| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_008463 | = 96548 | 22 (0.090) | 226 (0.470) +TGGCTG |
18/140 | 18.6 | 61.5% | pseudogene (86/723 nt) pseudogene (862/894 nt) |
tagH tagH |
type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH |
| ? | NC_008463 | 96549 = | 252 (0.500) | pseudogene (85/723 nt) pseudogene (861/894 nt) |
tagH tagH |
type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH |
|||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 494 total aligned reads displayed.
GGTGCGTCGGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑ACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCGCTGGCTGCGGCTGGACGACGGGCG > NC_008463/96400‑96697 | gctGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACgctggc < 1:7310333/148‑1 (MQ=255)gctGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACgctggc > 1:2843845/3‑150 (MQ=255)gctGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACgctggc < 2:2915804/148‑1 (MQ=255) cgATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGGCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCGGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑g > 2:5705484/2‑150 (MQ=255) aTGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggc > 2:5385865/1‑150 (MQ=255) aTGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggc > 1:6663560/1‑150 (MQ=255) aTGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggc < 1:2391777/150‑1 (MQ=255) aTGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggc < 1:7629580/150‑1 (MQ=255) aTGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggc < 2:9269677/150‑1 (MQ=255) aTGGCGTCCATCTGCGCCTCGGCGCCGCCCGGGACGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggc < 2:6554425/150‑1 (MQ=255) gCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgt < 2:236197/150‑1 (MQ=255) cTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtg < 2:5237628/150‑1 (MQ=255) tCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggcggtggc > 1:9483273/1‑150 (MQ=255) tCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCGGGC‑‑‑‑‑‑gggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctggggg > 1:3952048/1‑149 (MQ=255) ccATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTACAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggct < 1:10394601/150‑1 (MQ=255) cctCTGCGCGTCGGCGCCGGCCGGGGCGACCTTCAACTGGGTCATGCCTGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGACGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctg < 2:9588315/148‑1 (MQ=255) aTCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgt < 2:3468363/150‑1 (MQ=255) tCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggcggtggctgtg > 1:9541646/1‑150 (MQ=255) gcgcTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggct < 1:8434927/150‑1 (MQ=255) cgcTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctg < 2:435235/150‑1 (MQ=255) gcTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgt < 1:4384769/150‑1 (MQ=255) gcTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGGCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgt > 2:8102142/1‑150 (MQ=255) ggCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCGGGAAGGCCTGCTGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGGTTGGCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggcg‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggcggtggctggggcgggggctg > 1:1124631/1‑150 (MQ=255) ggCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctg > 2:11055005/1‑150 (MQ=255) ggCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggcg‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggcggtggctgtggctgtggcgg > 1:10307726/1‑148 (MQ=255) gcgcCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgt > 1:5453673/1‑150 (MQ=255) cggccggGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggct < 1:5708669/150‑1 (MQ=255) ggccggGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctg > 2:7218654/1‑150 (MQ=255) ggccggGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctg < 1:6526149/150‑1 (MQ=255) cggGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtgg < 1:10021859/150‑1 (MQ=255) cggGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtgg < 1:1271983/150‑1 (MQ=255) gTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg < 1:178413/150‑1 (MQ=255) tCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgt < 1:8208357/150‑1 (MQ=255) cGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg > 1:10650141/1‑150 (MQ=255) gACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggcg‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtgg > 1:3525738/1‑150 (MQ=255) aCCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggc < 1:1633846/150‑1 (MQ=255) ccTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggct > 1:9625538/1‑150 (MQ=255) tcaaCTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGGGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑ct‑‑‑‑‑‑ggctgaggctgtggctgtggctgtggcggtggcggtggcggtg > 2:7896790/4‑150 (MQ=255) cTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg > 2:3043752/1‑150 (MQ=255) cTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg < 1:6178157/150‑1 (MQ=255) tGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgt < 2:5892326/150‑1 (MQ=255) gggTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctggggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg > 2:9022674/1‑150 (MQ=255) gggTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCAGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgggtctgtggctgaggctgtgcctgtggctgaggctgaggctgtg > 2:4819374/1‑150 (MQ=255) gTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggc < 1:9150618/150‑1 (MQ=255) tGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggcggtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg > 2:4520514/1‑150 (MQ=255) gCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtgg < 1:3367584/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggc < 1:4628066/150‑1 (MQ=255) cGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggct < 1:1941952/150‑1 (MQ=255) cGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggct < 2:6353333/150‑1 (MQ=255) cGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑gggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggct < 2:4197053/150‑1 (MQ=255) ggCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCCAGCTGGG‑‑‑‑‑‑gggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctggggctgtggctgtgggtgtggcggtggcggtgggggtggctgtggctggggctg > 1:1918701/1‑150 (MQ=255) ggCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg < 1:1187793/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgt < 1:4758266/150‑1 (MQ=255) ccgcGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggc > 2:1918737/1‑150 (MQ=255) cgcgCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggcg > 2:8858955/1‑149 (MQ=255) gcAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGtt < 1:220987/150‑1 (MQ=255) gcAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCGGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑TGCTGTGGCTGTGGCGGTGGCTGGGGCTGTGGGTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGtt > 1:7815927/1‑150 (MQ=255) aGGCACGCCCGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGCCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GG‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGGGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTgg < 1:5034761/150‑1 (MQ=39) aGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑Tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggc < 1:7389283/150‑4 (MQ=255) ggAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTggg > 2:5189518/1‑150 (MQ=255) ggAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGGGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTggg > 2:10295627/1‑150 (MQ=255) gAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCTGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGGGGCGGTTgggg > 2:9334351/1‑149 (MQ=255) gAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTgggg > 2:734841/1‑149 (MQ=255) aCGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑Tggct‑‑‑‑‑‑gt‑‑‑‑‑‑ggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtt > 2:10793357/1‑143 (MQ=255) aCGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGa > 2:10711496/1‑150 (MQ=255) ccTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATcc > 2:2663513/1‑150 (MQ=255) gcagcaGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCg < 2:1195695/150‑1 (MQ=255) gcagcaGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCCGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCAGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑TGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCGGTTGCTGTGGCGGTGGCTGTGGCTGTGGCGGTGGCTGTTGGGTGATCCCCg > 1:8008936/1‑150 (MQ=255) ggTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCATGCCGGGGGCGTCGGCCCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑AGGCA‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGAGGCTGGGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCgg > 2:9407408/1‑150 (MQ=38) gTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCTCGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGc < 2:6480292/150‑1 (MQ=255) gTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGc < 1:7227169/150‑1 (MQ=255) cgccgcCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGa < 1:10808384/150‑1 (MQ=255) cgccgcCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGa < 1:257397/150‑1 (MQ=255) gccgccGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGaa < 2:9731013/150‑1 (MQ=255) gccggccgTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAggg < 2:6873054/150‑1 (MQ=255) ggccgTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCGGT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCGGTGGCTGTGGCTGTGGCTGGGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGGGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGaa > 2:7712078/1‑150 (MQ=37) gccgTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATc < 1:10537742/150‑1 (MQ=255) gTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGCTGTTGCTGTGGCTGTGGCAGTTGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTTGTCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGcc > 1:2987770/1‑150 (MQ=38) gTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGcc < 1:6952526/150‑1 (MQ=255) gcggcgCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCGGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAgcggc > 2:8525262/1‑150 (MQ=255) ggcgCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGt < 1:5796088/150‑1 (MQ=255) cgcTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCg < 2:3784086/150‑1 (MQ=255) gcTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCgg > 1:4039392/1‑150 (MQ=255) ccGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCTGGCTGTGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCg < 1:5118675/150‑1 (MQ=25) ccGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCgg < 2:7038803/150‑1 (MQ=255) gggggCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGcc < 1:8274480/150‑1 (MQ=255) gggggCGTCGGCGCCGCCACGCAGGC‑‑‑‑‑‑TGGCG‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCGGTGGCAGTGGCTGTTGGGTGATCACCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGcc > 2:1004388/1‑150 (MQ=38) ggggCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GTGGCTGGGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCGGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGtt > 1:877624/1‑150 (MQ=25) 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ccgccACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCGCTGGCTGCGGCt > 2:1419842/1‑150 (MQ=255) cACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCGCTGGCTGCGGCTGgac > 2:2487114/1‑150 (MQ=255) cGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGGCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGGTCGGCCGCGGGCTGCGGCTGgacga > 2:601271/1‑150 (MQ=255) ctggc‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCGGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCGCTGGCTGCGGCTGGacgacg < 1:1567518/150‑1 (MQ=255) ctggc‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTCGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAGGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCGCTGGCTGCGGCTGGacgacg > 1:9788667/1‑150 (MQ=255) tggc‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGACGGTTCGGCCGCTGGCTGCGGCTGGACGACgg > 1:9952812/1‑150 (MQ=255) ggc‑‑‑‑‑‑tggct‑‑‑‑‑‑gT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCGCTGGCTGCGGCTGGACGACggg > 2:172984/1‑150 (MQ=255) | GGTGCGTCGGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑ACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCT‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑‑‑‑GGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCGCTGGCTGCGGCTGGACGACGGGCG > NC_008463/96400‑96697 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |