| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
GGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGAC > CP009273/2811157‑2811448 | ggaTTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTAATTATACTGATGATATGGATACCGCTAATAAAGCCCTATCGAATAAGAGATGGTGCATCCGGGATGATGACTc > 2:303591/1‑149 (MQ=11) gaTTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCg > 2:2421311/1‑149 (MQ=255) cTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTAGTATACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAGTTAAGAGAGGGTGCATCCGGGAGGATTAGTCGCCGTGCGGc > 1:1945357/1‑149 (MQ=14) tCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCt 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cTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTc < 2:3722397/149‑1 (MQ=255) cTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTc < 2:3722233/149‑1 (MQ=255) gTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTAATTCTACTGCTGATATTGATACAGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTAGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTACAGc > 2:4205391/1‑149 (MQ=255) aCTCTATCCAGCTGATCTAAGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTTATATTGATACCGATACTACAGCCATATCAATTTCGAGATGGTGCCTCCGGGTGGTTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCaa < 1:2308905/149‑1 (MQ=17) aCTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCaa < 1:3642856/149‑1 (MQ=255) 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ttcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacggatgcaaatggcggtgaggcggggattcgaaccccggatgcagcttttgaccgcatactcccttagcaggggagcgccttcagcctctcggcca > 1:3477246‑M1/1‑2 (MQ=255) ttcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactatatccagctgagctacggatgcaaatggcggtgaggcggggattcgaaccccggatgcagcttttgaccgcatactcccttagcaggggagcgccttcagcctctcggcca > 2:628207‑M1/1‑2 (MQ=255) ttACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGAc < 2:2077546/149‑1 (MQ=255) | GGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGAC > CP009273/2811157‑2811448 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |