New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AP012306 | 955967 = | 328 (0.910) | 5 (0.010) | 5/292 | 18.9 | 1.5% | intergenic (+2096/‑575) | mdoG/yceK | glucan biosynthesis protein, periplasmic/predicted lipoprotein |
? | AP012306 | 955990 = | 332 (0.940) | intergenic (+2119/‑552) | mdoG/yceK | glucan biosynthesis protein, periplasmic/predicted lipoprotein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 339 total aligned reads displayed.
GATGGCGTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAACCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGT > AP012306/955841‑956138 | gATGGCGTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTa < 2:4053068/150‑1 (MQ=255) tGGCGTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTAtt > 2:4759406/1‑150 (MQ=255) ggCGTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTc < 1:4452822/150‑1 (MQ=255) gTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTcgcc > 1:344635/1‑150 (MQ=255) gTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTcgcc > 1:4667403/1‑150 (MQ=255) gCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTcgccgcc > 1:3584662/1‑150 (MQ=255) aTCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAgg < 1:3940192/150‑1 (MQ=255) gTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTgg > 1:100796/1‑150 (MQ=255) gTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTgg > 2:2069481/1‑150 (MQ=255) gTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTgg > 1:4719423/1‑150 (MQ=255) tCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTg > 2:3440641/1‑150 (MQ=255) tCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTg < 2:3355909/150‑1 (MQ=255) tCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTg < 1:646583/150‑1 (MQ=255) 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aTCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGc > 2:3526120/1‑150 (MQ=255) ccTGTCACCGTTGGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCGACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTc < 2:3901716/150‑1 (MQ=255) cTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTcc > 2:2419028/1‑150 (MQ=255) cTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTcc < 1:3297548/150‑1 (MQ=255) cTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATACCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTcc > 1:2831205/1‑150 (MQ=255) 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aCTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAACCGCAATGGc > 2:1377801/1‑150 (MQ=255) tGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAACCGCAATGGCGa > 1:353136/1‑150 (MQ=255) gTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAACCGCAATGGCGAc > 1:1858547/1‑150 (MQ=255) ccTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAACCGCAATGGCGACcgc < 2:2176980/150‑1 (MQ=255) gATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAACCGCAATGGCGACcgcgcg > 2:1469987/1‑150 (MQ=255) tCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAACCGCAATGGCGACCGCGCGTc > 1:219593/1‑150 (MQ=255) tCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAACCGCAATGGCGACCGCGCGTc > 1:2620251/1‑150 (MQ=255) cccGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAACCGCAATGGCGACCGCGCGTCa > 2:4346062/1‑150 (MQ=255) cGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAACCGCAATGGCGACCGCGCGTCAcc > 2:76996/1‑150 (MQ=255) cGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAACCGCAATGGCGACCGCGCGTCAcc < 1:2557581/150‑1 (MQ=255) ggAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAACCGCAATGGCGACCGCGCGTCACcg > 1:3008604/1‑150 (MQ=255) tATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAACCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGt > 2:208216/1‑150 (MQ=255) | GATGGCGTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGGTCTGCGCACCAAACGCTGGAAACTGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAACCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGT > AP012306/955841‑956138 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |