New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 4385920 = | 319 (1.090) | 3 (0.010) | 3/256 | NT | 0.98% | coding (39/1338 nt) | amiB | N‑acetylmuramoyl‑l‑alanine amidase II |
? | CP009273 | = 4385916 | 308 (1.140) | coding (35/1338 nt) | amiB | N‑acetylmuramoyl‑l‑alanine amidase II | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 349 total aligned reads displayed.
ACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATCAAAGCAAACGCACCGTGGCGCTCGAT > CP009273/4385773‑4386067 | aatacacattgattatcaggcacaaggccgtgaggcgcgcgtgagtgcggtttcctctgcgggtgaattgttgctggcgcgtttagccggttaacctttgaaaggtggcgggatgatgtatcgcatcagaaattggttggtagcgacgc > 2:1201357‑M1/148‑149 (MQ=255) aatacacattgattatcaggcacaaggccgtgaggcgcgcgtgagtgcggtttcctctgcgggtgaattgttgctggcgcgtttagccggttaacctttgaaaggtggcgggatgatgtatcgcatcagaaattggttggtagcgacgc > 2:2789377‑M1/148‑149 (MQ=255) cacattgattatcaggcacaaggccgtgaggcgcgcgtgagtgcggtttcctctgcgggtgaattgttgctggcgcgtttagccggttaacctttgaaaggtggcgggatgatgtatcgcatcagaaattggttggtagcgacgctgct < 1:2643201‑M1/6‑1 (MQ=255) cattgattatcaggcacaaggccgtgaggcgcgcgtgagtgcggtttcctctgcgggtgaattgttgctggcgcgtttagccggttaacctttgaaaggtggcgggatgatgtatcgcatcagaaattggttggtagcgacgctgctgc > 1:1319663‑M1/142‑149 (MQ=255) cattgattatcaggcacaaggccgtgaggcgcgcgtgagtgcggtttcctctgcgggtgaattgttgctggcgcgtttagccggttaacctttgaaaggtggcgggatgatgtatcgcatcagaaattggttggtagcgacgctgctgc < 1:745155‑M1/8‑1 (MQ=255) cattgattatcaggcacaaggccgtgaggcgcgcgtgagtgcggtttcctctgcgggtgaattgttgctggcgcgtttagccggttaacctttgaaaggtggcgggatgatgtatcgcatcagaaattggttggtagcgacgctgctgc > 1:2841151‑M1/142‑149 (MQ=255) cattgattatcaggcacaaggccgtgaggcgcgcgtgagtgcggtttcctctgcgggtgaattgttgctggcgcgtttagccggttaacctttgaaaggtggcgggatgatgtatcgcatcagaaattggttggtagcgacgctgctgc < 2:927600‑M1/8‑1 (MQ=255) attgattatcaggcacaaggccgtgaggcgcgcgtgagtgcggtttcctctgcgggtgaattgttgctggcgcgtttagccggttaacctttgaaaggtggcgggatgatgtatcgcatcagaaattggttggtagcgacgctgctgct < 1:58651‑M1/9‑1 (MQ=255) attgattatcaggcacaaggccgtgaggcgcgcgtgagtgcggtttcctctgcgggtgaattgttgctggcgcgtttagccggttaacctttgaaaggtggcgggatgatgtatcgcatcagaaattggttggtagcgacgctgctgct < 1:1879264‑M1/9‑1 (MQ=255) aTTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGctgctgctgctg > 1:917110/1‑149 (MQ=255) tATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCtgtg > 1:23735/1‑149 (MQ=255) tATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCtgtg > 2:3611798/1‑149 (MQ=255) tATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCtgtg > 1:5044126/1‑149 (MQ=255) tCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCa > 1:4941623/1‑149 (MQ=255) ggCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGc < 1:4693476/149‑1 (MQ=255) gCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGACTTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGcc > 2:3649084/1‑149 (MQ=255) gCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGcc > 1:669146/1‑149 (MQ=255) ggCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCggtggg > 1:3844281/1‑149 (MQ=255) gCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGTCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCggtgggt < 1:4529354/149‑1 (MQ=255) gCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCggtgggt < 2:3011140/149‑1 (MQ=255) gCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCggtgggt > 1:4029044/1‑149 (MQ=255) gCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCggtgggt < 2:2281178/149‑1 (MQ=255) gTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGTCGGTGGGTGcc < 2:2984662/149‑1 (MQ=255) gTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGcc < 1:3583537/149‑1 (MQ=255) ggCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGa < 2:4876638/149‑1 (MQ=255) ggCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGa > 2:2483365/1‑149 (MQ=255) gcgTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGctc < 1:4112617/149‑1 (MQ=255) cgTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGctct > 1:858266/1‑149 (MQ=255) gTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGctctc < 2:4654414/149‑1 (MQ=255) tGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGctctct < 1:3150286/149‑1 (MQ=255) gTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGat < 2:4685547/149‑1 (MQ=255) tGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGTGACGCTCTCTGata < 1:2422893/149‑1 (MQ=255) tGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGata < 1:3697347/149‑1 (MQ=255) tCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGt < 1:3878748/149‑1 (MQ=255) ctctGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGttt < 1:1020359/149‑1 (MQ=255) tctGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTc < 2:2124920/149‑1 (MQ=255) tGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTa > 1:3447880/1‑149 (MQ=255) cGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAAc < 2:163605/149‑1 (MQ=255) ggTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACgg < 1:4033157/149‑1 (MQ=255) ggTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACgg > 1:1196254/1‑149 (MQ=255) tGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTa < 2:3067200/149‑1 (MQ=255) aaTTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAAt < 1:4223678/149‑1 (MQ=255) tgttgCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCaa > 2:239060/1‑149 (MQ=255) tgttgCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCaa < 2:3736169/149‑1 (MQ=255) gttgCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAAc > 2:2200233/1‑149 (MQ=255) tgCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAg > 1:4519664/1‑149 (MQ=255) ggCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGgcgc < 1:3009587/149‑1 (MQ=255) gcgcGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg > 2:2152574/1‑149 (MQ=255) gcgTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGa < 2:2067106/149‑1 (MQ=255) gcgTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGa > 2:4241282/1‑149 (MQ=255) gcgTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGa < 2:955196/149‑1 (MQ=255) gTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATa > 2:2561425/1‑149 (MQ=255) ttAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGTTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAAc < 2:1430948/149‑1 (MQ=255) ttAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAAc < 1:2905067/149‑1 (MQ=255) aGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGt < 1:4836179/149‑1 (MQ=255) aGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGt > 2:2731294/1‑149 (MQ=255) gCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGtt < 2:1396908/149‑1 (MQ=255) gCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGtt > 2:1816988/1‑149 (MQ=255) ccGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTg > 2:2292964/1‑149 (MQ=255) ccGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTg < 2:4317803/149‑1 (MQ=255) cGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCATCAGGCGCGGATAACGTTGa > 1:1471132/1‑149 (MQ=255) gTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGt < 1:205156/149‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGttt < 1:3079688/149‑1 (MQ=255) aaCCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGtttt > 2:1612126/1‑149 (MQ=255) aaCCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGtttt < 1:2460790/149‑1 (MQ=255) cTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTAtt > 1:16523/1‑149 (MQ=255) aGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATc > 2:1241581/1‑149 (MQ=255) ggTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATcc > 2:4424858/1‑149 (MQ=255) ggCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGa < 2:5160524/149‑1 (MQ=255) ggCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGa > 1:1802737/1‑149 (MQ=255) ggCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGa < 1:1358271/149‑1 (MQ=255) ggCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGa < 1:4069475/149‑1 (MQ=255) gCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGAt < 1:3749996/149‑1 (MQ=255) ggATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTAt > 1:5196435/1‑149 (MQ=255) ggATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTAt > 2:2934652/1‑149 (MQ=255) gatgatGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATg > 2:4782495/1‑149 (MQ=255) atgatgTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGc < 1:4178841/149‑1 (MQ=255) tgatgTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCg < 1:4349430/149‑1 (MQ=255) tgatgTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCg > 2:3226516/1‑149 (MQ=255) tatgTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGTTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGt < 2:4094868/148‑1 (MQ=255) gatgTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGt < 2:3431159/149‑1 (MQ=255) tgTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATACAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGttt > 1:4393872/1‑149 (MQ=255) tATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAg > 2:155444/1‑149 (MQ=255) tgtatcgcatcagaaattggttggtagcgacGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGc > 2:2854426‑M1/32‑149 (MQ=255) aTCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGc > 1:1855537/1‑149 (MQ=255) gCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCAt < 2:1035556/149‑1 (MQ=255) cATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATc < 2:1879264/149‑1 (MQ=255) cATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATc < 2:58651/149‑1 (MQ=255) gAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATCAAAGc < 2:3966394/149‑1 (MQ=255) aaTTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATCAAAGCaa < 2:1377938/149‑1 (MQ=255) aaTTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATCAAAGCaa < 2:1099797/149‑1 (MQ=255) ttggtAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATCAAAGCAAACGCAc < 1:3282111/149‑1 (MQ=255) ttggtAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATCAAAGCAAACGCAc < 1:2583434/149‑1 (MQ=255) gtAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATCAAAGCAAACGCACCGt < 2:641823/149‑1 (MQ=255) aGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATCAAAGCAAACGCACCGTgg < 2:1702451/149‑1 (MQ=255) aGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATCAAAGCAAACGCACCGTgg < 1:4730455/149‑1 (MQ=255) aGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATCAAAGCAAACGCACCGTgg < 2:5031168/149‑1 (MQ=255) aGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATCAAAGCAAACGCACCGTgg < 1:116362/149‑1 (MQ=255) aCGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATCAAAGCAAACGCACCGTGGCGCt < 2:4507843/149‑1 (MQ=255) tgctgctgctgTGCACGCCTGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATCAAAGCAAACGCACCGTGGCGCTCGat < 1:1987052/149‑1 (MQ=255) | ACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATCAAAGCAAACGCACCGTGGCGCTCGAT > CP009273/4385773‑4386067 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |