| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012967 | 880528 = | 222 (1.020) | 18 (0.100) | 17/114 | 11.8 | 10.6% | intergenic (+17/+163) | rcdA/ECB_RS04335 | DNA‑binding transcriptional regulator RcdA/hypothetical protein |
| ? | NC_012967 | = 904682 | 125 (0.720) | intergenic (+77/+159) | ECB_RS04500/ybjL | ogr/Delta‑like zinc finger family protein/aspartate:alanine antiporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
TAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAGTTGGGTTGG > NC_012967/880457‑880599 | aaGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTTAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATaa > 1:1048023/1‑72 (MQ=255) aaGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATaa < 1:4447667/72‑1 (MQ=255) aaGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATaa < 2:3287434/72‑1 (MQ=255) aaGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGCTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATaa > 2:3121783/1‑72 (MQ=255) aaGCCGCTATCGCGCGAGCAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATaa < 1:2522726/72‑1 (MQ=255) aGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATTGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAAc < 2:5111187/72‑1 (MQ=255) aGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAAc > 2:1582169/1‑72 (MQ=255) ccGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaa > 1:944977/1‑72 (MQ=255) cGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaaa < 2:4942032/72‑1 (MQ=255) gCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaaaa > 2:3945374/1‑72 (MQ=255) tATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaaaaaa < 1:3351726/72‑1 (MQ=255) tCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAAcc < 1:4721775/72‑1 (MQ=255) ctcgcgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGCAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAAccc > 2:5481072/3‑72 (MQ=255) gcgcgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTATATAACAAAAAACCCa < 2:3268390/72‑1 (MQ=255) cgcgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCAt > 1:7163242/1‑72 (MQ=255) cgcgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCAt > 2:5507991/1‑72 (MQ=255) cgcgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCAt < 2:886888/72‑1 (MQ=255) aggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTAt < 1:1304366/72‑1 (MQ=255) aggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTAt > 1:6528572/1‑72 (MQ=255) aggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTAt > 2:6705439/1‑72 (MQ=255) aggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTAt < 1:4952216/72‑1 (MQ=255) aggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTAt > 1:1861879/1‑72 (MQ=255) ggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATg < 2:4293636/72‑1 (MQ=255) ggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATg > 1:1775215/1‑72 (MQ=255) agaTTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTNTACATAACAAAAAACCCATTTATGTa > 2:820270/1‑72 (MQ=255) aTTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTaaa < 1:3307406/72‑1 (MQ=255) aTTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTaaa < 2:6536720/72‑1 (MQ=255) aTTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTaaa > 1:2288032/1‑72 (MQ=255) ttttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAAc < 2:3633047/72‑1 (MQ=255) ttttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAAc < 2:283047/72‑1 (MQ=255) tttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACg > 1:5781709/1‑72 (MQ=255) tttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACg < 2:1376268/72‑1 (MQ=255) ttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACgg < 1:4066302/72‑1 (MQ=255) ttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACgg < 1:3631067/72‑1 (MQ=255) ttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGNTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACgg < 1:1607482/72‑1 (MQ=255) ttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGCAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACgg < 1:5481073/72‑1 (MQ=255) tGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACggg < 2:181336/72‑1 (MQ=255) tGAGGATGGTTGAGAGGGNTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACggg < 1:2917062/72‑1 (MQ=255) gAGGATGGTTGAGAGGGTCGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGt > 2:1171992/1‑72 (MQ=255) aGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGtt < 1:4783652/72‑1 (MQ=255) aGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGtt > 1:4440261/1‑72 (MQ=255) ggATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTa < 1:2441180/72‑1 (MQ=255) gATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTaa > 1:1431698/1‑72 (MQ=255) tGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATg < 2:4234964/72‑1 (MQ=255) tGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATg < 1:4985684/72‑1 (MQ=255) ggTTGAGAGGGTTGCAGGCTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGa > 1:5958557/1‑72 (MQ=255) gTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGaa > 1:5560859/1‑72 (MQ=255) ttGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGaaa < 1:91583/72‑1 (MQ=255) tGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGaaaa < 1:2675348/72‑1 (MQ=255) tGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGaaaa > 2:2343932/1‑72 (MQ=255) gagaGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAAc < 1:2694418/72‑1 (MQ=255) gagaGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAAc < 2:7314508/72‑1 (MQ=255) agagGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACa > 1:618602/1‑72 (MQ=255) agagGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACa < 2:227166/72‑1 (MQ=255) gagGGTTGCAGGGTANTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACaa > 2:736261/1‑72 (MQ=255) gagGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAACAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACaa > 2:6859992/1‑72 (MQ=255) gagGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACaa < 2:4087004/72‑1 (MQ=255) gagGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACaa < 1:7181456/72‑1 (MQ=255) agGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAAt > 2:1541644/1‑72 (MQ=255) gggTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATa < 2:3230328/72‑1 (MQ=255) gTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAg < 1:2565702/72‑1 (MQ=255) gTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAg < 2:4532163/72‑1 (MQ=255) ttGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGt < 2:7493916/72‑1 (MQ=255) tGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGtt > 1:6684340/1‑72 (MQ=255) gCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAATGGGTTAATGAAAACAATAAGTta > 1:5919539/1‑72 (MQ=255) gCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTta > 2:2571190/1‑72 (MQ=255) cAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTtat < 1:1228550/72‑1 (MQ=255) cAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTtat < 1:1961088/72‑1 (MQ=255) aGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATTAAAACAATAAGTtata > 1:5386114/1‑72 (MQ=255) aGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTtata > 2:3796534/1‑72 (MQ=255) gggTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAg < 1:5835570/72‑1 (MQ=255) gtagtaGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTa < 1:6325918/72‑1 (MQ=255) gtagtaGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTa > 1:5226358/1‑72 (MQ=255) tagtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCAATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaa > 2:6028086/1‑72 (MQ=255) gtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaaa > 2:2075925/1‑72 (MQ=255) tagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaaaa < 1:7280688/72‑1 (MQ=255) agATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAAc > 1:4534581/1‑72 (MQ=255) agATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAAc > 1:4299022/1‑72 (MQ=255) agATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAAc > 1:2353151/1‑72 (MQ=255) agATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTAAAGTAAAAAc > 2:6006378/1‑72 (MQ=255) gATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACa > 1:2108166/1‑72 (MQ=255) aTAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACaa > 2:4157066/1‑72 (MQ=255) aaGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATa > 1:3164583/1‑72 (MQ=255) aaGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATa < 2:6466727/72‑1 (MQ=255) aGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATaa > 1:3736135/1‑72 (MQ=255) gTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAGCAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAg > 1:2758178/1‑72 (MQ=255) gTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAg < 2:6103965/72‑1 (MQ=255) gTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAg > 1:7435595/1‑72 (MQ=255) gTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAg > 1:5730786/1‑72 (MQ=255) tttAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgtt > 1:3820476/1‑72 (MQ=255) tttAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgtt < 1:3071433/72‑1 (MQ=255) tAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgg < 2:3533865/72‑1 (MQ=255) tAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgg > 1:4857427/1‑72 (MQ=255) aGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttggg < 1:1010487/72‑1 (MQ=255) gATAANAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggt < 2:2874982/72‑1 (MQ=255) aTAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggtt < 1:2581237/72‑1 (MQ=255) aaCAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggttgg > 2:4481253/1‑72 (MQ=255) aaCAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggttgg > 2:5801773/1‑72 (MQ=255) aaCAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggttgg > 2:3412525/1‑72 (MQ=255) aaCAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggttgg > 1:6928555/1‑72 (MQ=255) | TAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAGTTGGGTTGG > NC_012967/880457‑880599 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |