| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_008463 | = 96548 | 22 (0.090) | 226 (0.470) +TGGCTG |
18/140 | 18.6 | 61.5% | pseudogene (86/723 nt) pseudogene (862/894 nt) |
tagH tagH |
type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH |
| ? | NC_008463 | 96549 = | 252 (0.500) | pseudogene (85/723 nt) pseudogene (861/894 nt) |
tagH tagH |
type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH |
|||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 479 total aligned reads displayed.
TGCGTCGGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑A‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCGCTGGCTGCGGCTGGACGACGGGCG > NC_008463/96402‑96697 | tGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACgctggc‑‑‑‑‑‑tg < 1:1544339/150‑1 (MQ=255) gcggccgATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACgctggc‑‑‑‑‑‑tgg > 2:4628352/7‑150 (MQ=255) cggccgATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACgctggc‑‑‑‑‑‑tggc > 2:519797/6‑150 (MQ=255) ccgATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGCACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgt < 1:5639213/148‑1 (MQ=255) ccgATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgt < 2:5728742/148‑1 (MQ=255) ctGGCTTCCATCTGCGCATCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggc < 1:8416806/149‑1 (MQ=255) aTGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggc < 1:2391777/150‑1 (MQ=255) aTGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCGTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggc < 1:7628767/150‑1 (MQ=255) ggCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctg > 2:5587549/1‑150 (MQ=255) gCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgt > 1:8962562/1‑150 (MQ=255) gCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgt < 2:236197/150‑1 (MQ=255) cTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtg < 2:7258398/150‑1 (MQ=255) tCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGGGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggc > 1:3952078/1‑150 (MQ=255) tCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggc > 2:4350932/1‑150 (MQ=255) ccATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTACAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggct < 1:10394601/150‑1 (MQ=255) cctCTGCGCGTCGGCGCCGGCCGGGGCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCTGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGACGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctg < 2:9588315/148‑1 (MQ=255) aTCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCGGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgt < 2:1427512/150‑1 (MQ=255) cgcTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctg > 2:5931442/1‑150 (MQ=255) gcTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgt < 1:4384769/150‑1 (MQ=255) cTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCTGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCGTGCCGGGGGCGGCGGCGCCGGCCCGCGGGC‑‑‑‑‑‑gtgcggtggcggtggctggggcggtg > 1:1172035/1‑150 (MQ=255) ttCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑ACCTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCGTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtgg < 2:1206374/150‑1 (MQ=255) tCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggc < 2:6044017/150‑1 (MQ=255) ggCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggcggtggcggtggctgtggctgtggcgg > 1:10307726/1‑148 (MQ=255) ggCGCCGGCCGGGTCGACCGTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCCCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggctg < 2:7728013/150‑1 (MQ=255) gcgcCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggctgt < 1:381208/150‑1 (MQ=255) gcgcCGGCCGGGTCGACCGTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggcggtggctgtggctgtggctgt > 2:2798845/1‑150 (MQ=255) cggGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtgg < 1:10021859/150‑1 (MQ=255) cGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg < 2:10219254/150‑1 (MQ=255) cGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg > 1:10650141/1‑150 (MQ=255) cGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGGCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg > 2:4470364/1‑150 (MQ=255) aCCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggc < 1:1625151/150‑1 (MQ=255) aCCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggc < 2:6492174/150‑1 (MQ=255) aCCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggcggtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggc > 1:1954428/1‑150 (MQ=255) ccTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggct < 2:4080556/150‑1 (MQ=255) ccTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggcggtggcggtggcgggggctgtggcggtggcg > 1:228373/1‑149 (MQ=255) ccTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgaggctgtggctgtggctgtggcagtggctgtggct > 1:9997904/1‑150 (MQ=255) ttcaa‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgcggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgt < 1:10803915/146‑1 (MQ=255) aa‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCGTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggc < 1:8139288/149‑1 (MQ=255) tGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgt < 2:8261803/150‑1 (MQ=255) gTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggc < 1:7244718/150‑1 (MQ=255) tGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg < 2:738367/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggc < 1:4628066/150‑1 (MQ=255) cGGCGCCGCGCAGGCACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTCGCCGGGGGCGCCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggcggtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggct < 2:8001158/150‑1 (MQ=255) cGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggct < 2:7118586/150‑1 (MQ=255) cGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGGCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggcagtggctgtggcggtggcggtggcggtggcggtggcggtggctgtggcggtggctgtggct > 2:1922424/1‑150 (MQ=255) ggCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg > 1:11179602/1‑150 (MQ=255) gcgcCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgt < 1:4758266/150‑1 (MQ=255) gccgcGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtgg < 2:10915084/150‑1 (MQ=255) gccgcGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtgg < 2:6691086/150‑1 (MQ=255) cgcgCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggcg > 2:8858955/1‑149 (MQ=255) gcgcAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCTCGCTGGC‑‑‑‑‑‑tggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg < 2:3636723/150‑1 (MQ=255) cgcAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑Tggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggcggtggctgtggctgtggctgtggcggt > 2:5314319/1‑150 (MQ=255) gcAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGtt > 2:1768000/1‑150 (MQ=255) cAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTg < 2:3388609/150‑1 (MQ=255) cAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTg < 1:1813242/150‑1 (MQ=255) aGGCACGCCCGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGCCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGGGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGGGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTgg < 1:5034761/150‑1 (MQ=39) ggAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑GGGCTGTGGCGGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGGGGCTGTGGCGGTGGCTGGGGCTGTGGCGTTGGCGGTTggg > 1:4072766/1‑150 (MQ=255) ggAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCGTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACCCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGGTTTGGCTGTGGCGGTGGGTGTGGGTGTTGCTGTGGCTGTGGCTGTgggg > 1:6636372/1‑150 (MQ=255) gAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCTGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGGGGCGGTTgggg > 2:9334351/1‑149 (MQ=255) aaCGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTg > 2:10643415/1‑150 (MQ=255) aCGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGa < 1:7375474/150‑1 (MQ=255) gCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGNCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTNATc < 2:9285972/150‑1 (MQ=255) gCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCCCGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCGGTGGCGGTGGCTGTGGCTGGGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGGGGCTGGGGCGGTGGCTGTGGCGGTTGGGTGTTc > 1:1766229/1‑150 (MQ=38) 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gccgccGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGaa < 2:11060782/150‑1 (MQ=255) ccgccgGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAg < 1:5385865/150‑1 (MQ=255) cgccgGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGGGGCTGGGGCGGTGGCTGTGGCTGAGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAgg > 2:5079509/1‑150 (MQ=255) ccggccggCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCg < 1:2857326/150‑1 (MQ=25) cggccggcGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑GGGCTGTGGCTGGGGCTGGGGCTGTGGCTGGGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGCAGGGCa < 2:10769655/150‑1 (MQ=38) ggccgTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCAt > 2:10547903/1‑150 (MQ=255) gccgTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATc < 1:10537742/150‑1 (MQ=255) gTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGcc > 2:9121990/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCa < 2:2999462/150‑1 (MQ=255) cgcgGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAg < 1:354708/150‑1 (MQ=255) gcggcggcgCGTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCGGTGGCTGTGGCGGTGGCTGTGGCGTGGGCTGGGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGGAGGGCATCGCCAgc > 1:926493/1‑150 (MQ=38) gcggcgCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCGGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAgcggc > 2:8525262/1‑150 (MQ=255) gcTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGGTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCgg > 1:8270428/1‑150 (MQ=255) gcTTGCCGCGGGCGTCGGCGCCGCCACGCGGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCGGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCgg < 1:7808110/150‑1 (MQ=255) gcTGGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGGGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCgg < 1:5786020/150‑1 (MQ=255) ttGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCggaa > 1:6991224/1‑148 (MQ=255) ttGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGtt > 1:8451450/1‑150 (MQ=255) tGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTc < 2:2597778/150‑1 (MQ=255) ccGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCg < 1:5118675/150‑1 (MQ=25) cGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGc < 1:9530179/150‑1 (MQ=255) cGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGc < 1:3033432/150‑1 (MQ=255) ggggCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCGGTGGCGGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGGGGCTGGGGCGGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCg > 1:6490740/1‑150 (MQ=38) ggCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCgct < 2:8557737/150‑1 (MQ=255) ggCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCgct < 1:7965306/150‑1 (MQ=255) tCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCgctggct > 1:3493096/1‑150 (MQ=255) gcgcCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCGCTGGCTGCg > 2:6244676/1‑150 (MQ=255) gccgccACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCGCTGGCTGCGGc > 1:9577369/1‑150 (MQ=255) gccACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCGCTGGCTGCGGCTgg > 1:608063/1‑150 (MQ=255) cACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCGCTGGCTGCGGCTGgac > 1:9733248/1‑150 (MQ=255) ctggc‑‑‑‑‑‑tggctgTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGTGGATCCCAGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGGCGGTTCGGCCGCTGGCTGCGCCTGGacgacg > 2:6355018/1‑150 (MQ=37) ctggc‑‑‑‑‑‑tggctgTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCGCTGGCTGCGGCTGgacga < 1:1252486/148‑1 (MQ=255) tggc‑‑‑‑‑‑tggctgTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCGCTGGCTGCGGCTGGACGACgg > 1:9894846/1‑150 (MQ=255) | TGCGTCGGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑A‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGC‑‑‑‑‑‑TGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCGCTGGCTGCGGCTGGACGACGGGCG > NC_008463/96402‑96697 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |