Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | CP009273 | 2,709,656 | IS2 (–) +5 bp | 100% | coding (149‑153/384 nt) | grcA ← | autonomous glycyl radical cofactor |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 2709656 = | 2 (0.010) | 314 (1.030) | 169/278 | NT | 99.3% | coding (153/384 nt) | grcA | autonomous glycyl radical cofactor |
? | CP009273 | = 2991050 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
* | ? | CP009273 | = 2709660 | 2 (0.010) | 310 (1.020) | 157/278 | NT | 99.3% | coding (149/384 nt) | grcA | autonomous glycyl radical cofactor |
? | CP009273 | 2989720 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
Only 100 of 676 total aligned reads displayed.
GATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAAT > CP009273/2709507‑2709805 | gatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGt > 2:2433220‑M1/149‑150 (MQ=255) gatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGt < 1:2246432‑M1/2‑1 (MQ=255) tACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGACCTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTc > 2:2639543/1‑150 (MQ=255) gATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtgga > 1:442934‑M1/1‑146 (MQ=255) aTGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggat < 1:515101‑M1/150‑6 (MQ=255) ctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttcagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGtt > 1:855943‑M1/140‑150 (MQ=255) ggTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACTTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggattt > 2:1559123‑M1/1‑143 (MQ=255) ggTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggattt < 1:4708930‑M1/150‑8 (MQ=255) ggTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggattt < 1:1603‑M1/150‑8 (MQ=255) gtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTg > 1:2357398‑M1/138‑150 (MQ=255) gTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGATCTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttg < 2:2539659‑M1/150‑9 (MQ=255) tggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCtt < 2:4988521‑M1/16‑1 (MQ=255) cTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccct > 1:4832016‑M1/1‑137 (MQ=255) cTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccct < 1:4974159‑M1/150‑14 (MQ=255) cTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccct > 1:1798162‑M1/1‑137 (MQ=255) gCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctat < 1:521465‑M1/150‑16 (MQ=255) cgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGc < 2:51995‑M1/21‑1 (MQ=255) cGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctata < 2:645445‑M1/150‑17 (MQ=255) ggATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatat > 1:3951467‑M1/1‑133 (MQ=255) tgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACt > 2:122060‑M1/123‑150 (MQ=255) ttCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagac > 2:2036117‑M1/1‑125 (MQ=255) tttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCAt > 2:3841214‑M1/119‑150 (MQ=255) ggATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCTCGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatct < 1:1078100‑M1/150‑30 (MQ=255) ggATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatct < 1:488871‑M1/150‑30 (MQ=255) ggAAGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGAAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTATGGTTTCACTTCTACTGGATCTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatct < 1:3468627‑M1/150‑30 (MQ=255) gATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctg > 2:2945318‑M1/1‑120 (MQ=255) aTGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgt > 2:3447832‑M1/1‑119 (MQ=255) aTGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgt < 2:3673864‑M1/150‑32 (MQ=255) ccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCAtcttct > 2:4028192‑M1/114‑150 (MQ=255) ttAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatc < 2:5101131‑M1/150‑36 (MQ=255) tAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGGTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatca < 2:3357542‑M1/150‑37 (MQ=255) ccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCAt > 2:688935‑M1/110‑150 (MQ=255) aCTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcact < 1:300176‑M1/150‑39 (MQ=255) aagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAAcc > 2:1640371‑M1/106‑150 (MQ=255) acatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGc < 1:2571415‑M1/48‑1 (MQ=255) tCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccc > 1:4282101‑M1/1‑106 (MQ=255) tcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCttt > 2:583209‑M1/100‑150 (MQ=255) caatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCtttt < 1:1199813‑M1/52‑1 (MQ=255) aatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTg > 2:4248959‑M1/98‑150 (MQ=255) aatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTg < 1:2025103‑M1/53‑1 (MQ=255) agagTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattaca < 2:1588354‑M1/150‑51 (MQ=255) ttCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagccc < 2:5247364‑M1/150‑56 (MQ=255) gttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATg > 2:1729380‑M1/90‑150 (MQ=255) ccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAAcg < 1:3141049‑M1/66‑1 (MQ=255) ccaatgactagtctaaaaacgagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtcgggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAAcg > 2:4911162‑M1/85‑150 (MQ=255) caatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAAcgc < 1:2913312‑M1/67‑1 (MQ=255) gactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCtt < 1:597027‑M1/71‑1 (MQ=255) actagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTc > 1:3077304‑M1/79‑150 (MQ=255) actagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTc < 2:407525‑M1/72‑1 (MQ=255) ctagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCg < 1:3248345‑M1/73‑1 (MQ=255) acgttaacgttCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagata > 2:1930444‑M1/1‑82 (MQ=255) ttaacgttCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattc < 1:3194982‑M1/150‑72 (MQ=255) aacgttCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattccc > 2:2721192‑M1/1‑77 (MQ=255) gttCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtg < 2:4699708‑M1/150‑77 (MQ=255) cAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcg > 2:535283‑M1/1‑71 (MQ=255) actagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCt < 2:3260042‑M1/84‑1 (MQ=255) tagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGt < 2:3498929‑M1/86‑1 (MQ=255) gtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTcc < 1:381500‑M1/88‑1 (MQ=255) tattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCTACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCca > 2:783480‑M1/62‑150 (MQ=255) tattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCca > 2:4546263‑M1/62‑150 (MQ=255) attaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCcag < 2:4885637‑M1/90‑1 (MQ=255) taagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCcagca < 2:3111872‑M1/92‑1 (MQ=255) ccaccTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccatatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacc < 1:5036519‑M1/150‑90 (MQ=255) gactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGcc < 1:773013‑M1/95‑1 (MQ=255) actatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCa < 2:3179932‑M1/96‑1 (MQ=255) tatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGa < 1:1026808‑M1/98‑1 (MQ=255) tatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGa < 1:4510930‑M1/98‑1 (MQ=255) cTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagc < 2:438961‑M1/150‑94 (MQ=255) cTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagc < 1:1500291‑M1/150‑94 (MQ=255) atcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGaa < 1:3644891‑M1/99‑1 (MQ=255) cttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAagag < 2:3884096‑M1/103‑1 (MQ=255) ttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGt > 2:3025386‑M1/47‑150 (MQ=255) ttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGt > 1:2427124‑M1/47‑150 (MQ=255) ttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGt > 1:3548350‑M1/47‑150 (MQ=255) tatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGtt > 1:4095071‑M1/46‑150 (MQ=255) gAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgc > 1:5302560‑M1/1‑48 (MQ=255) gAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgc > 1:2718747‑M1/1‑48 (MQ=255) gAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccataacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgc > 2:1431370‑M1/1‑48 (MQ=255) taagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTcagc < 2:1088305‑M1/109‑1 (MQ=255) cTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcgga < 1:3367397‑M1/150‑106 (MQ=255) aagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTcagca < 1:1689664‑M1/110‑1 (MQ=255) agtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTcagcag > 2:2165018‑M1/40‑150 (MQ=255) tgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGAt > 2:3548818‑M1/38‑150 (MQ=255) ggTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgcca < 1:4182742‑M1/150‑111 (MQ=255) attggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGAtcgtc > 2:4159035‑M1/34‑150 (MQ=255) gttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTa > 2:2310047‑M1/30‑150 (MQ=255) aCTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgtt < 2:1035652‑M1/150‑117 (MQ=255) aCTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccagtcgtt < 2:4787262‑M1/150‑117 (MQ=255) tggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCt < 1:1410732‑M1/127‑1 (MQ=255) aCTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatg > 2:867999‑M1/1‑28 (MQ=255) gagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCttt > 1:1334575‑M1/22‑150 (MQ=255) gAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcg > 1:2297742‑M1/1‑24 (MQ=255) gAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcg < 2:2892488‑M1/150‑127 (MQ=255) aaCTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcga > 1:4588203‑M1/1‑23 (MQ=255) ttCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacg > 2:1346963‑M1/1‑20 (MQ=255) ttCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacg < 1:2158066‑M1/150‑131 (MQ=255) aCGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcct < 2:3321230‑M1/150‑134 (MQ=255) aCGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcct > 1:1926935‑M1/1‑17 (MQ=255) agtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTT‑CGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCt < 2:972296‑M1/144‑1 (MQ=255) gTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAAt < 2:3777131/150‑1 (MQ=255) | GATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAAT > CP009273/2709507‑2709805 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |