| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | 234703 = | NA (NA) | 476 (1.000) +CGGAGGTCTTTTCT |
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| ? | CP043523 | = 1998587 | 550 (1.050) | intergenic (‑79/‑166) | FTN78_chr2059/FTN78_chr2060 | Mobile element protein/Sulfate permease | |||||
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CTACTCAAGAAATATTTAAATACATTGAGACCTATTACAATACAAAAAGGATGCATTCAGGTCTTGATTACAAGTCTCCAAAAGACTTTGAAAAATATAATTCTTAAATTCTCTTAACTCCGTGTCTAGTTTTTCGTTGACTTTCCATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP043523/234851‑234703‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTCAATAGAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTATGAAGCTGTGGCAAGAA < CP043523/1998587‑1998439 |||||||||||||| TACTCAAGAAATATTTAAATACATTGAGACCTATTACAATACAAAAAGGATGCATTCAGGTCTTGATTACAAGTCTCCAAAAGACTTTGAAAAATATAATTCTTAAATTCTCTTAACTCCGTGTCTAGTTTTTCGTTGACTTTCCATTCG > 1:3157290/1‑150 TACTCAAGAAATATTTAAATACATTGAGACCTATTACAATACAAAAAGGATGCATTCAGGTCTTGATTACAAGTCTCCAAAAGACTTTGAAAAATATAATTCTTAAATTCTCTTAACTCCGTGTCTAGTTTTTCGTTGACTTTCCATTCG > 1:891348/1‑150 ACTCAAGAAATATTTAAATACATTGAGACCTATTACAATACAAAAAGGATGCATTCAGGTCTTGATTACAAGTCTCCAAAAGACTTTGAAAAATATAATTCTTAAATTCTCTTAACTCCGTGTCTAGTTTTTCGTTGACTTTCCATTCGG > 1:1738311/1‑150 CAAGAAATATTTAAATACATTGAGACCTATTACAATACAAAAAGGATGCATTCAGGTCTTGATTACAAGTCTCCAAAAGACTTTGAAAAATATAATTCTTAAATTCTCTTAACTCCGTGTCTAGTTTTTCGTTGACTTTCCATTCGGAGG < 1:4505454/150‑1 GAAATATTTAAATACATTGAGACCTATTACAATACAAAAAGGATGCATTCAGGTCTTGATTACAAGTCTCCAAAAGACTTTGAAAAATATAATTCTTAAATTCTCTTAACTCCGTGTCTAGTTTTTCGTTGACTTTCCATTCGGAGGTCT > 1:2397169/1‑150 AATATTTACATACATTGAGACCTATTACAATACAAAAAGGATGCATTCAGGTCTTGATTACAAGTCTCCAAAAGACTTTGAAAAATATAATTCTTAAATTCTCTTAACTCCGTGTCTAGTTTTTCGTTGACTTTCTATTCGGAGGTCTTT > 2:3152407/1‑150 AATATTTAAATACATTGAGACCTATTACAATACAAAAAGGATGCATTCAGGTCTTGATTACAAGTCTCCAAAAGACTTTGAAAAATATAATTCTTAAATTCTCTTAACTCCGTGTCTAGTTTTTCGTTGACTTTCCATTCGGAGGTCTTT > 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2:3339202/150‑1 AAGGATGCATTCAGGTCTTGATTACAAGTCTCCAAAAGACTTTGAAAAATATAATTCTTAAATTCTCTTAACTCCGTGTCTAGTTTTTCGTTGACTTTCCATTCGGAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGC < 1:2825482/150‑1 GGATGCATTCAGGTCTTGATTACAAGTCTCCAAAAGACTTTGAAAAATATAATTCTTAAATTCTCTTAACTCCGTGTCTAGTTTTTCGTTGACTTTCCATTCGGAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAG < 2:3443442/150‑1 GATGCATTCAGGTCTTGATTACAAGTCTCCAAAAGACTTTGAAAAATATAATTCTTAAATTCTCTTAACTCCGTGTCTAGTTTTTTGTTTACTTTCCATTCGGAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGA > 2:3412456/1‑150 GCATTCAGGTCTTGATTACAAGTCTCCAAAAGACTTTGAAAAATATAATTCTTAAATTCTCTTAACTCCGTGTCTAGTTTTTCGTTGACTTTCCATTCGGAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGG > 1:1126127/1‑150 GCATTCAGGTCTTGATTACAAGTCTCCAAAAGACTTTGAAAAATATAATTCTTAAATTCTCTTAACTCCGTGTCTAGTTTTTCGTTGACTTTCCATTCGGAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGG > 2:616814/1‑150 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CTTTCCATTCGGAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTA < 1:3996368/150‑1 CTTTCCATTCGGAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTA < 2:1706257/150‑1 CCATTCGGAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGT < 1:4116375/150‑1 CATTCGGAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTA < 1:1068840/150‑1 CATTCGGAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTA > 1:2580481/1‑150 ATTCGGAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTAT > 2:1939851/1‑150 GGAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTATGAAG < 2:2932089/150‑1 AGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTATGAAGCT < 1:2088054/150‑1 TCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTATGAAGCTGTG < 2:693951/150‑1 TTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTATGAAGCTGTGGC < 2:1015727/150‑1 TTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTATGAAGCTGTGGCA > 1:297539/1‑150 |||||||||||||| CTACTCAAGAAATATTTAAATACATTGAGACCTATTACAATACAAAAAGGATGCATTCAGGTCTTGATTACAAGTCTCCAAAAGACTTTGAAAAATATAATTCTTAAATTCTCTTAACTCCGTGTCTAGTTTTTCGTTGACTTTCCATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP043523/234851‑234703‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTCAATAGAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTATGAAGCTGTGGCAAGAA < CP043523/1998587‑1998439 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |