| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | CP009273 | 1,427,903 | IS3 (–) +3 bp | 13.8% | coding (27‑29/591 nt) | pinR ← | Rac prophage; putative site‑specific recombinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1089701 = | NA (NA) | 32 (0.110) | 23/276 | NT | NA | noncoding (1258/1258 nt) | IS3 | repeat region |
| ? | CP009273 | = 1427905 | NA (NA) | coding (27/591 nt) | pinR | Rac prophage; putative site‑specific recombinase | |||||
| * | ? | CP009273 | = 1090958 | NA (NA) | 32 (0.110) | 22/276 | NT | 13.5% | noncoding (1/1258 nt) | IS3 | repeat region |
| ? | CP009273 | 1427903 = | 200 (0.700) | coding (29/591 nt) | pinR | Rac prophage; putative site‑specific recombinase | |||||
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
CAAGCAACCGGTTAAAACCAGGACGCTCACTGGTTGCTGCTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATGCGTATGCAACCCCG > CP009273/1427760‑1428052 | aagcttcagggcttcactgcgaaattcaggcgaatgctgtttacggggttttttactggttgatactgtttttgtcatgtgagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGa < 2:955188‑M2/6‑1 (MQ=255) cttcactgcgaaattcaggcgaatgctgtttacggggttttttactggttgatactgtttttgtcatgggagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCaaa < 2:5043135‑M2/17‑1 (MQ=255) ctgcgaaattcaggcgaatgctgtttacggggttttttactggttgatactgtttttgtcatgtgagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTc < 1:243726‑M2/22‑1 (MQ=255) aGGACGCTCACTGGTTGCTGCTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCgag < 1:4564109/149‑1 (MQ=32) ggACGCTCACTGGTTGCTGCTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCgaga < 2:1358712/149‑1 (MQ=32) ggACGCTCACTGGTTGCTGCTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCgaga < 2:1358742/149‑1 (MQ=32) gACGCTCACTGGTTGCTGCTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGAc < 1:61845/149‑1 (MQ=32) gACGCTCACGGGTTGCTGCTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGAc < 2:4627530/149‑1 (MQ=17) gCTCACTGGTTGCTGCTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGTTTTTAGGTGGTCTGATACAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATa > 1:1377064/1‑149 (MQ=12) gCTCACTGGTTGCTGCTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATa < 1:2007675/149‑1 (MQ=32) cACTGGTTGCTGCTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTg > 1:2582735/1‑149 (MQ=32) ttGCTGCTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGActc > 2:3511434/1‑149 (MQ=32) tgctgAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCtata < 2:4926914/149‑1 (MQ=32) tgAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGa < 2:1543007/149‑1 (MQ=32) cggtgttttttactggttgatactgtttttttcatgtgagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAAt < 1:4632269‑M2/49‑1 (MQ=255) cggggttttttactggttgatactgtttttgtcatgtgagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAAt < 2:2973491‑M2/49‑1 (MQ=255) cggggttttttactggttgatactgtttttgtcatgtgagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAAt < 2:389210‑M2/49‑1 (MQ=255) gCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTgg > 1:3329748/1‑149 (MQ=32) tAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGgtg < 1:3113518/149‑1 (MQ=32) tAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGgtg > 1:844278/1‑149 (MQ=32) aTGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGtt < 1:2778677/149‑1 (MQ=32) gtgtTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTtca > 2:1159130/1‑149 (MQ=32) actggttgatactgtttttgtcatgtgagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTtcata < 2:6039‑M2/60‑1 (MQ=255) ttcttcGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTtcatat < 1:2848603/149‑1 (MQ=32) ttcttcGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTtcatat > 2:3258939/1‑149 (MQ=32) tgatactgtttttgtcatgtgagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATaa > 2:4277496‑M2/84‑149 (MQ=255) cGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATaa < 1:1105037/149‑1 (MQ=32) gATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAAt > 1:436243/1‑149 (MQ=32) atactgtttttgtcatgtgagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATg > 1:1600053‑M2/82‑149 (MQ=255) ttattTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGc > 1:1176527/1‑149 (MQ=32) ttattTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGc < 1:3808374/149‑1 (MQ=32) tactgtttttgtcatgtgagtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGc > 2:4441003‑M2/81‑149 (MQ=255) tattTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCa < 1:2494391/149‑1 (MQ=32) tattTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCa < 1:4698543/149‑1 (MQ=32) attTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCAt < 1:848060/149‑1 (MQ=32) tttGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATGTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCAtc < 2:1045003/149‑1 (MQ=17) ttGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCAtct < 1:1238114/149‑1 (MQ=32) ttGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCAtct < 2:2422168/149‑1 (MQ=32) tGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCAtctc < 1:4491824/149‑1 (MQ=32) tGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGa > 1:1508388/1‑149 (MQ=32) ggTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGaaaa < 2:214609/149‑1 (MQ=32) gTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAACAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAaat < 1:4908898/149‑1 (MQ=17) gTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAaat < 2:2690404/149‑1 (MQ=32) tttGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAaata > 2:4218472/1‑149 (MQ=32) ttGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAaataa > 2:5143349/1‑149 (MQ=32) ttGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAaataa < 2:2893358/149‑1 (MQ=32) tGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAaataat < 1:1473311/149‑1 (MQ=32) gATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAAtt < 2:4952210/149‑1 (MQ=32) aTTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTa < 1:1754697/149‑1 (MQ=32) ttttAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTAt > 2:2605018/1‑149 (MQ=32) ttttAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTAt > 2:1378182/1‑149 (MQ=32) ttttAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTAt > 2:1546701/1‑149 (MQ=32) ttttAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTAt < 1:1034126/149‑1 (MQ=32) agtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTAt < 1:2079709‑M2/87‑1 (MQ=255) agtcacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTAt < 1:2913328‑M2/87‑1 (MQ=255) agtcaccactgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTAt > 1:3740552‑M2/63‑149 (MQ=255) tAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGat < 1:1697166/149‑1 (MQ=32) cacctctgactgagagtttactcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGat > 2:3582548‑M2/60‑149 (MQ=255) aCCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGattatt > 1:413810/1‑149 (MQ=32) aCCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATATCAGAAAATAATTATGattatt > 2:3907557/1‑149 (MQ=17) tGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTAttttt < 1:297575/149‑1 (MQ=32) tttCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCa > 1:1249900/1‑149 (MQ=32) cGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCatat < 1:667176/149‑1 (MQ=32) cGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCatat < 2:757724/149‑1 (MQ=32) gATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATAtt > 1:4714341/1‑149 (MQ=32) gATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATAtt < 1:987095/149‑1 (MQ=32) tttCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTtg > 2:2949972/1‑149 (MQ=32) ctcacttagccgcgtgtccactattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTtgta < 2:2174373‑M2/110‑1 (MQ=255) ccGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTtgtatg > 2:411106/1‑149 (MQ=32) cGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATttgtttgt > 2:4397621/1‑149 (MQ=17) cGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTtgtatgt < 1:4003967/149‑1 (MQ=32) cGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTtgtatgt < 1:4127619/149‑1 (MQ=32) gCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTac > 1:3913157/1‑149 (MQ=32) gCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTac > 1:168167/1‑149 (MQ=32) gTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTacac < 2:3094316/149‑1 (MQ=32) ttGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACg < 2:4120120/149‑1 (MQ=32) ttGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACg > 2:3938249/1‑149 (MQ=32) tGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGt < 1:2547637/149‑1 (MQ=32) ttttCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCg < 2:2242915/149‑1 (MQ=32) ttttCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCg > 2:4718983/1‑149 (MQ=32) cGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGaaaa < 1:4527356/149‑1 (MQ=32) gtggtCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATa < 2:4525994/149‑1 (MQ=32) tggtCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATaa < 2:4407474/149‑1 (MQ=32) ggtCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATaaa < 1:3424968/149‑1 (MQ=32) tattgctgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAAc > 2:323273‑M2/19‑149 (MQ=255) tGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGaa > 2:3652452/1‑149 (MQ=32) tGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGaa < 2:3488431/149‑1 (MQ=32) gATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATACTTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAAt > 2:1682780/1‑149 (MQ=17) gATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAAt < 2:3330458/149‑1 (MQ=32) tgggtaagatcaATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATGc > 1:3436975‑M2/13‑149 (MQ=255) tCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATga > 2:338292/1‑148 (MQ=17) tCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATGc < 1:3511433/149‑1 (MQ=32) ccAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAAGTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGATCGAAAATAAACGAATGCg > 1:258600/1‑149 (MQ=17) cAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCTAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGTAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATGCGt < 2:4746041/149‑1 (MQ=17) aGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATGCGTa > 1:4359422/1‑149 (MQ=32) gCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATGCGTAt > 2:2845571/1‑149 (MQ=32) cGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATGCGTATg < 1:1846526/149‑1 (MQ=32) gTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATGCGTATGc > 1:3031179/1‑149 (MQ=32) tatCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATGCGTATGCAAccc > 1:2306474/1‑149 (MQ=32) atCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATGCGTATGCAAcccc > 2:579935/1‑149 (MQ=32) | CAAGCAACCGGTTAAAACCAGGACGCTCACTGGTTGCTGCTGAGCCGCTAATGTGTTCTTCGATTATTTGCTGAGGTTTGATTTTAAAACCTGCACTTTCGATTTCCCGGCGTTGATTTTCGGTGGTCTGATCCAGCGTTGATATCCGACAGTAAGCAAAAATTCGAGACATAGTGAGACTCTATACGAAATTGGTGTTCATATCATAATGCATCTCAGAAAATAATTATGATTATTTTTGTGCATATTTGTATGTACACGTTCGAAAATAAACGAATGCGTATGCAACCCCG > CP009273/1427760‑1428052 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |