| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | 234703 = | NA (NA) | 476 (1.000) +CGGAGGTCTTTTCT |
200/270 | 0.2 | 48.9% | intergenic (+77/+42) | FTN78_chr0290/FTN78_chr0291 | Transcription elongation factor GreA/Mobile element protein |
| ? | CP043523 | = 1998587 | 550 (1.050) | intergenic (‑79/‑166) | FTN78_chr2059/FTN78_chr2060 | Mobile element protein/Sulfate permease | |||||
Only 100 of 460 total aligned reads displayed.
AAAAGTTGGAGACATCGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATGTATTTAAATATTTCTTGAGTAGC > CP043523/234554‑234852 | aaaGTTGGAGACATCGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGaaa > 1:193825/1‑150 (MQ=255) gTTGGAGACATCGTAAATGTACCACTTGCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATgg > 2:755164/1‑150 (MQ=255) tGGAGACATCGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGaa < 2:159505/150‑1 (MQ=255) gaCATCGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTc > 1:1598365/1‑150 (MQ=255) gaCATCGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTc > 1:932775/1‑150 (MQ=255) aCATCGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCa < 2:1913362/150‑1 (MQ=255) cATCGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCaa > 1:1764764/1‑150 (MQ=255) aTCGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAAc < 1:3589008/150‑1 (MQ=255) tCGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACg < 2:4472712/150‑1 (MQ=255) cGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGa > 1:994027/1‑150 (MQ=255) gTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGaa > 1:201830/1‑150 (MQ=255) gTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTa > 1:4094989/1‑150 (MQ=255) cACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGaca < 1:864034/150‑1 (MQ=255) aCTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGacac < 1:3019357/150‑1 (MQ=255) aCTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGacac < 1:1354776/150‑1 (MQ=255) cTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACg < 1:3344531/150‑1 (MQ=255) cTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACg < 2:3138763/150‑1 (MQ=255) ttCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACgg < 1:882040/150‑1 (MQ=255) cAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGt < 1:4015553/150‑1 (MQ=255) aGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGtt > 2:2370415/1‑150 (MQ=255) ttGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTaa < 1:2677501/150‑1 (MQ=255) tGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGAATAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAag < 1:4397663/150‑1 (MQ=255) gCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAagag > 2:397322/1‑150 (MQ=255) gAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGaa < 2:4215163/150‑1 (MQ=255) aTGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAAttt < 1:2491315/150‑1 (MQ=255) tGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTa < 2:2472092/150‑1 (MQ=255) aCAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAg < 1:1182820/150‑1 (MQ=255) cAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGa > 1:1302319/1‑150 (MQ=255) aGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAATTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGaa < 2:3580232/150‑1 (MQ=255) ttAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAAtt > 1:2174885/1‑150 (MQ=255) aaaaTTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATtat < 2:3731408/150‑1 (MQ=255) aaTTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTatat > 1:3831864/1‑150 (MQ=255) aaTTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTatat < 1:375591/150‑1 (MQ=255) ttGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATAttt > 2:94517/1‑150 (MQ=255) gTAAAAATTGAGTAATTCATTTAGAATATAACAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATATGCACACAAAAAGTTAGACTTTTGATCCAAGTAGAAATGGAAAAAAAAAAAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATAttttt < 2:749664/150‑1 (MQ=18) tAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTc < 2:3370920/150‑1 (MQ=255) tAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTc > 2:3211432/1‑150 (MQ=255) aaGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCaaa < 1:3157973/150‑1 (MQ=255) gTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGt < 1:2096694/150‑1 (MQ=255) gTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGt < 1:1482800/150‑1 (MQ=255) gTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTGAGACTGTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATATTTCAAAGt < 2:1720999/150‑1 (MQ=255) ttGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTc > 2:2749958/1‑150 (MQ=255) aCTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCttt > 1:2603989/1‑150 (MQ=255) cTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCaa < 2:53899/142‑1 (MQ=255) cTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCaa > 1:56462/1‑142 (MQ=255) tAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTg > 1:4470393/1‑150 (MQ=255) aaTTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTgg < 2:1991656/150‑1 (MQ=255) aaTTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTgg > 1:3648804/1‑150 (MQ=255) aaTTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTgg < 2:3240783/150‑1 (MQ=255) attattTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGga < 1:3519020/150‑1 (MQ=255) ttattTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGgag < 2:1385808/150‑1 (MQ=255) tattTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGgaga < 2:2246227/150‑1 (MQ=255) ttttAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACt > 1:1015751/1‑150 (MQ=255) ttAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTg > 1:2330633/1‑150 (MQ=255) tAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGt < 2:3914932/150‑1 (MQ=255) aGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTa > 2:2604404/1‑150 (MQ=255) gAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTaa > 2:1517793/1‑150 (MQ=255) aaTATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAAt > 2:4091686/1‑150 (MQ=255) atatAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATc < 2:3646110/150‑1 (MQ=255) atatAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATc > 1:4594366/1‑150 (MQ=255) ataataAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCaa > 2:523409/1‑150 (MQ=255) taataaGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAg < 1:4349878/150‑1 (MQ=255) ataaGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGAc > 2:1173383/1‑150 (MQ=255) aGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTg > 1:623495/1‑150 (MQ=255) gTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGa < 2:909966/150‑1 (MQ=255) aaaaaaGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTATTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAAt < 2:2925577/150‑1 (MQ=255) aaaaaGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATg > 1:3402183/1‑150 (MQ=255) aaGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCAt < 2:205299/150‑1 (MQ=255) atccGTCAGTTTATGTGCTCACCAAAAGTTAGACTTTTTATACAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTCGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTGGTAATCAAGACCTGAATGCATc < 1:4126632/148‑1 (MQ=14) cGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCtt > 2:4553108/1‑150 (MQ=255) aTGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTttgtattg > 1:537039/1‑150 (MQ=37) aTGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTttgtattg < 2:866135/150‑1 (MQ=37) tgtgCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGTCTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTttgtattgt < 1:2772795/150‑1 (MQ=37) tgCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTaa > 2:4315696/1‑150 (MQ=37) aCCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAg < 1:4213279/150‑1 (MQ=35) aCCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAg > 2:1776528/1‑150 (MQ=37) cccAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGt < 1:3065974/150‑1 (MQ=37) cccAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGt > 1:985184/1‑150 (MQ=37) ccAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGtc > 1:819217/1‑150 (MQ=37) cAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGtct < 2:3077235/150‑1 (MQ=37) aaaaGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGtctc < 2:1811767/150‑1 (MQ=37) aaGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCaa > 1:2410674/1‑150 (MQ=37) gTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATg < 1:1097159/150‑1 (MQ=37) gTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATg < 2:2813740/150‑1 (MQ=35) gTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATg > 1:2982108/1‑150 (MQ=37) ttAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATGt > 2:2696447/1‑150 (MQ=37) gACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATGTAtt < 2:2111814/150‑1 (MQ=35) aCTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATGTAttt > 1:706562/1‑150 (MQ=37) aCTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAAAAAAAAAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATGTAttt < 2:3459442/150‑1 (MQ=11) cTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATGTATTTa > 1:2071911/1‑150 (MQ=37) ttttATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATGTATTTaaa < 1:1737688/150‑1 (MQ=37) tttATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATGTATTTAAat > 1:2298586/1‑150 (MQ=35) ttATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATGTATTTAAata > 2:4580074/1‑150 (MQ=37) tATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATGTATTTAAatat < 1:1852967/150‑1 (MQ=35) aTCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATGTATTTAAATAtt > 1:3361803/1‑150 (MQ=37) cAAGTAGAAATGGAAAGCCAACGAAAAACTAGCCACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATGTATTTAAATATTTCt < 1:3210216/150‑1 (MQ=25) aaGTAGAAATCGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATGTATTTAAATATTTCtt > 2:615715/1‑150 (MQ=25) aGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACGTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATGTATTTAAATATTTCTTGAGt > 1:3888789/1‑150 (MQ=17) aaaTGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATGTATTTAAATATTTCTTGAGTan < 2:2998950/150‑2 (MQ=14) aaTGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATGTATTTAAATATTTCTTGAGTAGc < 2:1257076/150‑1 (MQ=11) | AAAAGTTGGAGACATCGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATGTATTTAAATATTTCTTGAGTAGC > CP043523/234554‑234852 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |