| Predicted mutation | |||||||
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| JC JC | CP009273 | 2,709,656 | IS2 (–) +5 bp | 100% | coding (149‑153/384 nt) | grcA ← | autonomous glycyl radical cofactor |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP009273 | = 2709660 | 0 (0.000) | 241 (1.190) | 131/274 | NT | 100% | coding (149/384 nt) | grcA | autonomous glycyl radical cofactor |
| ? | CP009273 | 2989720 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
TCATTTATTTCCAGCGGTATAGCTGATAAATAATCCCTTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCCGCGTTCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCT > CP009273/2989574‑2989864 | tCATTTATTTCCAGCGGTATAGCTGATAAATAATCCCTTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCCGCGTTCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTg > 2:852980/1‑148 (MQ=255) cATTTATTTCCAGCGGTATAGCTGATAAATAATCCCTTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCCGCGTTCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTgg < 2:611855/148‑1 (MQ=255) atttatttCCAGCGGTATAGCTGATAAATAATCCCTTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCCGCGTTCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTGGa > 2:2277540/1‑148 (MQ=255) tttatttCCAGCGGTATAGCTGATAAATAATCCCTTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCCGCGTTCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTGTATTGGAt > 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ataaataaTCCCTTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCCGCGTTCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACAt < 1:1085667/148‑1 (MQ=255) ataaataaTCCCTTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCCGCGTTCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACAt < 1:2383670/148‑1 (MQ=255) ataatCCCTTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCCGCGTTCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGt > 1:718946/1‑148 (MQ=255) ataatCCCTTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCCGCGTTCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGt > 1:1722779/1‑148 (MQ=255) ataatCCCTTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCCGCGTGCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGt > 1:994199/1‑148 (MQ=255) 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ccAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTg < 1:1905020/148‑1 (MQ=38) ccAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTg > 2:1640941/1‑148 (MQ=38) ttGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAg > 2:1481465/1‑148 (MQ=34) ttGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAg > 1:1508787/1‑148 (MQ=34) tGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAgg > 2:3265971/1‑148 (MQ=33) tGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAgg > 1:613171/1‑148 (MQ=33) tGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAgg > 2:2518980/1‑148 (MQ=33) tGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAgg > 2:1041927/1‑148 (MQ=33) tGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAgg > 2:1524746/1‑148 (MQ=33) tGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAgg > 1:1205328/1‑148 (MQ=33) gTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGt > 2:1416098/1‑148 (MQ=32) tttATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGtt > 1:1157739/1‑148 (MQ=32) ttATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTc > 1:770219/1‑148 (MQ=31) ttATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTc > 2:2779462/1‑148 (MQ=31) tATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACCAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCt < 1:3354414/148‑1 (MQ=11) | TCATTTATTTCCAGCGGTATAGCTGATAAATAATCCCTTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCCGCGTTCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCT > CP009273/2989574‑2989864 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |