New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002745 | 777410 = | 304 (1.130) | 16 (0.060) | 9/464 | 9.2 | 4.5% | intergenic (+399/+480) | SA_RS03870/SA_RS03880 | 5'‑3'‑deoxyribonucleotidase/diacylglycerol kinase family lipid kinase |
? | NC_002745 | = 2526748 | 379 (1.400) | intergenic (+228/+134) | SA_RS12920/SA_RS12925 | CPBP family intramembrane metalloprotease/MFS transporter | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 379 total aligned reads displayed.
AAAATTTTTCAGAGTATTATCCATTATCCATACACATCAAAAAGCACACTTAAAAGTCAGTATCACAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCATGAATCGCCATGCTCAATATACCTTTTAAAATTTAAATATTCATTAACTTAATATGCTTTAATTCACTTCATTAAAGACTACTCGCTGGACGTGGTGTTGGCTTTTTCAAGAAACTCATAATCATTATTACAATGACTAACATACCACAAATTAGATACATCCATT > NC_002745/2526519‑2526976 | aaaaTTTTTCAGAGTATTATCCATTATCCATACACATCAAAAAGCACACTTAAAAGTCAGTATCACAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCt > 1:62829/1‑234 (MQ=255) gTATTATCCATTATCCATACACATCAAAAAGCACACTTAAAAGTCAGTATCACAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATCTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGga < 1:427909/234‑1 (MQ=255) ccatACACATCAAAAAGCACACTTAAAAGTCAGTATCACAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAAtt > 1:1223253/1‑234 (MQ=255) ccatACACATCAAAAAGCACACTTAAAAGTCAGTATCACAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAAtt > 2:70967/1‑234 (MQ=255) acacATCAAAAAGCACACTTAAAAGTCAGTATCACAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTc < 1:917180/234‑1 (MQ=255) acacATCAAAAAGCACACTTAAAAGTCAGTATCACAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTc < 1:1285697/234‑1 (MQ=255) cacaTCAAAAAGCACACTTAAAAGTCAGTATCACAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCg > 1:1533358/1‑234 (MQ=255) caTCAAAAAGCACACTTAAAAGTCAGTATCACAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGaa > 2:94785/1‑234 (MQ=255) caTCAAAAAGCACACTTAAAAGTCAGTATCACAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGaa > 2:1333541/1‑234 (MQ=255) tCAAAAAGCACACTTAAAAGTCAGTATCGCAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGaaaa < 2:1613465/234‑1 (MQ=255) tCAAAAAGCACACTTAAAAGTCAGTATCACAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAGCCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGaaaa < 1:389631/234‑1 (MQ=255) aaaaGCACACTTAAAAGTCAGTATCACAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAatat > 2:170598/1‑234 (MQ=255) aaaaGCACACTTAAAAGTCAGTATCACAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAatat > 2:1092970/1‑234 (MQ=255) aaaGCACACTTAAAAGTCAGTATCACAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACACAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATc > 1:1485860/1‑234 (MQ=255) aaaGCACACTTAAAAGTCAGTATCACAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATc > 1:803652/1‑234 (MQ=255) aGCACACTTAAAAGTCAGTATCACAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCAt < 1:1646606/234‑1 (MQ=255) ttAAAAGTCAGTATCACAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTc < 1:1269092/234‑1 (MQ=255) ttAAAAGTCAGTATCACAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACCGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTc < 1:232210/234‑1 (MQ=255) tATCACAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCATg > 2:68974/1‑234 (MQ=255) tCACAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTc < 2:507345/221‑1 (MQ=255) acaACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCATGAATc < 1:274221/234‑1 (MQ=255) acaACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTCCAACTCCCATGAATc < 2:1573621/234‑1 (MQ=255) aaCTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCATGAATCGc < 2:810971/234‑1 (MQ=255) ncTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTGAATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAGTGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTCCCGCTCAAATAAATCGcc < 2:1223253/233‑1 (MQ=255) aCTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCATGAATCGcc < 2:148029/234‑1 (MQ=255) aCTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCATGAATCGcc < 1:94785/234‑1 (MQ=255) ttttAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCATGAATCGcc > 2:442922/1‑228 (MQ=255) gCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGATGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCATGAATCGCCATGCTCAAtata > 2:1511451/1‑234 (MQ=255) ttatttaGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCATGAATCGcc > 2:860517/1‑215 (MQ=255) ttatttaGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCATGAATCGCCATGCTCAATATACCTTTTa > 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ttatttaGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCATGAATCGCCATGCTCAATATACCTTTTa > 1:1314923/1‑234 (MQ=255) ttatttaGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCATGAATCGCCATGCTCAATATACCTTTTa > 2:746926/1‑234 (MQ=255) aCTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCATGAATCGCCATGCTCAATATACCTTTTAAAATTTAAatat < 1:1333057/234‑1 (MQ=255) 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gagaCATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCATGAATCGCCATGCTCAATATACCTTTTAAAATTTAAATATTCATTAACTTAATATGCTTTAATTCACTTCATTaa > 1:570064/1‑234 (MQ=255) gagaCATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCATGAATCGCCATGCTCAATATACCTTTTAAAATTTAAATATTCATTAACTTAATATGCTTTAATTCACTTCATTaa > 2:65741/1‑234 (MQ=255) cgaCATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGCCGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTATAGTAGACCTTGCCGGGACGGGACGACGCAACAAGTTTTTCGAAAATATCATTTCTGGCCCACTCCCACGTATCGCCATACCCAGTTTACCTTTTAAATTTTACTTATTGCTTAACTTAATATGCTTTGATTTAATTCATTaaa > 2:1305058/2‑234 (MQ=17) 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tCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCATGAATCGCCATGCTCAATATACCTTTTAAAATTTAAATATTCATTAACTTAATATGCTTTAATTCACTTCATTAAAGACTACTCGCTGGACGTGGTGTTGGCTTTTTCAAGAAACTCATAATCATTATTACAATGACTAACATACCACAAATTAGATAc < 2:1660902/234‑1 (MQ=255) tAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCATGAATCGCCATGCTCAATATACCTTTTAAAATTTAAATATTCATTAACTTAATATGCTTTAATTCACTTCATTAAAGACTACTCGCTGGACGTGGTGTTGGCTTTTTCAAGAAACTCATAATCATTATTACAATGACTAACATACCACAAATTAGATACATCCAtt > 1:1584478/1‑234 (MQ=255) | AAAATTTTTCAGAGTATTATCCATTATCCATACACATCAAAAAGCACACTTAAAAGTCAGTATCACAACTCACTTTTAAGCGTGCTTTATTTAGATATACTGTCGTTCTAAAAACGAGCCATATAGAGAGCCTGAGACATAAATCAATGTTCAATGCTCTACAAAGTTATATTGGCAGTAGTTGACTGAACGAAAATGCGCTTGTAACAAGCTTTTTTCAATTCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTTCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCATGAATCGCCATGCTCAATATACCTTTTAAAATTTAAATATTCATTAACTTAATATGCTTTAATTCACTTCATTAAAGACTACTCGCTGGACGTGGTGTTGGCTTTTTCAAGAAACTCATAATCATTATTACAATGACTAACATACCACAAATTAGATACATCCATT > NC_002745/2526519‑2526976 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |