| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_008463 | = 5251483 | 295 (0.590) | 8 (0.020) | 8/206 | 33.7 | 3.4% | noncoding (78/122 nt) | PA14_RS31290 | tRNA‑Lys |
| ? | NC_008463 | 5359438 = | 249 (0.720) | noncoding (31/76 nt) | PA14_RS24545 | tRNA‑Lys | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 364 total aligned reads displayed.
ATTGACATCACGTCAATGCGGGCCTAATGTTCGGCCCAGACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAGGTGGTCGGGGTAGAGAGATTCGAACTCCCGACATCCTGCTCCCAAAGCAGGCGCGCTACCGGACTGCGCTATACCCCGATTGGAATTTGGCTCCGCGACCTGGACTCGAA > NC_008463/5359289‑5359587 | atTGACATCACGTCAATGCGGGCCTAATGTTCGGCCCAGACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGc < 1:167806/150‑1 (MQ=255) gACATCACGTCAATGCGGGCCTAATGTTCGGCCCAGACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCaa > 1:1418188/1‑150 (MQ=255) aCATCACGTCAATGCGGGCCTAATGTTCGGCCCAGACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAAc > 1:1031524/1‑150 (MQ=255) cATCACGTCAATGCGGGCCTAATGTTCGGCCCAGACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACt < 1:4764895/150‑1 (MQ=255) cACGTCAATGCGGGCCTAATGTTCGGCCCAGACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGct > 1:1919902/1‑150 (MQ=255) aCGTCAATGCGGGCCTAATGTTCGGCCCAGACGGCTGCTAGACGAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGctc > 2:7784936/1‑150 (MQ=255) aCGTCAATGCGGGCCTAATGTTCGGCCCAGACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGctc > 1:6050287/1‑150 (MQ=255) aCGTCAATGCGGGCCTAATGTTCGGCCCAGACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGctc < 2:10031339/150‑1 (MQ=255) cGTCAATGCGGGCCTAATGTTCGGCCCAGACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTCGCCTATGCACCACGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTACACGCCAACTGctct < 2:3580049/150‑1 (MQ=17) cGTCAATGCGGGCCTAATGTTCGGCCCAGACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGctct < 1:10521757/150‑1 (MQ=255) gTCAATGCGGGCCTAATGTTCGGCCCAGACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTa > 2:1881144/1‑150 (MQ=255) tCAATGCGGGCCTAATGTTCGGCCCAGACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTAc > 2:10688530/1‑150 (MQ=255) cAATGCGGGCCTAATGTTCGGCCCAGACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTCGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTCCGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTAcc < 2:96022/150‑1 (MQ=255) cAATGCGGGCCTAATGTTCGGCCCAGACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAACATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTAcc > 1:560989/1‑150 (MQ=255) tGCGGGCCTAATGTTCGGCCCAGACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGCAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGAc < 2:823900/150‑1 (MQ=255) cGGGCCTAATGTTCGGCCCAGACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTg < 2:5260280/150‑1 (MQ=255) cGGGCCTAATGTTCGGCCCAGACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTg < 2:8824183/150‑1 (MQ=255) aaTGTTCGGCCCAGACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAAc < 2:4704013/150‑1 (MQ=255) 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cAGACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTAt < 1:2710057/150‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTAt > 1:9532123/1‑150 (MQ=255) aGACGGCTGCTAGACTAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATg < 1:11038738/150‑1 (MQ=255) gACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGa > 1:9203118/1‑150 (MQ=255) gACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGa > 2:6835387/1‑150 (MQ=255) ggCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCGTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAggt < 2:1753231/150‑1 (MQ=255) gctgctAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTATAAGCCAACTGCTCTACAGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAggtg > 2:4304377/1‑150 (MQ=255) gctgctAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAggtg < 1:4194424/150‑1 (MQ=255) tgctAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGTTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAggtggt < 1:10039708/150‑1 (MQ=255) tAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAGGTGGTCgg > 1:8487654/1‑150 (MQ=255) 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tgtAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAGGTGGTCGGGGTAGAGAGATTCGAACTCCCGACATCCTGCTCCCAAAGCAGGCGCGCTACCGGACTGCGCTATAcc < 2:9454469/150‑1 (MQ=255) tAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAGGTGGTCGGGGTAGAGAGATTCGAACTCCCGACATCCTGCTCCCAAAGCAGGCGCGCTACCGGACTGCGCTATAcccc > 1:3739618/1‑150 (MQ=255) gATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAGGTGGTCGGGGTAGAGAGATTCGAACTCCCGACATCCTGCTCCCAAAGCAGGCGCGCTACCGGACTGCGCTATACCCCGAt < 2:852237/150‑1 (MQ=255) aTTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAGGTGGTCGGGGTAGAGAGATTCGAACTCCCGACATCCTGCTCCCAAAGCAGGCGCGCTACCGGACTGCGCTATACCCCGAtt < 2:7253896/150‑1 (MQ=255) aaCCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAGGTGGTCGGGGTAGAGAGATTCGAACTCCCGACATCCTGCTCCCAAAGCAGGCGCGCTACCGGACTGCGCTATACCCCGATTGGAAt < 2:2793017/150‑1 (MQ=255) ccTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAGGTGGTCGGGGTAGAGAGATTCGAACTCCCGACATCCTGCTCCCAAAGCAGGCGCGCTACCGGACTGCGCTATACCCCGATTGGAAttt > 2:910286/1‑150 (MQ=255) cGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAGGTGGTCGGGGTAGAGAGATTCGAACTCCCGACATCCTGCTCCCAAAGCAGGCGCGCTACCGGACTGCGCTATACCCCGATTGGAATTTGGCt < 2:330539/150‑1 (MQ=255) gACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAGGTGGTCGGGGTAGAGAGATTCGAACTCCCGACATCCTGCTCCCAAAGCAGGCGCGCTACCGGACTGCGCTATACCCCGATTGGAATTTGGCTc > 1:2944994/1‑150 (MQ=255) aCCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAGGTGGTCGGGGTAGAGAGATTCGAACTCCCGACATCCTGCTCCCAAAGCAGGCGCGCTACCGGACTGCGCTATACCCCGATTGGAATTTGGCTcc > 2:1403434/1‑150 (MQ=255) ccAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAGGTGGTCGGGGTAGAGAGATTCGAACTCCCGACATCCTGCTCCCAAAGCAGGCGCGCTACCGGACTGCGCTATACCCCGATTGGAATTTGGCTCcg < 1:6987871/150‑1 (MQ=255) aTTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAGGTGGTCGGGGTAGAGAGATTCGAACTCCCGACATCCTGCTCCCAAAGCAGGCGCGCTACCGGACTGCGCTATACCCCGATTGGAATTTGGCTCCGCGa < 1:2300640/150‑1 (MQ=255) atGGTTAACAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAGGTGGTCGGGGTAGAGAGATTCGAACTCCCGACATCCTGCTCCCAAAGCAGGCGCGCTACCGGACTGCGCTATACCCCGATTGGAATTTGGCTCCGCGAc < 1:10157696/149‑1 (MQ=255) tgaaaaGCCAACTGCACTACCGACAGAGCTCACGACCCAAGTATGAGGTGGTCGGGGTAGAGAGATTCGAACTCCCGACATCCTGCTCCCAAAGCAGGCGCGCGAGCGGACTGCGCAATACCCCGATTGGAATTTGGCTCCGCGACCTgg > 2:7577837/3‑150 (MQ=255) tAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAGGTGGTCGGGGTAGAGAGATTCGAACTCCCGACATCCTGCTCCCAAAGCAGGCGCGCTACCGGACTGCGCTATACCCCGATTGGAATTTGGCTCCGCGACCTGGa > 2:3159410/1‑150 (MQ=255) aaaaGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAGGTGGTCGGGGTAGAGAGATTCGAACTCCCGACATCCTGCTCCCAAAGCAGGCGCGCTACCGGACTGCGCTATACCCCGATTGGAATTTGGCTCCGCGACCTGGAc > 2:10923920/1‑150 (MQ=255) aaaaGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAGCTGGTCGGGGTAGAGAGATTCGAACTCCCGACATCCTGCTCCCAAAGCAGGCGCGCTACCGGACTGCGCTATACCCCGATTGGAATTTGGCTCCGCGACCTGGAc < 1:10948519/150‑1 (MQ=255) gCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAGGTGGTCGGGGTAGAGAGATTCGAACTCCCGACATCCTGCTCCCAAAGCAGGCGCGCTACCGGACTGCGCTATACCCCGATTGGAATTTGGCTCCGCGACCTGGACTCGa > 2:5950732/1‑150 (MQ=255) | ATTGACATCACGTCAATGCGGGCCTAATGTTCGGCCCAGACGGCTGCTAGACAAGAACCGGCGTAACACCCCTTCCTAGCCTATGCAACTCGCCCCGTAGAAAATGGTGGGTCGTGTAGGATTCGAACCTACGACCAATTGGTTAAAAGCCAACTGCTCTACCGACTGAGCTAACGACCCAAGTATGAGGTGGTCGGGGTAGAGAGATTCGAACTCCCGACATCCTGCTCCCAAAGCAGGCGCGCTACCGGACTGCGCTATACCCCGATTGGAATTTGGCTCCGCGACCTGGACTCGAA > NC_008463/5359289‑5359587 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |