| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | NZ_CP009273 | 2,650,276 | (CTTCAC)1→2 | coding (167/336 nt) | fdx ← | ISC system 2Fe‑2S type ferredoxin |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NZ_CP009273 | = 2650268 | 0 (0.000) | 102 (1.030) +ACCTTC |
95/468 | 0.1 | 100% | coding (175/336 nt) | fdx | ISC system 2Fe‑2S type ferredoxin |
| ? | NZ_CP009273 | 2650269 = | 0 (0.000) | coding (174/336 nt) | fdx | ISC system 2Fe‑2S type ferredoxin | |||||
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ATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATACTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTCACAGGCGTGTTCAATCTCGATACCGTTACGCAGAGCTGCGTCGAGAATGGTTTCACCGCTATTAGCTTCCAGAACAGCGCCATCAGGGCAGAGATCCTGATGAGGCAAAATAACAATCTTTGGCATATTAAACCTCGTCCACGGAATGGCCTTTCAGCGCACGACGAACCGACTGGTCCATGCGGCGAGCGGCGAAATCCTG > NZ_CP009273/2650027‑2650518 | atcgggatacgcatcgtacagtgcttcgccaatttcgcggctatcggtccacttaagtcccatactaacctctgttaatgctcacgcgcatggttgatagtgtaacgcgggatttcgactactaaatcttcgtcggtaacgcgcgcctggcagcttaaacggctttccggctccagtccccaggctttgtccagcatgtcgtcttcctgctctgagctttccggcagtgagtcaaaaccttcaccttcac > 2:78539‑M2/243‑250 (MQ=255) gcgggatacgcatcgtacggtgcttcgccaatgtcgcggctatcggtcctcgtaagtcccatactaacctctgttaatgcgcactcgcatggttgatagtgtaacgcgggatttcgactactaaatcttcgtcggtaacgcgcgcctggcagcttaaacggctttccggctccagtccccaggctttgtccagcatgtcgtcttcctgctctgagctttccggcagtgagtcaaaaccttcACCTTCacg < 2:326307‑M2/9‑1 (MQ=255) atacgcatcgtacagtgcttcgccaatttcgcggctatcggtccacttaagtcccatactaacctctgttaatgctcacgcgcatggttgatagtgtaacgcgggatttcgactactaaatcttcgtcggtaacgcgcgcctggcagcttaaacggctttccggctccagtccccaggctttgtccagcatgtcgtcttcctgctctgagctttccggcagtgagtcaaaaccttcACCTTCacgaacga > 1:114341‑M2/237‑250 (MQ=255) atacgcatcgtacagtgcttcgccaatttcgcggctatcggtccacttaagtcccatactaacctctgttaatgctcacgcgcatggttgatagtgtaacgcgggatttcgactactaaatcttcgtcggtaacgcgcgcctggcagcttaaacggctttccggctccagtccccaggctttgtccagcatgtcgtcttcctgctctgagctttccggcagtgagtcaaaaccttcACCTTCacgaacga > 1:378934‑M2/237‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |