New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP043523 | = 849146 | NA (NA) | 506 (0.970) | 195/298 | 1.2 | 50.8% | coding (622/624 nt) | FTN78_chr0901 | hypothetical protein |
? | CP043523 | 2058604 = | 489 (0.930) | intergenic (+38/‑88) | FTN78_chr2131/FTN78_chr2132 | SAM‑dependent methyltransferase, MraW methylase family/Putative sugar uptake protein |
Only 100 of 1009 total aligned reads displayed.
TATTAAGTGGACTTCTAGTTTGCCACAAAAAGACTGGGAAGTGACTTCTTATGCACCTCTTAACCAAATTCATACGCCGCCAATTTTAGTTCTAATCGAAAAAAGAAAATAAATTTACTTGAATAGTTATGAATCTTATGTATTCTTTTATCTCTTGTTTTTTCCAAAAAAAAGAGTAAAATAGAGAAATGCTTATTTTTTTAAGTAAAAAAATATTTTAAAGAGGTAAATATACACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTTCTATCGGATTTGTAGC > CP043523/2058455‑2058753 | gtattctttagacagctgggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgttttttcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcaAt > 1:3434697‑M2/149‑150 (MQ=255) gtattctttagacagctgggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgttttttcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcaAt < 1:4013305‑M2/2‑1 (MQ=255) gtattctttagacagctgggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgttttttcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcaAt > 2:1593978‑M2/149‑150 (MQ=255) 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acatcaATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTTCTATCGGAtt > 1:4101654‑M2/7‑150 (MQ=255) tATCTCTTGTTTTTTCCAAAAAAAAGAGTAAAATAGAGAAATGCTTATTTTTTTAAGTAAAAAAATATTTTAAAGAGGTAAATATACACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTTCTATCGGATTTGTAg < 2:427144/150‑1 (MQ=255) | TATTAAGTGGACTTCTAGTTTGCCACAAAAAGACTGGGAAGTGACTTCTTATGCACCTCTTAACCAAATTCATACGCCGCCAATTTTAGTTCTAATCGAAAAAAGAAAATAAATTTACTTGAATAGTTATGAATCTTATGTATTCTTTTATCTCTTGTTTTTTCCAAAAAAAAGAGTAAAATAGAGAAATGCTTATTTTTTTAAGTAAAAAAATATTTTAAAGAGGTAAATATACACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTTCTATCGGATTTGTAGC > CP043523/2058455‑2058753 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |