| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012967 | 3947791 = | 251 (0.880) | 10 (0.040) | 8/132 | 16.9 | 6.6% | coding (16/1656 nt) | aslA | arylsulfatase AslA |
| ? | NC_012967 | 3948049 = | 50 (0.190) | intergenic (‑243/+443) | aslA/hemY | arylsulfatase AslA/protoheme IX biogenesis protein HemY | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ACCTCTGGCGCAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATATGTTATTAATTGAATGAATTTTATTATTCATTATATAT > NC_012967/3947978‑3948104 | aCCTCTGGCGCAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTa < 1:6823146/72‑1 (MQ=255)aCCTCTGGCGCAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTa < 1:3441025/72‑1 (MQ=255)aCCTCTGGAGCAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTa < 1:382073/72‑1 (MQ=255) ccTCTNGCGCAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTaa < 2:3775192/72‑1 (MQ=255) ccTCTGGCGCAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTaa < 2:9598160/72‑1 (MQ=255) ctctGGCGCAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAAc < 1:7860491/72‑1 (MQ=255) ctctGGCGCAGGTGATATGTAAGGAGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAAc < 1:2631936/72‑1 (MQ=255) tctGGCGCAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAGCg < 2:5704537/72‑1 (MQ=255) tctGGCGCAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACg > 2:7740891/1‑72 (MQ=255) tctGGCGCAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACg < 2:3336986/72‑1 (MQ=255) ctGGCGCAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACgg < 1:3399077/72‑1 (MQ=255) ctGGCGCAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACgg < 1:6992336/72‑1 (MQ=255) tGGCGCAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGc > 2:7444955/1‑72 (MQ=255) tGGCGCAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGc > 1:4480825/1‑72 (MQ=255) tGGCGCAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGc < 2:1124130/72‑1 (MQ=255) ggCGCAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCa < 1:6946085/72‑1 (MQ=255) ggCGCAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCa < 1:1811352/72‑1 (MQ=255) ggCGCAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCa > 1:1805110/1‑72 (MQ=255) gcgcAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCaa < 1:4507271/72‑1 (MQ=255) cgcAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAAt < 2:9250099/72‑1 (MQ=255) cgcAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAAt < 2:4410397/72‑1 (MQ=255) cgcAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAAt < 2:7045628/72‑1 (MQ=255) cAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTa < 2:4416771/72‑1 (MQ=255) cAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTa < 1:3836883/72‑1 (MQ=255) aGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTaa < 1:6220912/72‑1 (MQ=255) aGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTaa < 1:6220893/72‑1 (MQ=255) aGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTaa < 1:9106070/72‑1 (MQ=255) gTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAata < 2:1652605/72‑1 (MQ=255) atGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAatatatat > 1:2125212/1‑72 (MQ=255) tGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATATg < 1:7534612/72‑1 (MQ=255) tGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATATg < 1:7534594/72‑1 (MQ=255) tAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATATGtt < 1:7378755/72‑1 (MQ=255) aaaGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGGTTTTTTATGCTGTTTTTAGTTTTTACGGCAATTAATATATAtttt > 2:4038049/2‑72 (MQ=255) gCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATATGttatta < 2:8132739/72‑1 (MQ=255) cGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATATGTTATTaa < 1:6295561/72‑1 (MQ=255) cGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATATGTTATTaa > 1:7329610/1‑72 (MQ=255) aTGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATATGTTATTAATtgaa > 2:3557533/1‑72 (MQ=255) aTGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATATGTTATTAATtgaa > 1:4599146/1‑72 (MQ=255) tGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATATGTTATTAATtgaat > 1:9102872/1‑72 (MQ=255) gTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATATGTTATTAATtgaatg > 1:4578296/1‑72 (MQ=255) gTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATATGTTATTAATtgaatg < 2:1409681/72‑1 (MQ=255) tataTCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATATGTTATTAATtgaatgaa > 1:4962422/1‑72 (MQ=255) atCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAATTTAAACGGCAATTAATATATATGTTATTAATTGAATGAAttt < 2:3397694/72‑1 (MQ=255) cgcgTTGATAATTGATGCTGTTTTTAGTTNTAACGGCAATTAATATATATGTTATTAATTGAATGAGTTtta > 2:851791/1‑72 (MQ=255) gcgTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATATGTTATTAATTGAATGAATTttat > 2:6449010/1‑72 (MQ=255) cgTTGATTATTGATGCTTTTTTAATTTTAAACGGCAATTAATAAATATGTTATTAATTGAATGAATTttatt < 1:9298902/72‑1 (MQ=255) attattGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTNATATATATGTTATTAATTGAATGAATTTTATTATTCa > 1:521299/1‑72 (MQ=255) ttattGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATATGTTATTAATTGAATGAATTTTATTATTCAt > 2:8514424/1‑72 (MQ=255) aTGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATATGTTATTAATTGAATGAATTTTATTATTCATtatata < 1:5649717/72‑1 (MQ=255) tGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATATGTTATTAATTGAATGAATTTTATTATTCATtatatat < 1:5367189/72‑1 (MQ=255) | ACCTCTGGCGCAGGTGATATGTAAGGCGGTGATGTTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATATGTTATTAATTGAATGAATTTTATTATTCATTATATAT > NC_012967/3947978‑3948104 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |