New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002745 | 607597 = | 173 (0.640) | 8 (0.030) +GCTGTCTGAGTCTGAG |
6/432 | 10.1 | 3.8% | coding (2383/2862 nt) | sdrC | MSCRAMM family adhesin SdrC |
? | NC_002745 | = 607832 | 265 (0.980) | coding (2618/2862 nt) | sdrC | MSCRAMM family adhesin SdrC | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
CTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAACGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCATTAGGATCATTATTGTTATTCGGTCGTCGTAAAAAAC > NC_002745/607599‑608065 | ctcagactcagaCAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAACGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACACAGACTCAGAAGCAGCTACCGAATAAGACTCAGAAAgaga > 1:1376443/1‑234 (MQ=17) cAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAACGACTCAGACTCTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGAGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCAAATCAGACACAGACAGAGATTCAGAATCaaa > 1:110063/1‑232 (MQ=17) gCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAACGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGCCTCAGACAGCGATTCTGCTTCAGATa > 1:400513/1‑234 (MQ=255) cactaatgttCAGACAGCATGTCAGACTCGGACAGCGGTCAAGATGCAGATAGCGAGTCTGATGCAGATAACGTCTCAGATTCGAACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCATATTCAGACAGCGACTCAGATTCATACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGc < 2:206596/226‑1 (MQ=14) cTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACACCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGCCTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑Ga > 1:215819/1‑234 (MQ=255) cTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGAACCACATTCAGATAGCGACCCAGACTGAGACAGCGATtcagattcagatctcga > 1:437237/1‑229 (MQ=17) gATTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGTGTCTGTCTCAGACACC‑‑‑‑‑‑GCCTCa > 1:563662/1‑234 (MQ=11) atCAGACAGCGACTCAGGGTCGGATAGCGAATCAGACTCAGATGGCGATTCGGACTCAGACAACGACTCAGACTCTGACAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGa < 1:1708697/233‑1 (MQ=17) nnnncGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAACGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGActcag < 1:123910/230‑5 (MQ=14) nnnncGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAACGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCg < 1:358448/230‑1 (MQ=255) acgtcGAGTCGGAGTCAGACAGCGACTCTGAGTCAGATAGCGAATCAGACTCATACAGCGATTCAGACTCAGACAGGGATACAGAATCAGACAGCGAGTCAGATTCATACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCg < 2:59672/230‑1 (MQ=11) gATTCAGATTCGGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAACGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGCCTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCCGACTCAGACAGCGACTCCGACTCACACAGC‑‑‑‑‑‑TACTCAGAcccagctagc > 1:793811/1‑225 (MQ=14) gATTCAGATTCGGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAACGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGAGATCTAGATTCAGACACCGACCCAGATTCAGATGCTGACTCAGACCCAGATATCGCCTCAGACTCAGATCCC‑‑‑‑‑‑GACTCAgcttccggtgca > 1:1018793/1‑223 (MQ=17) ttCAGATTCGGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAACGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGATACCGATTCAGCTTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACACAGATTCAGATTCCGACAGCGATTCACATTCCGACACTGACTCAGCGTCAGATATAGACTCAGACTCAGACAAAGATCCATACTCACCTACA‑‑‑‑‑‑GACTCATCCAGCGAATCaca > 1:1591284/1‑232 (MQ=18) aTACCGACTCAGATTCAGATAGCGAATCGGACTCAGACAACGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCg < 1:317053/234‑1 (MQ=255) aGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAACGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCgat > 1:1333151/1‑234 (MQ=255) attcagacTCCGATTCAGACTCAGACTCCGACACAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGattcagattcag < 1:537671/234‑1 (MQ=17) ttcagatAGCGATTCGGACTCAGACAACGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACACCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGTGATTCAGATTAGGATAGTGAttaagattcaga > 1:832539/1‑234 (MQ=255) tgttatctaTTCCGCCTCAGACTCCGACTCTGATTCTGACAGCGATTCAGCTTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATTGCGCTTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGCCTCAGACTCAGACTGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGc < 1:1682317/226‑1 (MQ=21) natAGCGATTCGGACTCAGACAACGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCa < 1:112642/233‑1 (MQ=255) ttCGGACTCAGACAACGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACa > 1:332538/1‑234 (MQ=255) ttCGGACTCAGACAACGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACa > 1:16215/1‑234 (MQ=255) ttCGGACTCAGACAACGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACACAGACTCAGATACAGATAGAGACACAGACACAGAAAGAGATTCAGAATCAGATAGA‑‑‑‑‑‑GATACAGATAGAGATTCAGAGTCAGATAAAGGTACACATACAGATGCAAGAAAACa > 2:672486/1‑234 (MQ=17) tCGGACTCAGACAACGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACAt < 1:983908/234‑1 (MQ=255) aCTCAGGCAACGACTCAGAGTCTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGATGCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTc < 1:1116354/234‑1 (MQ=255) nacagagatgcAGATTCCGACAGCGATTCAGACTCAGATGGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACt < 1:1287706/224‑1 (MQ=255) gccGAGTCAGATTCTGATACCGATTCAGACTCAGATACGGATTCAGATTCGGACAGCGAGTCAGATTCAGATAGCGATCCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTaaa < 2:1265570/232‑1 (MQ=18) gagtcagacaatGACACAGATTCAGACTAAGATAGCGAATAAGACACAGACAGCGACTGAGATTCAGATAGAGATTCAGATACAGATAGAGACTCAGATACAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACACAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCa < 2:1303156/223‑1 (MQ=21) cTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACACAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGA‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATACGGATAGAGATTCAGATTCAGATGCAGGGAAACAAAAACAGACTAAACCAAt > 2:1385556/1‑234 (MQ=21) gaGAATCAGACAGCGATTCAGAATCAGATCGCGACGCAGATGCAGACAGCGACTCAGAGTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGa < 2:332538/233‑1 (MQ=255) ggatacagACAGGGATACAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGAGACACAGATTCAGACAAGGATTCAGAGTCAGACAGGGATTCAGATACAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAg < 1:849988/227‑1 (MQ=21) atgcTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTa < 1:1008614/231‑1 (MQ=255) ttCTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACACAGATTCAGATAGTGACTCAGACACAGAAAACGATTCAGAATCAGATAGA‑‑‑‑‑‑GACGAAGCATGCGAATCAGATGCGAATAACGATTCAGATTCAGATGCGACAAGACATCAACCGACTAAACCacattgtac > 2:1502260/1‑226 (MQ=17) ttCTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTAc > 1:515782/1‑234 (MQ=255) cggACAGGGATTGAGACTCAGAGGGCGAGTCGGATTGAGGCAGCGAGTCAGATTGGGACGCAGATGCAGACACAGGAAACGGTTCAGAGTCAGACGGGGACTCAGATGGAGATAGGGGCTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACgg < 1:1471297/232‑1 (MQ=21) cTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATGCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACgg < 2:1333151/234‑1 (MQ=255) nnnncGAGTCAGACTCAGATAGCGACTCAGAGTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTa < 2:398270/230‑1 (MQ=255) nncGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTaaa < 1:99071/232‑1 (MQ=255) nncGAATCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTaaa < 1:1143731/232‑1 (MQ=255) agagagtCAGACTAAGATAGAGAATCAGATTCAGAGAGAGAGTCAGATACAGAGCGCGAGTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGAATCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTaaa < 2:464413/228‑1 (MQ=21) aGCGACTCAGACGCCGATAGTGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGAGTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTaaa < 2:16215/234‑1 (MQ=255) ttCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGAACGGTTAAAGATCa > 1:1315175/1‑234 (MQ=255) ttCAGACTCAGATAGCCAGTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGAt < 2:1113959/139‑1 (MQ=255) ctCAGATTCCGATAGTGACTCGGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGAATCAGATAGTGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCa > 1:461427/2‑234 (MQ=17) tacacagacgcagactcagacagagactcagactcagacagcGATTCAGACTCAGATAGAGATTCAGACTCAGATACCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGAGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACa < 2:537517/228‑1 (MQ=21) aTAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAg < 1:897002/234‑1 (MQ=255) agcgactcagattcagacagcgactcagattcagacAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGTGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACGCAGACAGAGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGGAAACATACATCAACAAAATCATTGTGTCCTGTTAAACATCAGCATAAAACAGCt > 1:1211824/1‑234 (MQ=21) ctcagattcagacagcgactcagattcagacagcgaTTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTGCGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGc > 1:880251/1‑234 (MQ=255) ctcagattcagacagcgactcagattcagacagcgaTTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCa > 1:271614/1‑219 (MQ=255) ttcagatagcgactcagattcagacagcgaTTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTAcc < 1:1302053/234‑1 (MQ=255) tcagacagcgactcagattcagacagcgaTTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACTACTAAAGACCATCACAATAAAGCAAAAGCATTACCa < 1:743393/234‑1 (MQ=17) cagacagcgactcagattcagacagcgaTTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAg < 1:1502260/234‑1 (MQ=255) gacagcgactcagattcagacagcgaTTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATACA‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGAATCAGATTCGGATAGTGATACAGATTTAGATGCAAGGAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTCAAAGATCAGCATAAAACAGCTTATGCATTACCAGaa > 1:704283/1‑234 (MQ=25) ctcagattcagacagcgaTTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAg > 2:274931/1‑234 (MQ=255) ctcagattcagacagcgaTTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAACGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAg < 2:715347/230‑1 (MQ=255) tcagatgcagaaagagaTTCAGATACAGATAGAGATTCAGAGTCAGACAGAGACGCAGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGt < 2:104211/234‑1 (MQ=37) agcgaTTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAaataataat > 1:1565465/1‑234 (MQ=255) ttcagattcagaTAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCTGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTACTACTAATCCAATGAGTACGGTTAACGCTCAGCATAACACAGCTAACGCCTTACCCGCACCACGTAGTGATAATAATAATTCaaa > 2:837995/1‑234 (MQ=25) ttcagattcagaTAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGAATCAGACAGAGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGAGATTCAGATTAGGATAGAGATAAAGATTCAGATGCAGGTAAACATAATCCGACTAAACAAATGAGAACAGTAAAAGAACAACAAAAAACAGCTAAAGAATTAAAAGAAACAGGCAATGAAAAAAAAAATTaaaa > 2:1290222/1‑234 (MQ=21) tacagattcagacAGCGATTCAGATTGAGACACCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGAGTCAGATTTAGATTGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCaaa < 1:634816/232‑1 (MQ=25) cagattcagatAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAaata < 2:796956/234‑1 (MQ=255) cagactcagatAGCGAATCAGATTCAGACAGAGACTCAGATACAGATAGCGACTCAGACACAGACAGAGATTCAGACACAGATAGA‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAaata < 2:1148499/234‑1 (MQ=25) gattccgatAGCGATTCAGATTCAGACAGTGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAaataat > 2:971530/1‑234 (MQ=255) attcagatAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATg < 1:837995/234‑1 (MQ=255) acagatAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGc < 1:507985/233‑1 (MQ=255) cagatAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGca > 1:1392393/1‑234 (MQ=255) tAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACatt < 1:715569/234‑1 (MQ=255) ttcagattcagaCAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCgg > 1:1174274/1‑234 (MQ=255) cagattcagaCAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAATGAAAATAGTGGCTCAAATAACGCAACGTTATTTggcg < 1:1677367/234‑3 (MQ=21) cagaCAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGattat > 1:952592/1‑234 (MQ=255) agaCAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGattatt < 2:518602/234‑1 (MQ=255) nnnnncGACGCGGATGCGGATAGCGAGTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAGCAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTc < 2:311911/229‑1 (MQ=255) gataGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGa > 2:144294/4‑234 (MQ=18) gCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCCGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTACGACTAAACCACTGAGTACGGCTAAAGATCAGCATAAAACAGCGAAAGCATTACCAGAATCAGGTAGTGCAGATACTAATGCAAATCATGGCACATTATTTGGTGGATTATTcccgt > 2:1645272/1‑233 (MQ=38) gACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCa > 1:1221670/1‑234 (MQ=255) aCTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCAt < 1:1744518/234‑1 (MQ=255) aCTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCAt < 1:386880/234‑1 (MQ=255) cTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCAtt < 1:1046062/234‑1 (MQ=255) cTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCAtt > 1:520372/1‑234 (MQ=255) cTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGAACAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCAtt < 1:114231/234‑1 (MQ=255) cagactgagacAGCGACTCAGACACAGACAGCGATTCAGACACAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTGCCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCATTAg < 1:642049/234‑1 (MQ=255) ttcagatAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCATTAGGATc > 2:509087/1‑234 (MQ=255) ctcagatAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGACCCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACACCGACTAAATCAGTGACTGCGGTTAAAGACCAGCATAAAACAGCTAAAGCATCACCAGAAGCAGGCAGTGAAGATAATAATTCAAATAATGGCACAGTATCAGGTGGAGTAGTCGCGGCATTAGGacc > 1:1193723/2‑232 (MQ=37) cagatAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCATTAGGATCat < 1:164182/234‑1 (MQ=255) cagatAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCATTAGGATCat > 1:1081639/1‑234 (MQ=255) gtgactcagactcaGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGCTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCATTAGGATCATTATTGt > 1:1350266/3‑234 (MQ=255) gCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCATTAGGATCATTATTGt > 1:1243768/1‑234 (MQ=255) gactcagactcaGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GATTCAGACAGAGATTCAGATTAGGATAGTGATTCAGATTCAGATGCTGGGAAAAATACTCAGAATAAAACAATGAGTACGGTTAAAGATAAGGATAAAAAAGATAAAGAATTAAAAAAAAGAGGAAGTGAAGATAATAATTTAAATAATGTAAGATTATTAGTTGGATTATTTGGTGGTTTAGGATAAttattatta > 2:552472/1‑234 (MQ=255) gactcagactcaGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCATTAGGATCATTATTGTTa > 1:1433582/1‑234 (MQ=255) gactcagactcaGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCATTAGGATCATTATTGTTa > 1:144868/1‑234 (MQ=255) gactcagactcaGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCATTAGGATCATTATTGTTa > 1:959880/1‑234 (MQ=255) ctcagactcagaCAGTGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCATTAGGATCATTATTGTTAtt > 2:1588041/1‑234 (MQ=255) ctcagactcagaCAGCGATTCCGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGCAAACATACTCCGACTAAACCAATGCGTACGGCTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGCAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCATTAGGATCATTATTGTTAtt > 2:63656/1‑234 (MQ=255) ctcagactcagaCAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCAt > 1:413471/1‑215 (MQ=255) ctcagactcagaCAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCATTAGGATCATTATTGTTAtt > 2:927908/1‑234 (MQ=255) cgcagactcagacAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCATTAg < 2:859355/216‑1 (MQ=255) tgactcagacAGCGATTCAGACTCAGATGGC‑‑‑‑‑‑GACGCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTGAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAAAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACGTGATACTGTAGATAATTCGCGGCATTAGGATCATTATTGTTATTCgg < 2:1350266/233‑1 (MQ=255) agactcagacAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCATTAGGATCATTATTGTTATTCgg < 1:927908/234‑1 (MQ=255) cagatAGCGACTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCATTAGGATCATTATTGTTATTCGgtcgtc > 1:1180721/1‑234 (MQ=255) aGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCATTAGGCTCATTATTGTTATTCGGTCGTCGTaaa > 2:1141742/1‑234 (MQ=255) | CTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAACGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGC‑‑‑‑‑‑GACTCAGACAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCAGATTCAGATGCAGGTAAACATACTCCGACTAAACCAATGAGTACGGTTAAAGATCAGCATAAAACAGCTAAAGCATTACCAGAAACAGGTAGTGAAAATAATAATTCAAATAATGGCACATTATTCGGTGGATTATTCGCGGCATTAGGATCATTATTGTTATTCGGTCGTCGTAAAAAAC > NC_002745/607599‑608065 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |