| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | NZ_CP009273 | 2,650,276 | (CTTCAC)1→2 | coding (167/336 nt) | fdx ← | ISC system 2Fe‑2S type ferredoxin |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NZ_CP009273 | = 2650268 | 0 (0.000) | 102 (1.030) +ACCTTC |
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| ? | NZ_CP009273 | 2650269 = | 0 (0.000) | coding (174/336 nt) | fdx | ISC system 2Fe‑2S type ferredoxin | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
TTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATACTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_CP009273/2650020‑2650268‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTCACAGGCGTGTTCAATCTCGATACCGTTACGCAGAGCTGCGTCGAGAATGGTTTCACCGCTATTAGCTTCCAGAACAGCGCCATCAGGGCAGAGATCCTGATGAGGCAAAATAACAATCTTTGGCATATTAAACCTCGTCCACGGAATGGCCTTTCAGCGCACGACGAACCGACTGGTCCATGCGGCGAGCGGCGAAATCC > NZ_CP009273/2650269‑2650516 |||||| TTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATACTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAA > 1:916532/1‑250 CGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATACTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCGGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCT < 2:238880/249‑1 GGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATACTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTTTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTC < 2:768263/250‑1 GGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATACTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTC < 2:471906/250‑1 ATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATACTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACCTTCAC > 1:677070/1‑250 ATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATACTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACCTTCAC > 2:78539/1‑250 gCGGGATACGCATCGTACGGTGCTTCGCCAATGTCGCGGCTATCGGTCCTCGTAAGTCCCATACTAACCTCTGTTAATGCGCACTCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACCTTCACG < 2:326307/249‑1 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CGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTCACAGGCGTGTTCAATCTCGATACCGTTACGCAGAGCTGCGTCGAGAATGGTTTCACCGCTATTAGCTTCCAGAACAGCGCCATCAGGGCAGAGATCCTGATGAGGCAAAATAACAATCT < 2:269193/250‑1 TTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTCACAGGCGCGTTTAATCCCGGTACCGTTACGCAGAGCTGCGTCGAGAAAGGTTTCACCGCTATTAGACTCCCGAACAACTCCCTCACGGCAGAGCTCCCGTTGAGGCCAAATAAAAACCTTTGG > 2:503408/1‑250 CGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTCACAGGCGTGTTCAATCTCGATACCGTTACGCAGAGCTGCGTCGAGAATGGTTTCACCGCTATTAGCTTCCAGAACAGCGCCATCAGGGCAGAGATCCTGATGAGGCAAAATAACAATCTTTGGCATA < 1:320602/250‑1 AGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTCACAGGCGTGTTCAATCTCGATACCGTTACGCAGAGCTGCGTCGAGAATGGTCTCACCGCTATTAGCTTCCAGAACAGCGCCATCAGGGCAGAGATCCTGATGAGGCAAAATAACAATCTTTGGCATATTAAACC > 1:776821/1‑250 AGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGCGGGGCAAGCACAGGATTTTTCACAGGCGTGTTCAATCTCGATACCGTTAAGCAGAGCTGCGTCGAGGATGGGTTTCCCGCTATTAGCCTCCAGAACAGCGCCAACCGGGCAGCGAATCTGATTACGCCAAATAACCATCTTTGGCCTATTAAACC > 2:354816/1‑250 CCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTCACAGGCGTGTTCAATCTCGATACCGTTACGCAGAGCTGCGTCGAGAATGGTTTCACCGCTATTAGCTTCCAGAACAGCGCCATCAGGGCAGAGATCCTGATGAGGCAAAATAACAATCTTTTGCATATTAAACCTCGT > 1:321823/1‑250 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TGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTCACAGGCGTGTTCAATCTCGATACCGTTACGCAGGGCTGCGTCGAGAATGGGTTCACCGCTATTAGCTTCCCGAACAGCGCCATCAGGGCAGAGGTCCTGATGAGGCAAAATAACAATCTTTGGCATATTAAACCTCGTCCACGGGATGGCCTTTCAGCGCACGACG > 2:935549/1‑249 CTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTCACAGGCGTGTTCAATCTCGATACCGTTACGCAGAGCTGCGTCGAGAATGGTTTCACCGCTATTAGCTTCCAGAACAGCGCCATCAGGGCAGAGATCCTGATGAGGCAAAATAACAATCTTTGGCATATTAAACCTCGTCCACGGAATGGCCTTTCAGCGCACGACGAAC < 1:782651/250‑1 TTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTCACAGGCGTGTTCAATCTCGATACCGTTATGCAGAGCTGCGTCGAGAATGGTTTTACCGCTATTAGCTTCCAGAACAGCGCCATCAGGGCAGAGATCCTGATGAGGCAAAATAACAATCTTTGGCATATTTAACCTCGTCCACGGAAAGGCCTTTCAGCGCACGAAGAACCGACCGGTC > 2:409980/1‑250 TCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTCACAGGCGTGTTCAATCTCGATACCGTTACGCAGAGCTGCGTCGAGAATGGTTTCACCGCTATTAGCTTCCAGAACAGCGCCATCAGGGCAGAGATCCTGATGAGGCAAAATAACAATCTTTGGCATATTAAACCTCGTCCACGGAATGGCCTTTCAGCGCACGACGAACCGACTGGTC < 2:668232/249‑1 CGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTCACAGGCGTGTTCAATCTCGATACCGTTACGCAGAGCTGCGTCGAGAATGGTTTCACCGCTATTAGCTTCCAGAACAGCGCCATCAGGGCAGAGATCCTGATGAGGCAAAATAACAATCTTTGGCATATTAAACCTCGTCCACGGAATGGCCTTTCAGCGCACGACGAACCGACTGGTCCAT < 2:60958/250‑1 GTGAGTCAAAACCTTCACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTCACAGGCGTGTTCAATCTCGATACCGTTACGCAGAGCTGCGTCGAGAATGGTTTCACCGCTATTAGCTTCCAGAACAGCGCCATCAGGGCAGAGATCCTGATGAGGCAAAATAACAATCTTTGGCATATTAAACCTCGTCCACGGAATGGCCTTTCAGCGCACGACGAACCGACTGGTCCATGCGGC < 1:910463/250‑1 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CCTTCACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTCACAGGCGTGTTCAATCTCGATACCGTTACGCAGAGCTGCGTCGAGAATGGTTTCACCGCTATTAGCTTCCAGAACAGCGCCATCAGGGCAGAGATCCTGATGAGGCAAAATAACAATCTTTGGCATATTAAACCTCGTCCACGGAATGGCCTTTCAGCGCACGACGAACCGACTGGTCCATGCGGCGAGCGGCGAAA < 2:59559/250‑1 CTTCACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTCACAGGCGTGTTCAATCTCGATACCGTTACGCAGAGCTGCGTCGAGAATGGTTTCACCGCTATTAGCTTCCAGAACAGCGCCATCAGGGCAGAGATCCTGATGAGGCAAAATAACAATCTTTGGCATATTAAACCTCGTCCACGGAATGGCCTTTCAGCGCACGACGAACCGACTGGTCCATGCGGCGAGCGGGGGAAT > 2:148016/1‑250 CACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTCACAGGCGTGTTCAATCTCGATACCGTTACGCAGAGCTGCGTCGAGAATGGTTTCACCGCTATTAGCTTCCAGAACAGCGCCATCAGGGCAGAGATCCTGATGAGGCAAAATAACAATCTTTGGCATATTAAACCTCGTCCACGGAATGGCCTTTCAGCGCACGACGAACCGACTGGTCCATGCGGCGAGCGGCGAAATCC < 2:378934/249‑1 |||||| TTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATACTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_CP009273/2650020‑2650268‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTCACAGGCGTGTTCAATCTCGATACCGTTACGCAGAGCTGCGTCGAGAATGGTTTCACCGCTATTAGCTTCCAGAACAGCGCCATCAGGGCAGAGATCCTGATGAGGCAAAATAACAATCTTTGGCATATTAAACCTCGTCCACGGAATGGCCTTTCAGCGCACGACGAACCGACTGGTCCATGCGGCGAGCGGCGAAATCC > NZ_CP009273/2650269‑2650516 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |