New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_012967 | 717135 = | 27 (0.090) | 18 (0.070) | 12/124 | 14.4 | 32.3% | coding (62/312 nt) | ECB_RS23290 | DUF6258 family protein |
? | NC_012967 | 717390 = | 52 (0.210) | intergenic (+5/‑328) | ECB_RS23290/ECB_RS03505 | DUF6258 family protein/ISAs1 family transposase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
ATTTAATCTCAAGGATAGCCTATGGTACAACAGAATGGATTTTTTATGATAATGAAGACTTAGAAGATGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCAATATAACTCCTAATGGCTCTATTCCAGATGATTATA > NC_012967/717069‑717206 | atttaatCTCAAGGATAGCCTATGGTACAACAGAATGGATTTTTTATGATAATGAAGACTTAGAAGATGGtt > 1:2862639/1‑72 (MQ=255) tctcAAGGATAGCCTATGGTACAACAGAATGGATTTTTTATGATAATGAAGAGTTAAAAGATGGTTATTTgg < 2:6042871/72‑1 (MQ=255) ctcAAGGATAGCCTATGGTACAACAGAATGGATTTTTTATGATAATGAAGACTTAGAAGATGGTTATTTGGt > 2:6494843/1‑72 (MQ=255) cAAGGATAGCCTATGGTACAACAGAATGGATTTTTTATGATAATGAAGACTTAGAAGATGGTTATTTGGTAt > 1:637207/1‑72 (MQ=255) aaGGATAGCCTATGGTACAACAGAATGGATTTTTTATGATAATGAAGACTTAGAAGATGGTTATTTGGTAtt > 2:8453551/1‑72 (MQ=255) aGGATAGCCTATGGTACAACAGAATGGATTTTTTATGATAATGAAGACTTAGAAGATGGTTATTTGGTAttt > 2:5675162/1‑72 (MQ=255) ggATATCCTATGGCACAACAGAATGGATTTTTTATGATAATGAAGACTTAGAAGATGGTTATTTGGTAtttt > 1:3131329/1‑72 (MQ=255) ggATAGCCTATGGTACAACAGAATGGATTTTTTATGATAATGAAGACTTAGAAGATGGTTATTTGGTAtttt < 2:5157757/72‑1 (MQ=255) aGCCTATGGTACAACAGAATGGATTTTTTATGATAATGAAGACTTAGAAGATGGTTATTTGGTATTTTccga < 2:2378826/72‑4 (MQ=255) aGCCTATGGTACAACAGAATGGATTTTTTATGATAATGAAGACTTAGAAGATGGTTATTTGGTATTTTCAGa > 1:5815478/1‑72 (MQ=255) cTATGGTACAACAGAATGGATTTTTTATGATAATGAAGACTTAGAAGATGGTTATTTGGTATTTTCCGAtac < 2:4754649/72‑3 (MQ=255) cTATGGTACAACAGAATGGATTTTTTATGATAATGAAGACTTAGAAGATGGTTATTTGGTATTTTCAGATGt > 2:4880728/1‑72 (MQ=255) tGGTATAACAGAATGGATTTTTTATGATAATGAAGACTTAGAAGATGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAg < 2:1905683/72‑1 (MQ=255) caGAATGGGTTTTTTATGATAATGAAGACTTAGAAGATGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCa > 1:5951314/1‑72 (MQ=255) aGAATGGATTTTTTATGATAATGAAGACTTAGAAGATGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCaa > 1:7643376/1‑72 (MQ=255) ggATTTTTTATGATAATGAAGACTTAGAAGATGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCAATATaa > 1:5419838/1‑72 (MQ=255) ggATTTTTTATGATAATGAAGACTTAGAAGATGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCAATATaa > 2:8498833/1‑72 (MQ=255) aTGATAATGAAGACTTAGAAGATGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCAATATAACTCCTAATg < 1:339020/72‑1 (MQ=255) gATAATGAAGACTTAGAAGATGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCAATATAACTCCTAATGGc < 1:2049202/72‑1 (MQ=255) gAAGACTTAGAAGATGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCAATATAACTCCTAATGGCTCTAtt < 2:5469298/72‑1 (MQ=255) aaGACTTAGAAGATGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCAATATAACTCCTAATGGCTCTATTc > 1:4999109/1‑72 (MQ=255) aGACTTAGAAGATGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCAATATAACTCCTAATGGCTCTATTcc > 1:4584880/1‑72 (MQ=255) aCTTAGAAGATGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCAATATAACTCCTAATGGCTCTATTCCAg > 1:3265323/1‑72 (MQ=255) agaagaTGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCAATATAACTCCTAATGGCTCTATTCCAgatga > 1:8847194/1‑72 (MQ=255) aagaTGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCAATATAACTCCTAATGGCTCTATTCCAGATGAtt > 1:6852429/1‑72 (MQ=255) aagaTGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCAATATAACTCCTAATGGCTCTATTCCAGATGAtt < 1:3996266/72‑1 (MQ=255) aacaTGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCAATATAACTCCTAATGGCTCTATTCCAGATGAtt > 2:9454321/4‑72 (MQ=255) aacaTGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCAATATAACTCCTAATGGCTCTATTCCAGATGAtt > 2:9934696/4‑72 (MQ=255) aacaTGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCAATATAACTCCTAATGGCTCTATTCCAGATGAtt > 2:109014/4‑72 (MQ=255) agaTGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCAATATAACTCCTAATGGCTCTATTCCAGATGATta > 1:6083571/1‑72 (MQ=255) acaTGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCAATATAACTCCTAATGGCTCTATTCCAGATGATta > 2:2986728/3‑72 (MQ=255) acaTGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCAATATAACTCCTAATGGCTCTATTCCAGATGATta > 2:9480674/3‑72 (MQ=255) aTGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCAATATAACTCCTAATGGCTCTATTCCAGATGATtata > 1:9635407/1‑72 (MQ=255) | ATTTAATCTCAAGGATAGCCTATGGTACAACAGAATGGATTTTTTATGATAATGAAGACTTAGAAGATGGTTATTTGGTATTTTCAGATGTTAGTTTCTTCAATATAACTCCTAATGGCTCTATTCCAGATGATTATA > NC_012967/717069‑717206 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |