New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP043523 | = 849146 | NA (NA) | 506 (0.970) | 195/298 | 1.2 | 50.8% | coding (622/624 nt) | FTN78_chr0901 | hypothetical protein |
? | CP043523 | 2058604 = | 489 (0.930) | intergenic (+38/‑88) | FTN78_chr2131/FTN78_chr2132 | SAM‑dependent methyltransferase, MraW methylase family/Putative sugar uptake protein |
Only 100 of 506 total aligned reads displayed.
CGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP043523/848998‑849146 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATCTCTTGTTTTTTCCAAAAAAAAGAGTAAAATAGAGAAATGCTTATTTTTTTAAGTAAAAAAATATTTTAAAGAGGTAAATATACACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTTCTATCGGATTTGTAG > CP043523/2058604‑2058752 CGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAA < 1:194533/150‑1 CGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTAAGTGGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAA > 2:4204572/1‑150 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1:1987085/150‑1 TAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTT < 2:909036/150‑1 GACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTT < 1:351449/150‑1 GACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTT > 1:3918710/1‑150 CAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTT > 2:3362097/1‑150 AGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTC < 1:4011026/150‑1 GCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCC > 1:3265819/1‑150 GCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCC < 2:2426325/150‑1 CTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCc < 2:1504655/150‑2 TGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCcg > 1:2187449/1‑148 TGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCcg < 2:208561/150‑3 GGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCcgaa > 2:3057098/1‑146 ACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAA < 2:2525987/150‑1 CGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAG > 1:2535709/1‑150 TTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTA < 1:623872/150‑1 ACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAAta > 2:645448/1‑148 CCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATAT < 2:1806519/150‑1 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1:2290311/1‑148 ATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAAATATACAATAGTTACTCTAAGATTTAATGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATAT > 2:1292224/1‑150 AGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGt > 2:319258/1‑149 AAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTT < 1:3823177/150‑1 GGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAa > 2:589388/1‑149 GGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAa < 1:2804549/150‑2 GGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAa > 2:3894213/1‑149 GCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAat < 1:1494156/150‑3 GCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTAAAACAAAAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAat < 2:2795274/150‑3 CGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACGATAGTTACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATT < 2:4176005/150‑1 GATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTT > 1:2035613/1‑150 GGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTCTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATCTTTAATTTTTTAAG > 1:3873784/1‑150 GTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGT < 1:1724566/150‑1 TCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAA < 2:2867187/150‑1 TTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAA < 1:2707000/150‑1 TTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAA > 1:3381463/1‑150 AAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAAtt > 1:1453552/1‑148 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1:125836/150‑1 AAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGG > 1:1409029/1‑150 AGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGG < 1:3146820/150‑1 GATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGG > 2:4055386/1‑150 TTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGTAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTT < 2:1963320/150‑1 TTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTT < 2:3507492/150‑1 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2:2904791/150‑1 TAACATCAATCTTTTGTTTTTTCACGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTTCTATCGGA < 2:801919/150‑1 ACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTTCTATCGGATT > 1:4101654/1‑150 ACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTTCTATCGGATT < 2:2187529/150‑1 CAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTTCTATCGGATTTGTA > 1:746388/1‑150 CGTATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP043523/848998‑849146 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATCTCTTGTTTTTTCCAAAAAAAAGAGTAAAATAGAGAAATGCTTATTTTTTTAAGTAAAAAAATATTTTAAAGAGGTAAATATACACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTTCTATCGGATTTGTAG > CP043523/2058604‑2058752 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |