| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012967 | 3482676 = | 114 (0.460) | 68 (0.300) | 38/130 | 6.8 | 46.9% | coding (992/2706 nt) | malT | HTH‑type transcriptional regulator MalT |
| ? | NC_012967 | = 3482700 | 50 (0.220) | coding (1016/2706 nt) | malT | HTH‑type transcriptional regulator MalT | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
TTTACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGCCGGAAATCCACCGTGCCGCCGCAGAAAGCTGGATGGCCCAGG > NC_012967/3482605‑3482747 | tttACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTTGTGACTTTCGTGGCCAgcg > 2:1422915/1‑72 (MQ=255)tttACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAgcg > 2:8057018/1‑72 (MQ=255) ttACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAgcgc < 1:4854694/72‑1 (MQ=255) ttACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAgcgc < 2:4060930/72‑1 (MQ=255) ttACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAgcgc < 2:4238619/72‑1 (MQ=255) tACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCt < 2:8757312/72‑1 (MQ=255) tACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCt < 2:1642802/72‑1 (MQ=255) tACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCt > 1:2314661/1‑72 (MQ=255) tACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCt > 2:4913119/1‑72 (MQ=255) tACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCt < 2:5684481/72‑1 (MQ=255) tACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCt > 2:6082400/1‑72 (MQ=255) aCAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTg < 2:8608226/72‑1 (MQ=255) aCAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTg > 1:6594411/1‑72 (MQ=255) cAGCGGATGGATGATACCGGCTAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGc < 2:531756/72‑1 (MQ=255) cAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGc > 1:1794259/1‑72 (MQ=255) cAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGc > 1:5453/1‑72 (MQ=255) cAGCGGATGGATGATACCGGCGAGCGGTTCTGCCCCCACCCGGCGTTTGGGAACTTTCTGCGCCAgcgcgct > 2:5162379/1‑69 (MQ=255) aGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGcc > 2:4254962/1‑72 (MQ=255) gCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCCGCGCTGccc > 1:3129100/1‑71 (MQ=255) gCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCa < 2:4638469/72‑1 (MQ=255) cGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAg < 2:130868/72‑1 (MQ=255) cGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAg < 1:6087705/72‑1 (MQ=255) gtatggatgATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTGCCTGCGCCCGCGCTTCCAGt > 1:3023561/3‑72 (MQ=255) ggatggatGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTTccttc > 1:1252640/1‑69 (MQ=255) ggatggatGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGt < 2:3577041/72‑1 (MQ=255) ggatggatGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGt < 2:6766103/72‑1 (MQ=255) ggatggatGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGt > 1:7502502/1‑72 (MQ=255) ggatggatGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGt < 2:6612725/72‑1 (MQ=255) atggatgATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCCGCGCTGCCAGTgg > 2:7708442/1‑72 (MQ=255) atggatgATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTgg > 1:8348813/1‑72 (MQ=255) atggatgATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTgg > 1:6002481/1‑72 (MQ=255) atggatgATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTgg > 2:4025481/1‑72 (MQ=255) tggatgATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTggg < 1:1354652/72‑1 (MQ=255) tggatgATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTggg < 2:8397901/72‑1 (MQ=255) tggatgATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTggg < 2:6170535/72‑1 (MQ=255) ggatgATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGa < 1:6471767/72‑1 (MQ=255) gatgatACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCCCCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGaa < 1:1342944/72‑1 (MQ=255) gatgatACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGaa > 2:1601345/1‑72 (MQ=255) gatgatACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGaa < 1:1664345/72‑1 (MQ=255) tgatACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACt < 2:5184984/72‑1 (MQ=255) gatACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTg < 2:347256/72‑1 (MQ=255) gatACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTg < 2:7847435/72‑1 (MQ=255) gatACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTg > 2:7858923/1‑72 (MQ=255) gatACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCAAGTGGGAACTg < 2:6974031/72‑1 (MQ=255) gatACAGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTg > 2:3920938/1‑72 (MQ=255) atACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCCCCCTCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTgg < 2:6621193/72‑1 (MQ=255) atACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTgg < 2:8228379/72‑1 (MQ=255) atACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTgg > 1:8134770/1‑72 (MQ=255) tACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTggc > 1:8726276/1‑72 (MQ=255) gccGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCACTGTTTGGTACCGTCCTGCGCCACCGCTGCCAGTGGGAACTggcg < 2:3912110/71‑1 (MQ=255) aCCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCCGTGGGGACTggcg > 2:5538291/1‑72 (MQ=255) aCCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGATCTggcg > 2:6923459/1‑72 (MQ=255) aCCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTggcg < 1:7310991/72‑1 (MQ=255) ncGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCGGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTggcgg < 2:3275899/71‑1 (MQ=255) ccGGCGAGTGGTTCTGCTGTCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCGGCGCTGCCAGTGGGAACTggcgg < 1:7658687/72‑1 (MQ=255) ccGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAGCTggcgg > 1:8295917/1‑72 (MQ=255) ccGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACtggtgg > 1:1720913/1‑72 (MQ=255) ccGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTggcgg < 1:3893206/72‑1 (MQ=255) ccGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTggcgg > 1:4682816/1‑72 (MQ=255) ccGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTggcgg < 2:4629315/72‑1 (MQ=255) ccGGCGAGTGGTTATGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTggcgg < 1:738964/72‑1 (MQ=255) cGGGGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTggcggc < 2:2136624/72‑1 (MQ=255) cGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTggcggc > 1:4940507/1‑72 (MQ=255) ggCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAAGTGgcggcg > 2:3643195/1‑72 (MQ=255) ggCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGgcggcg > 2:7384607/1‑72 (MQ=255) ggCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGgcggcg > 1:2357287/1‑72 (MQ=255) ggCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGgcggcg < 2:4501291/72‑1 (MQ=255) ggCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGgcggcg < 2:5196209/72‑1 (MQ=255) gCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGcggcgg < 1:1656421/72‑1 (MQ=255) gCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGcggcgg > 2:5264580/1‑72 (MQ=255) cGATTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGTTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGa < 2:2946543/72‑1 (MQ=255) cGAGTGGTTCTGCTGTCGCCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGGGCTGCCAGTGGGAACTGGGGGCGGa < 1:6737034/72‑1 (MQ=255) cGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGa < 2:4145581/72‑1 (MQ=255) gAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAg > 2:5870953/1‑72 (MQ=255) aGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCATCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGc > 1:7107255/1‑72 (MQ=255) aGTGGTTCTGCTATCACCCGCTG‑TTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCCGTGGGAACTGGCGGCGGAGCt > 1:530078/1‑72 (MQ=255) gTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCt < 1:4830945/72‑1 (MQ=255) gTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCt < 1:1963636/72‑1 (MQ=255) tGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTg > 1:1171496/1‑72 (MQ=255) tGGTTCGGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTg < 2:2640803/72‑1 (MQ=255) ggTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGGGGGGCTGc > 2:2025204/1‑72 (MQ=255) ggTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGc < 1:8354132/72‑1 (MQ=255) ggTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGc > 2:5304686/1‑72 (MQ=255) gTTCTGCTCTCCCCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTgac < 1:6698578/72‑3 (MQ=255) gTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGcc < 1:8498379/72‑1 (MQ=255) gTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGcc < 2:310685/72‑1 (MQ=255) ttCTGCTATCCCCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGcca < 2:6959148/72‑2 (MQ=255) ttCTGCTATCACCCGTTGTTTGCTAACTTCCTGCGCCCGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGcca < 2:6411712/72‑2 (MQ=255) ttCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGGTGccc > 1:15980/1‑71 (MQ=255) ttCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGcca > 2:296183/1‑71 (MQ=255) ttCTCNTCTCCCCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGcca < 2:3381110/72‑2 (MQ=255) tCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGccag > 2:8088637/1‑70 (MQ=255) tCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGccag > 1:4962477/1‑70 (MQ=255) tCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGccag > 1:2225969/1‑70 (MQ=255) ggagcTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGCCGGAAATCCACCGTGCCGCCGCCGGAAGCTGGATGGgcc > 1:5989009/4‑72 (MQ=255) gcgcTGCGGGTGGAAACGGGCGGCGGAGCTGCCGGAAATCCACCGTGCCGCCGCAGAAAGCTGGATGGCCCa < 2:5775680/72‑1 (MQ=255) agcTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGCCCGGAAACCAACCCGCCCCCCCCGAAAGCTGGGGGGCCCAg > 2:7673748/2‑72 (MQ=255) gcTGCCGGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGCCGGAAATCCACCGTGCCGCCGCAGAAAGCTGGATGGCCCAgg < 1:1825690/72‑1 (MQ=255) gcTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGCCGGGAATCCACCGTGCCGCCGCAGGAAGCTGGAGGGCCCCgg > 2:2432249/1‑72 (MQ=255) gcTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGCCGGAAATCCACCGTGCCGCCGCAGAAAGCTGGATGGCCCAgg < 1:3443448/72‑1 (MQ=255) | TTTACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGCCGGAAATCCACCGTGCCGCCGCAGAAAGCTGGATGGCCCAGG > NC_012967/3482605‑3482747 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |