| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012967 | 2829863 = | 108 (0.380) | 4 (0.020) | 4/104 | 17.4 | 5.3% | intergenic (‑130/‑340) | ECB_RS14010/fucI | sugar ABC transporter ATP‑binding protein/L‑fucose isomerase |
| ? | NC_012967 | 2830124 = | 64 (0.310) | intergenic (‑391/‑79) | ECB_RS14010/fucI | sugar ABC transporter ATP‑binding protein/L‑fucose isomerase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GTTATGCATCACAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTCGAGTTAGCAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_012967/2829952‑2829863‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gctaactcgagttagcaaaTAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAAAGCGAGATGAG > NC_012967/2830124‑2830194 GTTATGCATCACAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCG < 2:4915206/72‑1 TNTGCATCACAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAANAGGCGATCGCT < 1:959882/72‑1 TATGCATCACAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCT < 2:8644953/72‑1 ATGCATCACAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTA < 1:1466188/72‑1 TGCATCACAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAA > 2:4129633/1‑72 GCATCACAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCTATCGCTAAC > 1:6677962/1‑72 GCATCACAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAAC < 2:95500/72‑1 GCATCACAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAAC > 2:7728688/1‑72 GCATCACAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAANTTGTATNCCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAAC < 1:581424/72‑1 ATCACAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTTACTC > 2:1645437/1‑72 ATCACAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTC > 1:8364121/1‑72 ATCACAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCACTCACTt > 1:4634270/1‑71 TCACAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTCG < 2:2420245/72‑1 CACAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTCGc > 2:6613431/1‑71 CACAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTCGA < 1:6635841/72‑1 CACAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTCGA < 1:1764832/72‑1 ACAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTCGAG < 2:9699226/72‑1 ACAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTCGAG > 1:5384655/1‑72 CAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTCGAGT < 1:6461054/72‑1 CAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTCGAGT > 2:3239126/1‑72 AGTTTTAACTCCAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTCGAGTT > 1:3990381/1‑72 AGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTCGAGTT < 1:2673451/72‑1 AGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTCGAGTT < 1:1525139/72‑1 GTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTCGAGTTA < 2:4646797/72‑1 TTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTCGAGTTAG < 2:1565632/72‑1 TTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTCGAGTTAG < 2:5249398/72‑1 TTTAACTCAAATCATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTCGCGTTAGC < 2:3850226/72‑1 TTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTCGAGTTAGCA < 1:5383774/72‑1 ACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTCGAGTTAGCAAAT < 2:4686685/72‑1 GTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTCGAGTTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCG < 2:9482772/72‑1 TAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTCGAGTTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTT < 2:2134182/72‑1 CGATCGCTAACTCGAGTTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCA < 1:7640037/72‑1 aaCTAACTCGAGTTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGC < 2:68963/70‑1 GCTAACTCGAGTTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGGTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGCGCG > 2:3526102/1‑72 GCTAACTCGAGTTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGGTTCCTTTCTCCGCCCTAGCAGAagg > 1:1234807/1‑69 TAACTCGAGTTAGCAAATAATGACCAATACTACTNCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCC > 1:524039/1‑72 TAACTCGAGTTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCC > 2:9711595/1‑72 TAACTCGAGTTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCC > 2:7960151/1‑72 AACTCGAGTTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCTGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCA > 1:8858025/1‑72 ACTCGAGTTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTNGCAGAGCGCCAA > 1:1091751/1‑72 CTCGAGTTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAAT > 2:9517344/1‑72 CTCGAGTTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAAT > 1:8039746/1‑72 CTCGAGTTAGCAAATAANGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAAT > 1:875860/1‑72 TCGAGTTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATA > 2:2383211/1‑72 TCGAGNTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATA > 1:950157/1‑72 CGAGTTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAA > 1:5767160/1‑72 CGAGTTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAA > 1:796619/1‑72 CGAGTTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAA < 1:3842887/72‑1 GAGTTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCNTAGCAGAGCGCCAATAAA > 1:3821489/1‑72 AGTTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAAAG > 1:2029695/1‑72 AGTTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAAAG > 2:9346162/1‑72 GTTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAAAGC > 1:9331274/1‑72 GTTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAAAGC < 2:5844972/72‑1 TTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGGCTTAGCAGATCGCCAATAAAGCG > 1:2972692/1‑72 TTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCCGATCGCCAATAAAGCG > 1:2875169/1‑72 TTAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAAAGCG > 2:366403/1‑72 TAGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCCGAGCGCCAATAAAGCGA > 2:750683/1‑72 AGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAAAGCGAG < 1:1212637/72‑1 AGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAAAGCGAG > 2:3996295/1‑72 AGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAAAGCGAG > 1:5550353/1‑72 AGCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAAAGCGAG > 1:4448090/1‑72 GCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAAAGCGAGA < 2:4907026/72‑1 GCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAAAGCGAGA > 2:3239887/1‑72 GCAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAAAGCGAGA < 1:1977413/72‑1 CAAATANTGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAAAGCGAGAT < 2:691878/72‑1 CAAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAAAGCGAGAT > 1:6244758/1‑72 AAATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAAAGCGAGATG > 1:4883845/1‑72 AATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAAAGCGAGATGA > 1:594308/1‑72 ATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAAAGCGAGATGAG > 2:9159543/1‑72 ATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAAAGCGAGATGAG < 1:4176650/72‑1 ATAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAAAGCGAGATGAG > 2:9900609/1‑72 GTTATGCATCACAGTTTTAACTCAAATGATTTGGCTAATTTGTATACCTAAAATAGCTTTAAAAGGCGATCGCTAACTCGAGTTAGCAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_012967/2829952‑2829863‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gctaactcgagttagcaaaTAATGACCAATACTACTGCTTCGGTGGTTTCCTTTCTCCGCCTTAGCAGAGCGCCAATAAAGCGAGATGAG > NC_012967/2830124‑2830194 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |