2/141‑150 (MQ=255) acggtgaagtggcggcaaccaaagtgggtgcactgtctaaaggtcagttgaaagagttcctcgacgctaacctggcgtaagggaatttcatgttcgggtgccccgtcgctaaaaactggacgcccggcgtgagtcatgctTTCGTATTaa < 2:1781647‑M2/10‑1 (MQ=255) cggtgaagtggcggcaaccaaagtgggtgcactgtctaaaggtcagttgaaagagttcctcgacgctaacctggcgtaagggaatttcatgttcgggtgccccgtcgctaaaaactggacgcccggcgtgagtcatgctTTCGTATTaaa > 1:1488504‑M2/140‑150 (MQ=255) ggtgaagtggcggcaaccaaagtgggtgcactgtctaaaggtcagttgaaagagttcctcgacgctaacctggcgtaagggaatttcatgttcgggtgccccgtcgctaaaaactggacgcccggcgtgagtcatgctTTCGTATTAAAc > 1:377511‑M2/139‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |