| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012967 | 1508931 = | 181 (0.960) | 3 (0.020) | 3/122 | 13.5 | 2.2% | coding (757/846 nt) | nhoA | N‑hydroxyarylamine O‑acetyltransferase |
| ? | NC_012967 | = 4092038 | 116 (0.720) | coding (242/441 nt) | yiiR | DUF805 domain‑containing protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
ACGCGGTGGAGCAGCGAAATCTACCGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCAC > NC_012967/1508860‑1509002 | cgcgGTGGAGCAGCGAAATCTACCGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTggg < 2:5876847/72‑1 (MQ=255) cgcgGTGGAGCAGCGAAATCTACCGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTggg > 1:2612929/1‑72 (MQ=255) gcgGTGGAGCAGCGAAGTCTACCGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGc < 2:1431438/72‑1 (MQ=255) cgGTGGAGCAGCGAAATCTACCGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCg > 1:1997822/1‑72 (MQ=255) cgGTGGAGCAGCGAAATCTACCGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCg > 1:2503238/1‑72 (MQ=255) ggTGGAGCAGCGAAATCTACCGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGt > 2:3551315/1‑72 (MQ=255) ggTGGAGCAGCGAAATCTACCGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGt > 1:561736/1‑72 (MQ=255) tGGAGCAGCGAAATCTACCGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTgg < 2:4147509/72‑1 (MQ=255) agcagcGAAATCTACCGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGgatg < 2:5506876/72‑1 (MQ=255) agcagcGAAATCTACCGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGgatg > 2:2619430/1‑72 (MQ=255) cagcGAAATCTACCGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGgatgat < 1:3610689/72‑1 (MQ=255) cagcGAAATCTACCGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGgatgat < 2:1442359/72‑1 (MQ=255) agcGAAATCTACCGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGatgatg > 2:2400838/1‑72 (MQ=255) agcGAAATCTACCGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGatgatg > 1:1465670/1‑72 (MQ=255) cGAAATCTACCGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATTATGCg < 2:3706559/72‑1 (MQ=255) aTCTACCGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAAc < 1:1247495/72‑1 (MQ=255) cTACCGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACAt < 2:5767147/72‑1 (MQ=255) tACCGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATg > 2:6152512/1‑72 (MQ=255) ccGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGc > 1:6679690/1‑72 (MQ=255) cGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCt > 1:5417720/1‑72 (MQ=255) cGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCt < 2:6497260/72‑1 (MQ=255) cGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCt < 2:5737816/72‑1 (MQ=255) ggATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCtt < 1:6179286/72‑1 (MQ=255) ggATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCtt > 1:1356610/1‑72 (MQ=255) ggATGTGGCGTAATTATATGCTGTGTTGCAAGAACAGTTTGGTTTGGGCGTGGATGATGGGAACCATGGCtt > 2:5829957/1‑72 (MQ=255) gATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGTCttt > 2:3056506/1‑72 (MQ=255) gATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCttt > 2:657972/1‑72 (MQ=255) gATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCttt < 2:4248043/72‑1 (MQ=255) gATGTGGCGTCATTATATGCGGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCttt < 1:85069/72‑1 (MQ=255) aTGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTa > 1:4892695/1‑72 (MQ=255) tgtgGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTAc < 1:4714218/72‑1 (MQ=255) tgtgGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTAc < 2:3787225/72‑1 (MQ=255) gtgGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTAcc < 1:2729541/72‑1 (MQ=255) gtgGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGANGCGAAACATGGCTTTAcc > 1:2207171/1‑72 (MQ=255) tgGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCg > 2:5469371/1‑72 (MQ=255) tgGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGANGATGCGAAACATGGCTTTACCg > 1:1836436/1‑72 (MQ=255) ggCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGt < 2:6444494/72‑1 (MQ=255) ggCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGt > 2:1007512/1‑72 (MQ=255) ggCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGt > 1:499976/1‑72 (MQ=255) gCGTGATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTg < 2:2083172/72‑1 (MQ=255) gCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTg < 1:5798219/72‑1 (MQ=255) tCATTATATGCTGTGATGCGAGAACAGTTTGGTCTGTGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGAt < 2:3153380/72‑1 (MQ=255) tCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGAt > 1:1702728/1‑72 (MQ=255) tCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGAt < 1:2834252/72‑1 (MQ=255) cATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATg < 1:3204743/72‑1 (MQ=255) aTTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGa > 2:4768055/1‑72 (MQ=255) aTTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGa < 2:2990099/72‑1 (MQ=255) ttATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAg < 1:1625686/72‑1 (MQ=255) atatGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGtt > 1:603354/1‑72 (MQ=255) atatGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGtt < 2:6309571/72‑1 (MQ=255) atatGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGtt > 2:1708544/1‑72 (MQ=255) atatGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGtt > 2:2435065/1‑72 (MQ=255) tatGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTa < 2:1500043/72‑1 (MQ=255) tatGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTa < 1:5977643/72‑1 (MQ=255) atGCTGTGATGCAANNNCAGTTTGGTCTGGGCGTNGGTGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg < 1:4723071/72‑1 (MQ=255) tGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAgc < 2:6123599/72‑1 (MQ=255) tGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAgc > 2:5866721/1‑72 (MQ=255) tGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAgc < 1:1047157/72‑1 (MQ=255) tGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAgc < 2:174206/72‑1 (MQ=255) gCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAgcg < 1:2352836/72‑1 (MQ=255) gCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAgcg > 2:3893531/1‑72 (MQ=255) gCTGTGATGCAAGAACAGGGTGGTCGGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAgcg < 2:4862191/72‑1 (MQ=255) cTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAgcgc > 1:6148212/1‑72 (MQ=255) cTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAgcgc < 1:3087186/72‑1 (MQ=255) tgtgATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCt < 2:5934720/72‑1 (MQ=255) tgtgATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCt < 1:3390672/72‑1 (MQ=255) gtgATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTg > 2:2927383/1‑72 (MQ=255) gtgATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGATg < 1:1617778/72‑1 (MQ=255) tgATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGTATGAGTTAGCGCTgg > 1:4174100/1‑72 (MQ=255) tgATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTgg > 2:6333542/1‑72 (MQ=255) tgATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTgg < 2:4849845/72‑1 (MQ=255) tgATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTgg > 1:4526589/1‑72 (MQ=255) gATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGt < 2:6073646/72‑1 (MQ=255) aTGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTg < 1:3902169/72‑1 (MQ=255) aTGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTg > 2:2757631/1‑72 (MQ=255) gCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGAt < 1:4441635/72‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATg > 1:4617660/1‑72 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATg > 1:2388855/1‑72 (MQ=255) aaGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATgg > 2:362683/1‑72 (MQ=255) aGAACAGTTTGGTCTGGGNGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATggc < 2:535277/72‑1 (MQ=255) aGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATggc < 2:859480/72‑1 (MQ=255) aGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATggc < 2:1628334/72‑1 (MQ=255) aGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATggc < 2:438269/72‑1 (MQ=255) gAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATggcg > 1:5307457/1‑72 (MQ=255) aCAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTATCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGGTggcggg > 2:433380/1‑71 (MQ=255) aGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGt > 1:5134559/1‑72 (MQ=255) aGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGt > 2:2024965/1‑72 (MQ=255) gTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGtt < 1:5495641/72‑1 (MQ=255) tgtGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACAGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGttt < 1:1289539/70‑1 (MQ=255) tGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGa > 1:4818184/1‑72 (MQ=255) ggTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGAt > 1:373102/1‑72 (MQ=255) gTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATa < 2:3948513/72‑1 (MQ=255) gTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATa > 2:6382694/1‑72 (MQ=255) gTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATa > 1:1008387/1‑72 (MQ=255) tCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATAc < 1:3494290/72‑1 (MQ=255) tCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATAc < 2:5472597/72‑1 (MQ=255) cTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACg > 1:4324131/1‑72 (MQ=255) gggCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCa > 1:6011195/1‑72 (MQ=255) ggCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCAc < 2:3576361/72‑1 (MQ=255) ggCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCAc < 1:5651218/72‑1 (MQ=255) | ACGCGGTGGAGCAGCGAAATCTACCGGATGTGGCGTCATTATATGCTGTGATGCAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCAC > NC_012967/1508860‑1509002 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |