| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP012306 | 955967 = | 328 (0.910) | 5 (0.010) | 5/292 | 18.9 | 1.5% | intergenic (+2096/‑575) | mdoG/yceK | glucan biosynthesis protein, periplasmic/predicted lipoprotein |
| ? | AP012306 | 955990 = | 332 (0.940) | intergenic (+2119/‑552) | mdoG/yceK | glucan biosynthesis protein, periplasmic/predicted lipoprotein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 333 total aligned reads displayed.
TTAGGGTTAGTGTGGGCTGTTGGGATGGCGTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAACCGCAATGGC > AP012306/955818‑956116 | gTTAGTGTGGGCTGTTGGGATGGCGTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGtt < 1:4322539/150‑1 (MQ=255) tAGTGTGGGCTGTTGGGATGGCGTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTcc < 1:3081543/150‑1 (MQ=255) ggCTGTTGGGATGGCGTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATccc < 2:2413487/150‑1 (MQ=255) cTGTTGGGATGGCGTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCgg < 2:510932/150‑1 (MQ=255) gTTGGGATGGCGTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGaa < 2:4398919/150‑1 (MQ=255) gggATGGCGTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAagag > 1:4771428/1‑150 (MQ=255) ggATGGCGTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGt > 1:3655521/1‑150 (MQ=255) ggATGGCGTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGt > 2:2365572/1‑150 (MQ=255) gATGGCGTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTa < 2:4053068/150‑1 (MQ=255) aTGGCGTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTAt < 1:4870256/150‑1 (MQ=255) tGGCGTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGGAtt > 2:2190146/1‑150 (MQ=255) cGTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTcgc < 1:4436994/150‑1 (MQ=255) gCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTcgccgcc > 1:3584662/1‑150 (MQ=255) aTCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAgg < 1:3940192/150‑1 (MQ=255) cTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTg < 1:3340156/150‑1 (MQ=255) tGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGc > 1:4708310/1‑150 (MQ=255) tGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGc > 2:120696/1‑150 (MQ=255) gCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCt < 1:746193/150‑1 (MQ=255) gTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTgg > 1:100796/1‑150 (MQ=255) gTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTgg > 2:2069481/1‑150 (MQ=255) tCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTg > 2:3440641/1‑150 (MQ=255) gTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATAc > 2:1032463/1‑150 (MQ=255) ttCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATAcc > 1:377749/1‑150 (MQ=255) ttCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATAcc < 1:1987880/150‑1 (MQ=255) tCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCg > 2:1643777/1‑150 (MQ=255) tggctggcACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGAt > 1:543166/1‑150 (MQ=255) ggctggcACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATc < 2:2909520/150‑1 (MQ=255) gctggcACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCg > 2:668112/1‑150 (MQ=255) tggcACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGt < 2:2669371/150‑1 (MQ=255) gcACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTc > 1:4111922/1‑150 (MQ=255) cACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTcc < 1:1310463/150‑1 (MQ=255) ccGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCtt > 2:1502741/1‑150 (MQ=255) ctaTTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTg > 1:1393977/3‑150 (MQ=255) aTTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTgag > 2:2442379/1‑150 (MQ=255) aTTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTgag > 1:4595038/1‑150 (MQ=255) tcttctCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGa < 1:1696931/150‑1 (MQ=255) tcGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGt < 2:335744/150‑1 (MQ=255) tcGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGt < 1:2110733/150‑1 (MQ=255) tGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAAc > 1:192801/1‑150 (MQ=255) tGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAAc < 1:2521265/150‑1 (MQ=255) aTCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGc < 1:2925622/150‑1 (MQ=255) aTCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGc < 1:4525322/150‑1 (MQ=255) cTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATACCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTcc > 1:2831205/1‑150 (MQ=255) 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aCTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAACCGCAATGGc > 2:1377801/1‑150 (MQ=255) aCTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAACCGCAATGGc > 1:838373/1‑150 (MQ=255) | TTAGGGTTAGTGTGGGCTGTTGGGATGGCGTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAACCGCAATGGC > AP012306/955818‑956116 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |