New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_012967 | = 3894996 | NA (NA) | 199 (0.900) | 97/142 | 0.4 | 100% | intergenic (+26/‑162) | ECB_RS25215/rbsD | IS3‑like element IS150 family transposase/D‑ribose pyranase |
? | NC_012967 | 3895392 = | 0 (0.000) | coding (235/420 nt) | rbsD | D‑ribose pyranase |
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
TGGGCGTCGTCACAAATGAAATGCAGGTCGAGGCTGCCATTATCGCGGAAGAGATCAAACAACATAATCCGCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAGGGAAATACCATTGAAATTCGT > NC_012967/3895321‑3895463 | actccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacac > 2:6913570‑M2/72‑72 (MQ=255) actccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacac > 1:2609815‑M2/72‑72 (MQ=255) tccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCaa > 1:4395068‑M2/70‑72 (MQ=255) caattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACt > 2:5934535‑M2/68‑72 (MQ=255) caattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACt > 1:5041834‑M2/68‑72 (MQ=255) caattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACt < 1:6910977‑M2/5‑1 (MQ=255) aattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTc < 2:6815957‑M2/6‑1 (MQ=255) attgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTcc < 1:6940931‑M2/7‑1 (MQ=255) gaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACg > 1:1879111‑M2/63‑72 (MQ=255) atatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGaa < 1:5799607‑M2/12‑1 (MQ=255) atatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGaa > 2:2261527‑M2/61‑72 (MQ=255) atatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGaa < 2:4337915‑M2/12‑1 (MQ=255) atatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGaa > 1:5145454‑M2/61‑72 (MQ=255) atatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGaa > 2:7475537‑M2/61‑72 (MQ=255) atcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAAc > 1:1976127‑M2/59‑72 (MQ=255) cggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGt < 2:2355772‑M2/16‑1 (MQ=255) cggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGt < 1:7354402‑M2/16‑1 (MQ=255) cggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGt > 2:1856158‑M2/57‑72 (MQ=255) cggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGt < 2:1574386‑M2/16‑1 (MQ=255) ggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGtt > 1:7503434‑M2/56‑72 (MQ=255) gaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTg < 1:3887204‑M2/18‑1 (MQ=255) aatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGc > 1:3590837‑M2/54‑72 (MQ=255) aatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGc > 1:2527811‑M2/54‑72 (MQ=255) aatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGc > 1:2162656‑M2/54‑72 (MQ=255) aatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGc < 1:6761436‑M2/19‑1 (MQ=255) aatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGc < 1:5635338‑M2/19‑1 (MQ=255) atcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGct < 1:6233817‑M2/20‑1 (MQ=255) tcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTgcta < 2:5112325‑M2/21‑2 (MQ=255) tcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGctc < 2:3614970‑M2/21‑1 (MQ=255) cagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGctca > 2:1905289‑M2/51‑72 (MQ=255) agacctatatgnctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGctcnc > 1:746794‑M2/50‑72 (MQ=255) gacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGctcact < 1:6322542‑M2/24‑1 (MQ=255) acctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGgttactc > 2:933891‑M2/48‑72 (MQ=255) cctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGctcactca > 1:6767684‑M2/47‑72 (MQ=255) tatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCAcc > 1:130934‑M2/45‑72 (MQ=255) tatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCtt > 1:6653922‑M2/43‑72 (MQ=255) atgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTg < 2:3868030‑M2/31‑1 (MQ=255) atgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTg < 2:2134846‑M2/31‑1 (MQ=255) tgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGa > 2:3431247‑M2/41‑72 (MQ=255) tgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGa > 1:609857‑M2/41‑72 (MQ=255) tgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGa > 2:3147411‑M2/41‑72 (MQ=255) tgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGa < 1:4041982‑M2/32‑1 (MQ=255) gcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGag > 1:2011602‑M2/40‑72 (MQ=255) gcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGag < 1:7224629‑M2/33‑1 (MQ=255) cctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGagc < 1:6144790‑M2/34‑1 (MQ=255) cgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGagcagc > 2:423976‑M2/36‑72 (MQ=255) cgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGagcagc > 1:2297960‑M2/36‑72 (MQ=255) gtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCt < 2:6583632‑M2/38‑1 (MQ=255) gtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCt > 1:688450‑M2/35‑72 (MQ=255) gtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCt > 1:4335930‑M2/35‑72 (MQ=255) gtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCt < 1:4693359‑M2/38‑1 (MQ=255) tgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTg < 2:4003131‑M2/39‑1 (MQ=255) tgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTg > 1:487181‑M2/34‑72 (MQ=255) tgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTg > 2:7033753‑M2/34‑72 (MQ=255) tgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTg < 2:1045839‑M2/39‑1 (MQ=255) gtttaactgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGc < 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tgtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAaca > 2:6169131‑M2/26‑72 (MQ=255) gtccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAacac > 1:5761169‑M2/25‑72 (MQ=255) ccaactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCa < 1:5233010‑M2/50‑1 (MQ=255) caactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAg > 2:6263026‑M2/22‑72 (MQ=255) caactttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAg > 2:360200‑M2/22‑72 (MQ=255) actttttggggtccgtaccAAAACCCACGAAACGTTGCTCACTCCCCCTGAGCAGCTGCAAAAACACCAggg < 1:6691995‑M2/53‑1 (MQ=255) actttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAggg < 1:3286171‑M2/53‑1 (MQ=255) ctttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAGGGa < 1:3511373‑M2/54‑1 (MQ=255) tttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTTCAAAAACACCAGGGaa < 2:3043753‑M2/55‑1 (MQ=255) tttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAGGGaa < 1:6038910‑M2/55‑1 (MQ=255) tttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAGGGaa < 1:7012865‑M2/55‑1 (MQ=255) ttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAGGGaaa < 2:2053607‑M2/56‑1 (MQ=255) ttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAGGGaaa < 2:4548470‑M2/56‑1 (MQ=255) ttttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAGGGaaa > 1:1476450‑M2/17‑72 (MQ=255) tttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAGGGACAt > 2:6971447‑M2/16‑72 (MQ=255) tttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAGGGAAAt < 2:2801113‑M2/57‑1 (MQ=255) ttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAGGGAAATa > 2:272911‑M2/15‑72 (MQ=255) ttggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAGGGAAATa > 2:4677610‑M2/15‑72 (MQ=255) tggggtcagtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAGGGAAATAc > 2:5825534‑M2/14‑72 (MQ=255) 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1:1170574‑M2/7‑72 (MQ=255) agtacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAGGGAAATACCATTGaa > 1:5946396‑M2/7‑72 (MQ=255) tacaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAGGGAAATACCATTGAAAt < 2:4779972‑M2/68‑1 (MQ=255) acaCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAGGGAAATACCATTGAAAtt > 1:5568997‑M2/4‑72 (MQ=255) aCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAGGGAAATACCATTGAAATTCg > 2:7573129‑M2/2‑72 (MQ=255) cAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAGGGAAATACCATTGAAATTCGt < 1:3907476/72‑1 (MQ=255) cAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAGGGAAATACCATTGAAATTCGt > 1:4474547/1‑72 (MQ=255) | TGGGCGTCGTCACAAATGAAATGCAGGTCGAGGCTGCCATTATCGCGGAAGAGATCAAACAACATAATCCGCAACTCCACGAAACGTTGCTCACTCACCTTGAGCAGCTGCAAAAACACCAGGGAAATACCATTGAAATTCGT > NC_012967/3895321‑3895463 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |