New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 289472 | 223 (0.750) | 13 (0.040) | 11/274 | NT | 5.5% | coding (158/699 nt) | yagL | CP4‑6 prophage; DNA‑binding protein |
? | CP009273 | = 1463497 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
ATGAATCAATTGTCTGAGTAAACGTTGCTCTGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTGATTGCCAGCGATACTTTAACTGGTAAAGTAGTATTTT > CP009273/289324‑289620 | atgaATCAATTGTCTGAGTAAACGTTGCTCTGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTAc < 2:5041555/149‑1 (MQ=255) atgaATCAATTGTCTGAGTAAACGTTGCTCTGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTAc > 1:1302778/1‑149 (MQ=255) cAATTGTCTGAGTAAACGTTGCTCTGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCata < 1:3004130/149‑1 (MQ=255) aTTGTCTGAGTAAACGTTGCTCTGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATg > 1:2276363/1‑149 (MQ=255) ttGTCTGAGTAAACGTTGCTCTGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATgg < 2:4721353/149‑1 (MQ=255) gTCTGAGTAAACGTTGCTCTGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGgtg < 2:5126434/149‑1 (MQ=255) aggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGCTACTGCATATGgtg < 1:2214760‑M1/16‑1 (MQ=255) tCTGAGTAAACGTTGCTCTGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGgtgt > 1:633141/1‑149 (MQ=255) tGAGTAAACGTTGCTCTGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTaa > 2:3171402/1‑149 (MQ=255) tGAGTAAACGTTGCTCTGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTaa < 1:2572137/149‑1 (MQ=255) tAAACGTTGCTCTGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTaaaaaa > 2:2540163/1‑149 (MQ=255) aaaCGTTGCTCTGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTaaaaaaa < 1:3706143/149‑1 (MQ=255) aaaCGTTGCTCTGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTaaaaaaa < 1:102697/149‑1 (MQ=255) aaCGTTGCTCTGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAAt > 1:4965344/1‑149 (MQ=255) ctctGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCa > 1:4155025/1‑149 (MQ=255) tctGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTCAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACtagactggccccctgaatctccagacaa > 1:1169193‑M1/1‑121 (MQ=255) tctGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCAt > 2:1108722/1‑149 (MQ=255) tctGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCAt > 1:2645765/1‑149 (MQ=255) gAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTg > 1:3608957/1‑149 (MQ=255) aaaCAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGa > 1:2513607/1‑149 (MQ=255) aaaCAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGa < 2:299579/149‑1 (MQ=255) aacaacCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGAt > 2:686232/1‑149 (MQ=255) acaacCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATg < 1:4661947/149‑1 (MQ=255) acaacCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATg < 1:3136706/149‑1 (MQ=255) caacCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGAATCTGATGc > 1:4642204/1‑149 (MQ=255) acCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCAc < 1:3777905/149‑1 (MQ=255) ctctTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTc < 1:2112979/149‑1 (MQ=255) tctTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTcc < 1:1819736/149‑1 (MQ=255) ctTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCg > 2:1582303/1‑149 (MQ=255) tttAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCgg < 1:785575/149‑1 (MQ=255) tttAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCgg > 2:3716801/1‑149 (MQ=255) ttAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGgt < 2:1249243/149‑1 (MQ=255) ttAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGgt < 1:1430948/149‑1 (MQ=255) ttAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGgt < 1:1458901/149‑1 (MQ=255) ttAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGgt < 1:3677159/149‑1 (MQ=255) aaTATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGgtgt < 1:1901431/149‑1 (MQ=255) atatCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTc < 2:4155817/149‑1 (MQ=255) atatCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTc > 1:4528889/1‑149 (MQ=255) tCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATa < 1:1502296/149‑1 (MQ=255) cTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATaa > 2:460352/1‑149 (MQ=255) aCCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAat < 2:1331490/149‑1 (MQ=255) cTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAatta < 2:2276363/149‑1 (MQ=255) gCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAattatt > 2:2049062/1‑149 (MQ=255) gCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAattatt < 1:1223045/149‑1 (MQ=255) gATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTAtttttt < 2:4548230/149‑1 (MQ=255) aTCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTg > 1:4289760/1‑149 (MQ=255) cacaACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGAt < 2:2680222/149‑1 (MQ=255) acaacaTGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATa > 2:4138528/1‑149 (MQ=255) acaTGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCt < 1:1704866/149‑1 (MQ=255) tGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGaa > 2:1367557/1‑149 (MQ=255) ttCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactattttttag > 1:3798210‑M1/1‑77 (MQ=255) ttCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGaata > 1:1355533/1‑149 (MQ=255) aGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATg < 1:5142814/149‑1 (MQ=255) gTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTc > 1:1151283/1‑149 (MQ=255) aGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCAt > 1:2184863/1‑149 (MQ=255) aGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCAt > 1:3266295/1‑149 (MQ=255) gAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagagatagtcttaatactagtgtttagactagtca > 2:3526111‑M1/1‑69 (MQ=255) aaTATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCAttt < 1:3507158/149‑1 (MQ=255) tatTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTg > 1:459308/1‑149 (MQ=255) aaaTTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATa < 2:3121885/149‑1 (MQ=255) aaTTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATaa > 1:863726/1‑149 (MQ=255) aaTTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATaa < 2:4308275/149‑1 (MQ=255) ggCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAaacaa > 1:2897839/1‑149 (MQ=255) cATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAAcc > 1:20487/1‑149 (MQ=255) atatCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTTATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCa > 2:2753161/1‑149 (MQ=255) tatCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattga > 2:1903134‑M1/1‑50 (MQ=255) atCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATACGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCaaa > 2:2903191/1‑149 (MQ=255) tcAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtc < 1:1775827‑M1/149‑104 (MQ=255) aGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATag > 1:2475433/1‑149 (MQ=255) aGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATag > 1:4689699/1‑149 (MQ=255) aGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATag < 2:3220344/149‑1 (MQ=255) aGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATag > 1:4450225/1‑149 (MQ=255) gCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATaga < 2:2422552/149‑1 (MQ=255) aaGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGAATAAAAAACAACCAAAAATagaga > 2:2245571/1‑149 (MQ=255) tgagtgaTGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTg > 2:3489519/1‑149 (MQ=255) tgagtgaTGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTg > 1:2265018/1‑149 (MQ=255) tgagtgaTGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTg > 1:3294326/1‑149 (MQ=255) gagtgaTGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTGa < 2:833906/149‑1 (MQ=255) gtgaTGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTGAtt > 2:4434984/1‑149 (MQ=255) gatCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTGATTGCCAg > 1:1275029/1‑149 (MQ=255) gTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTGATTGCCAGCGATa > 2:5169622/1‑149 (MQ=255) tAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTGATTGCCAGCGATAc < 2:3951824/149‑1 (MQ=255) aaTGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTGATTGCCAGCGATACt > 2:1498037/1‑149 (MQ=255) aaTGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTGATTGCCAGCGATACt > 2:4095263/1‑149 (MQ=255) aTGCGTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTGATTGCCAGCGATACtt < 2:4963069/149‑1 (MQ=255) cTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTGATTGCCAGCGATACTTTaa > 1:3517743/1‑149 (MQ=255) ttCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTGATTGCCAGCGATACTTTAACt < 1:1527249/149‑1 (MQ=255) tGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTGATTGCCAGCGATACTTTAACTGGTa < 1:2739928/149‑1 (MQ=255) tGTTCGCTACtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacag < 2:1165226‑M1/149‑140 (MQ=255) atccaGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTGATTGCCAGCGATACTTTAACTGGTAAag < 1:4439540‑M1/144‑1 (MQ=255) gTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTGATTGCCAGCGATACTTTAACTGGTAAagt > 2:3036026/1‑149 (MQ=255) cTACTTCATATTGTGTAAAAAATTGAACGGATCTGATGCACTCCGGTGTAATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTGATTGCCAGCGATACTTTAACTGGTAAAGTAGTAt < 1:3996642/149‑1 (MQ=255) cTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTGATTGCCAGCGATACTTTAACTGGTAAAGTAGTAt < 1:3996832/149‑1 (MQ=255) cTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTGATTGCCAGCGATACTTTAACTGGTAAAGTAGTAt < 1:4864812/149‑1 (MQ=255) cTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTGATTGCCAGCGATACTTTAACTGGTAAAGTAGTAt > 1:5036670/1‑149 (MQ=255) tactatactgtccccctgaatctccagacaaccaatatctcttatattagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgttgtcttagggccgtagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaaga < 2:584555‑M1/149‑147 (MQ=255) actagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagat < 2:3315730‑M1/149‑148 (MQ=255) actagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagat < 1:2888784‑M1/149‑148 (MQ=255) actagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagat > 2:3787818‑M1/1‑2 (MQ=255) actagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagat > 2:1790966‑M1/1‑2 (MQ=255) | ATGAATCAATTGTCTGAGTAAACGTTGCTCTGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTGATTGCCAGCGATACTTTAACTGGTAAAGTAGTATTTT > CP009273/289324‑289620 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |